RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402697.5

PRAME-203, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PRAME, Length 2,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-203ENST00000402697 MPLKIPQ8TAP9 179 aa7.74□□□□□ -1.17
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PRAME-203ENST00000402697 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa7.72□□□□□ -1.17
PRAME-203ENST00000402697 C1orf195Q5TG92 126 aa7.72□□□□□ -1.17
PRAME-203ENST00000402697 PKD1P98161 4303 aa7.71□□□□□ -1.18
PRAME-203ENST00000402697 C8orf87E5RJ46 101 aa7.71□□□□□ -1.18
PRAME-203ENST00000402697 SACSQ9NZJ4 4579 aa7.7□□□□□ -1.18
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PRAME-203ENST00000402697 PRR4Q16378 134 aa7.67□□□□□ -1.18
PRAME-203ENST00000402697 Q6ZSA8 131 aa7.67□□□□□ -1.18
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PRAME-203ENST00000402697 A8MU10 97 aa7.18□□□□□ -1.26
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PRAME-203ENST00000402697 SPATA8Q6RVD6 105 aa7.1□□□□□ -1.27
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PRAME-203ENST00000402697 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa7.04□□□□□ -1.28
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PRAME-203ENST00000402697 Q8N1X5 172 aa7.02□□□□□ -1.29
PRAME-203ENST00000402697 TNXBP22105 4242 aa7□□□□□ -1.29
PRAME-203ENST00000402697 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PRAME-203ENST00000402697 KRTAP10-8P60410 259 aa6.96□□□□□ -1.29
PRAME-203ENST00000402697 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.96□□□□□ -1.3
PRAME-203ENST00000402697 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.93□□□□□ -1.3
PRAME-203ENST00000402697 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.92□□□□□ -1.3
PRAME-203ENST00000402697 MYCBP2O75592 4640 aa6.91□□□□□ -1.3
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PRAME-203ENST00000402697 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
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