RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409212.5

SH3BP4-203, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,231 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-203ENST00000409212 SPATA8Q6RVD6 105 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP4-203ENST00000409212 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
SH3BP4-203ENST00000409212 ZZEF1O43149 2961 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-203ENST00000409212 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-203ENST00000409212 SZT2Q5T011 3432 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-203ENST00000409212 CELSR2Q9HCU4 2923 aa8.91□□□□□ -0.98
SH3BP4-203ENST00000409212 PLAC4Q8WY50 150 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP4-203ENST00000409212 VCANP13611 3396 aa8.86□□□□□ -0.99
SH3BP4-203ENST00000409212 ZANQ9Y493 2812 aa8.82□□□□□ -1
SH3BP4-203ENST00000409212 EYSQ5T1H1 3165 aa8.81□□□□□ -1
SH3BP4-203ENST00000409212 DCHS2Q6V1P9 2916 aa8.8□□□□□ -1
SH3BP4-203ENST00000409212 A8MUU9 505 aa8.79□□□□□ -1
SH3BP4-203ENST00000409212 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa8.78□□□□□ -1
SH3BP4-203ENST00000409212 A0A0A0MQY5 61 aa8.78□□□□□ -1
SH3BP4-203ENST00000409212 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-203ENST00000409212 COL6A3P12111 3177 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-203ENST00000409212 A8MU10 97 aa8.71□□□□□ -1.01
SH3BP4-203ENST00000409212 A6NN06 94 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-203ENST00000409212 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
SH3BP4-203ENST00000409212 DNAH14Q0VDD8 3507 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-203ENST00000409212 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
SH3BP4-203ENST00000409212 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP4-203ENST00000409212 TENM3Q9P273 2699 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP4-203ENST00000409212 NF1P21359 2839 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-203ENST00000409212 DMXL1Q9Y485 3027 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP4-203ENST00000409212 FBN2P35556 2912 aa8.54□□□□□ -1.04
SH3BP4-203ENST00000409212 XP32Q5T750 250 aa8.53□□□□□ -1.04
SH3BP4-203ENST00000409212 TENM1Q9UKZ4 2725 aa8.52□□□□□ -1.05
SH3BP4-203ENST00000409212 TNP1P09430 55 aa8.45□□□□□ -1.06
SH3BP4-203ENST00000409212 USP34Q70CQ2 3546 aa8.44□□□□□ -1.06
SH3BP4-203ENST00000409212 TPRXLQ17RH7 258 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP4-203ENST00000409212 MXRA5Q9NR99 2828 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-203ENST00000409212 TENM2Q9NT68 2774 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-203ENST00000409212 SPEGQ15772 3267 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP4-203ENST00000409212 LOC400499M0QZD8 3231 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP4-203ENST00000409212 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
SH3BP4-203ENST00000409212 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa8.3□□□□□ -1.08
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-203ENST00000409212 PP632Q6XCG6 107 aa8.25□□□□□ -1.09
SH3BP4-203ENST00000409212 H0YAA0 97 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP4-203ENST00000409212 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP4-203ENST00000409212 A0A1B0GVY2 172 aa8.2□□□□□ -1.1
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP10-8P60410 259 aa8.2□□□□□ -1.1
SH3BP4-203ENST00000409212 NDUFAF8A1L188 74 aa8.19□□□□□ -1.1
SH3BP4-203ENST00000409212 TGP01266 2768 aa8.17□□□□□ -1.1
SH3BP4-203ENST00000409212 C10orf95Q9H7T3 257 aa8.13□□□□□ -1.11
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP10-10P60014 251 aa8.09□□□□□ -1.11
SH3BP4-203ENST00000409212 MYO15AQ9UKN7 3530 aa8.09□□□□□ -1.11
SH3BP4-203ENST00000409212 P0C880 135 aa8.08□□□□□ -1.12
SH3BP4-203ENST00000409212 PDZD2O15018 2839 aa8.07□□□□□ -1.12
SH3BP4-203ENST00000409212 DCHS1Q96JQ0 3298 aa8.04□□□□□ -1.12
SH3BP4-203ENST00000409212 VWFP04275 2813 aa8.03□□□□□ -1.12
SH3BP4-203ENST00000409212 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.98□□□□□ -1.13
SH3BP4-203ENST00000409212 RELNP78509 3460 aa7.93□□□□□ -1.14
SH3BP4-203ENST00000409212 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
SH3BP4-203ENST00000409212 OTOGQ6ZRI0 2925 aa7.87□□□□□ -1.15
SH3BP4-203ENST00000409212 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa7.86□□□□□ -1.15
SH3BP4-203ENST00000409212 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP12-2P59991 146 aa7.71□□□□□ -1.17
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa7.7□□□□□ -1.18
SH3BP4-203ENST00000409212 FBN3Q75N90 2809 aa7.66□□□□□ -1.18
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP12-1P59990 96 aa7.64□□□□□ -1.19
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa7.64□□□□□ -1.19
SH3BP4-203ENST00000409212 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa7.61□□□□□ -1.19
SH3BP4-203ENST00000409212 LAMA5O15230 3695 aa7.59□□□□□ -1.19
SH3BP4-203ENST00000409212 ZFHX3Q15911 3703 aa7.54□□□□□ -1.2
SH3BP4-203ENST00000409212 ASPMQ8IZT6 3477 aa7.53□□□□□ -1.2
SH3BP4-203ENST00000409212 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa7.52□□□□□ -1.21
SH3BP4-203ENST00000409212 MT1HL1P0DM35 61 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-203ENST00000409212 ZFHX4Q86UP3 3567 aa7.48□□□□□ -1.21
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
SH3BP4-203ENST00000409212 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
SH3BP4-203ENST00000409212 COL7A1Q02388 2944 aa7.46□□□□□ -1.22
SH3BP4-203ENST00000409212 CSMD1Q96PZ7 3565 aa7.36□□□□□ -1.23
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SH3BP4-203ENST00000409212 MUC3AQ02505 3323 aa7.32□□□□□ -1.24
SH3BP4-203ENST00000409212 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
SH3BP4-203ENST00000409212 DMDP11532 3685 aa7.26□□□□□ -1.25
SH3BP4-203ENST00000409212 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa7.25□□□□□ -1.25
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.24□□□□□ -1.25
SH3BP4-203ENST00000409212 CSMD2Q7Z408 3487 aa7.24□□□□□ -1.25
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.23□□□□□ -1.25
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.22□□□□□ -1.25
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.17□□□□□ -1.26
SH3BP4-203ENST00000409212 SVEP1Q4LDE5 3571 aa7.11□□□□□ -1.27
SH3BP4-203ENST00000409212 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
SH3BP4-203ENST00000409212 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
SH3BP4-203ENST00000409212 CUBNO60494 3623 aa7.02□□□□□ -1.29
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP10-12P60413 245 aa7.02□□□□□ -1.29
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.86□□□□□ -1.31
SH3BP4-203ENST00000409212 BSNQ9UPA5 3926 aa6.85□□□□□ -1.31
SH3BP4-203ENST00000409212 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.85□□□□□ -1.31
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP12-3P60328 96 aa6.83□□□□□ -1.32
SH3BP4-203ENST00000409212 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SH3BP4-203ENST00000409212 INE1O15225 51 aa6.75□□□□□ -1.33
SH3BP4-203ENST00000409212 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.73□□□□□ -1.33
SH3BP4-203ENST00000409212 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.72□□□□□ -1.33
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