RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391087.1

RNU6-1275P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1275, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1275P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa-7.38□□□□□ -3.59
RNU6-1275P-201ENST00000391087 HSBP1L1C9JCN9 74 aa-7.38□□□□□ -3.59
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP-7.38□□□□□ -3.59
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SMCO1Q147U7 214 aa-7.38□□□□□ -3.59
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ETDBQ3ZM63 59 aa-7.38□□□□□ -3.59
RNU6-1275P-201ENST00000391087 FAM107BQ9H098 131 aa-7.39□□□□□ -3.59
RNU6-1275P-201ENST00000391087 GINS2Q9Y248 185 aa-7.39□□□□□ -3.59
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CYB5AP00167 134 aa-7.4□□□□□ -3.59
RNU6-1275P-201ENST00000391087 DPH3P1Q9H4G8 78 aa-7.4□□□□□ -3.59
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CCDC167Q9P0B6 97 aa-7.4□□□□□ -3.59
RNU6-1275P-201ENST00000391087 J3QR89 54 aa-7.41□□□□□ -3.6
RNU6-1275P-201ENST00000391087 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP-7.41□□□□□ -3.6
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP-7.42□□□□□ -3.6
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PLGLAQ15195 96 aa-7.42□□□□□ -3.6
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ATPIF1Q9UII2 106 aa-7.42□□□□□ -3.6
RNU6-1275P-201ENST00000391087 OOSP1A8MZH6 123 aa-7.43□□□□□ -3.6
RNU6-1275P-201ENST00000391087 K7ERU9 68 aa-7.43□□□□□ -3.6
RNU6-1275P-201ENST00000391087 MPC2O95563 127 aa-7.43□□□□□ -3.6
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ABRACLQ9P1F3 81 aa-7.43□□□□□ -3.6
RNU6-1275P-201ENST00000391087 NDUFB1O75438 58 aa-7.44□□□□□ -3.6
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TPM2P07951 284 aa-7.44□□□□□ -3.6
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TPM1P09493 284 aa-7.44□□□□□ -3.6
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ARHGAP5Q13017 1502 aa-7.44□□□□□ -3.6
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa-7.45□□□□□ -3.6
RNU6-1275P-201ENST00000391087 LMO7Q8WWI1 1683 aa-7.46□□□□□ -3.6
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa-7.46□□□□□ -3.6
RNU6-1275P-201ENST00000391087 APOC2P02655 101 aa-7.47□□□□□ -3.61
RNU6-1275P-201ENST00000391087 HSPB11Q9Y547 144 aa-7.47□□□□□ -3.61
RNU6-1275P-201ENST00000391087 LINC00032P0C843 101 aa-7.48□□□□□ -3.61
RNU6-1275P-201ENST00000391087 DEFB133Q30KQ1 61 aa-7.48□□□□□ -3.61
RNU6-1275P-201ENST00000391087 KCNQ1DNQ9H478 68 aa-7.48□□□□□ -3.61
RNU6-1275P-201ENST00000391087 C3P01024 1663 aa-7.48□□□□□ -3.61
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa-7.49□□□□□ -3.61
RNU6-1275P-201ENST00000391087 KRTDAPP60985 99 aa-7.49□□□□□ -3.61
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ZNF720Q7Z2F6 126 aa-7.5□□□□□ -3.61
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa-7.5□□□□□ -3.61
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SMIM3Q9BZL3 60 aa-7.5□□□□□ -3.61
RNU6-1275P-201ENST00000391087 HFM1A2PYH4 1435 aa-7.51□□□□□ -3.61
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ATOX1O00244 68 aa-7.51□□□□□ -3.61
RNU6-1275P-201ENST00000391087 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP-7.51□□□□□ -3.61
RNU6-1275P-201ENST00000391087 M0R2Z0 102 aa-7.53□□□□□ -3.61
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CTXN2P0C2S0 81 aa-7.54□□□□□ -3.62
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CD52P31358 61 aa-7.54□□□□□ -3.62
RNU6-1275P-201ENST00000391087 NAIPQ13075 1403 aa-7.54□□□□□ -3.62
RNU6-1275P-201ENST00000391087 UNC13AQ9UPW8 1703 aa-7.55□□□□□ -3.62
RNU6-1275P-201ENST00000391087 COPZ1P61923 177 aa-7.55□□□□□ -3.62
RNU6-1275P-201ENST00000391087 UBL5Q9BZL1 73 aa-7.55□□□□□ -3.62
RNU6-1275P-201ENST00000391087 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP-7.55□□□□□ -3.62
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TTC37Q6PGP7 1564 aa-7.55□□□□□ -3.62
RNU6-1275P-201ENST00000391087 FANCAO15360 1455 aa-7.55□□□□□ -3.62
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SPANXCQ9NY87 97 aa-7.56□□□□□ -3.62
RNU6-1275P-201ENST00000391087 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP-7.57□□□□□ -3.62
RNU6-1275P-201ENST00000391087 hADV29S1A0JD25 119 aa-7.57□□□□□ -3.62
RNU6-1275P-201ENST00000391087 FAM24AA6NFZ4 105 aa-7.57□□□□□ -3.62
RNU6-1275P-201ENST00000391087 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP-7.57□□□□□ -3.62
RNU6-1275P-201ENST00000391087 UMAD1C9J7I0 102 aa-7.58□□□□□ -3.62
RNU6-1275P-201ENST00000391087 DPY30Q9C005 99 aa-7.58□□□□□ -3.62
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP-7.58□□□□□ -3.62
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP-7.59□□□□□ -3.62
RNU6-1275P-201ENST00000391087 S100GP29377 79 aa-7.61□□□□□ -3.63
RNU6-1275P-201ENST00000391087 RPS25P62851 125 aaKnown RBP-7.61□□□□□ -3.63
RNU6-1275P-201ENST00000391087 DR1Q01658 176 aa-7.61□□□□□ -3.63
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TRIQKQ629K1 86 aa-7.61□□□□□ -3.63
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SCRIBQ14160 1630 aa-7.62□□□□□ -3.63
RNU6-1275P-201ENST00000391087 DIP2AQ14689 1571 aa-7.63□□□□□ -3.63
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CFAP43Q8NDM7 1665 aa-7.63□□□□□ -3.63
RNU6-1275P-201ENST00000391087 MROH1Q8NDA8 1641 aa-7.63□□□□□ -3.63
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TPM3P06753 285 aa-7.64□□□□□ -3.63
RNU6-1275P-201ENST00000391087 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP-7.64□□□□□ -3.63
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PCBD2Q9H0N5 130 aa-7.65□□□□□ -3.63
RNU6-1275P-201ENST00000391087 GLI2P10070 1586 aa-7.66□□□□□ -3.64
RNU6-1275P-201ENST00000391087 MEIG1Q5JSS6 88 aa-7.66□□□□□ -3.64
RNU6-1275P-201ENST00000391087 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP-7.68□□□□□ -3.64
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa-7.68□□□□□ -3.64
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa-7.68□□□□□ -3.64
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PFDN5Q99471 154 aa-7.68□□□□□ -3.64
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP-7.69□□□□□ -3.64
RNU6-1275P-201ENST00000391087 RBP2P50120 134 aa-7.69□□□□□ -3.64
RNU6-1275P-201ENST00000391087 WFDC10BQ8IUB3 73 aa-7.69□□□□□ -3.64
RNU6-1275P-201ENST00000391087 LZICQ8WZA0 190 aa-7.69□□□□□ -3.64
RNU6-1275P-201ENST00000391087 VPS8Q8N3P4 1428 aa-7.69□□□□□ -3.64
RNU6-1275P-201ENST00000391087 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP-7.7□□□□□ -3.64
RNU6-1275P-201ENST00000391087 NREPQ16612 68 aa-7.7□□□□□ -3.64
RNU6-1275P-201ENST00000391087 GID8Q9NWU2 228 aa-7.71□□□□□ -3.64
RNU6-1275P-201ENST00000391087 RALGAPBQ86X10 1494 aa-7.71□□□□□ -3.64
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TSTD1Q8NFU3 115 aa-7.73□□□□□ -3.65
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PMCHL2Q9BQD1 86 aa-7.76□□□□□ -3.65
RNU6-1275P-201ENST00000391087 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa-7.77□□□□□ -3.65
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PZPP20742 1482 aa-7.78□□□□□ -3.65
RNU6-1275P-201ENST00000391087 DDA1Q9BW61 102 aa-7.78□□□□□ -3.65
RNU6-1275P-201ENST00000391087 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP-7.78□□□□□ -3.66
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TIAM1Q13009 1591 aa-7.79□□□□□ -3.66
RNU6-1275P-201ENST00000391087 RABAC1Q9UI14 185 aa-7.79□□□□□ -3.66
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ABCC6O95255 1503 aa-7.79□□□□□ -3.66
RNU6-1275P-201ENST00000391087 NRKQ7Z2Y5 1582 aa-7.8□□□□□ -3.66
RNU6-1275P-201ENST00000391087 HTN1P15515 57 aa-7.81□□□□□ -3.66
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ARPC4P59998 168 aa-7.81□□□□□ -3.66
RNU6-1275P-201ENST00000391087 MROH2AA6NES4 1674 aa-7.82□□□□□ -3.66
RNU6-1275P-201ENST00000391087 UQCRHLA0A096LP55 91 aa-7.82□□□□□ -3.66
RNU6-1275P-201ENST00000391087 A0A1B0GV72 72 aa-7.82□□□□□ -3.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms