RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384253.1

RNU6-662P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 662, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-662P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-662P-201ENST00000384253 DLEU1O43261 78 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-662P-201ENST00000384253 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-662P-201ENST00000384253 FAM107BQ9H098 131 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-662P-201ENST00000384253 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-662P-201ENST00000384253 A0A1B0GV90 55 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-662P-201ENST00000384253 H3BUA1 57 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-662P-201ENST00000384253 SPEGQ15772 3267 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-662P-201ENST00000384253 ATP10BO94823 1461 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-662P-201ENST00000384253 PEA15Q15121 130 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-662P-201ENST00000384253 GNG8Q9UK08 70 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-662P-201ENST00000384253 CCDC88BA6NC98 1476 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-662P-201ENST00000384253 ITSN1Q15811 1721 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-662P-201ENST00000384253 KIF1AQ12756 1690 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-662P-201ENST00000384253 DMDP11532 3685 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-662P-201ENST00000384253 NCOA2Q15596 1464 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-662P-201ENST00000384253 NDUFA4O00483 81 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-662P-201ENST00000384253 RPS27P42677 84 aaKnown RBP-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-662P-201ENST00000384253 S100A12P80511 92 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-662P-201ENST00000384253 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-662P-201ENST00000384253 ACBD7Q8N6N7 88 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-662P-201ENST00000384253 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-662P-201ENST00000384253 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-662P-201ENST00000384253 LINC00032P0C843 101 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-662P-201ENST00000384253 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-662P-201ENST00000384253 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-662P-201ENST00000384253 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-662P-201ENST00000384253 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-662P-201ENST00000384253 M0QZ58 72 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-662P-201ENST00000384253 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-662P-201ENST00000384253 UMAD1C9J7I0 102 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-662P-201ENST00000384253 RPS29P62273 56 aaKnown RBP-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-662P-201ENST00000384253 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-662P-201ENST00000384253 HMGN1P05114 100 aa-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-662P-201ENST00000384253 CFAP54Q96N23 3096 aa-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-662P-201ENST00000384253 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa-3.9□□□□□ -3.03
RNU6-662P-201ENST00000384253 SMARCA2P51531 1590 aa-3.9□□□□□ -3.03
RNU6-662P-201ENST00000384253 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP-3.91□□□□□ -3.04
RNU6-662P-201ENST00000384253 MYO3AQ8NEV4 1616 aa-3.92□□□□□ -3.04
RNU6-662P-201ENST00000384253 C20orf202A1L168 122 aa-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-662P-201ENST00000384253 M0QY20 66 aa-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-662P-201ENST00000384253 MINOS1Q5TGZ0 78 aa-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-662P-201ENST00000384253 DPY30Q9C005 99 aa-3.94□□□□□ -3.04
RNU6-662P-201ENST00000384253 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-662P-201ENST00000384253 CEBPZOSA8MTT3 80 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-662P-201ENST00000384253 SPART-AS1P0CW21 52 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-662P-201ENST00000384253 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-662P-201ENST00000384253 C20orf78Q9BR46 151 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-662P-201ENST00000384253 PLCH1Q4KWH8 1693 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-662P-201ENST00000384253 CEP350Q5VT06 3117 aa-3.96□□□□□ -3.04
RNU6-662P-201ENST00000384253 S100A10P60903 97 aa-3.96□□□□□ -3.04
RNU6-662P-201ENST00000384253 RABAC1Q9UI14 185 aa-3.96□□□□□ -3.04
RNU6-662P-201ENST00000384253 EFCAB10A6NFE3 127 aa-3.98□□□□□ -3.05
RNU6-662P-201ENST00000384253 UBR1Q8IWV7 1749 aa-3.98□□□□□ -3.05
RNU6-662P-201ENST00000384253 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa-3.99□□□□□ -3.05
RNU6-662P-201ENST00000384253 C2orf88Q9BSF0 95 aa-3.99□□□□□ -3.05
RNU6-662P-201ENST00000384253 CRIP1P50238 77 aa-4□□□□□ -3.05
RNU6-662P-201ENST00000384253 A0A1B0GUL6 1792 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-662P-201ENST00000384253 A8MTW9 85 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-662P-201ENST00000384253 GYPAP02724 150 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-662P-201ENST00000384253 NREPQ16612 68 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-662P-201ENST00000384253 HFM1A2PYH4 1435 aa-4.03□□□□□ -3.05
RNU6-662P-201ENST00000384253 KCNQ1DNQ9H478 68 aa-4.03□□□□□ -3.05
RNU6-662P-201ENST00000384253 NRAPQ86VF7 1730 aa-4.04□□□□□ -3.06
RNU6-662P-201ENST00000384253 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP-4.04□□□□□ -3.06
RNU6-662P-201ENST00000384253 UBL5Q9BZL1 73 aa-4.04□□□□□ -3.06
RNU6-662P-201ENST00000384253 C6orf48Q9UBA6 75 aa-4.04□□□□□ -3.06
RNU6-662P-201ENST00000384253 CEP162Q5TB80 1403 aa-4.04□□□□□ -3.06
RNU6-662P-201ENST00000384253 CD163L1Q9NR16 1453 aa-4.05□□□□□ -3.06
RNU6-662P-201ENST00000384253 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP-4.05□□□□□ -3.06
RNU6-662P-201ENST00000384253 TJP1Q07157 1748 aa-4.05□□□□□ -3.06
RNU6-662P-201ENST00000384253 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa-4.05□□□□□ -3.06
RNU6-662P-201ENST00000384253 VPS13CQ709C8 3753 aa-4.06□□□□□ -3.06
RNU6-662P-201ENST00000384253 FCER1GP30273 86 aa-4.06□□□□□ -3.06
RNU6-662P-201ENST00000384253 ERVK-7P63135 1459 aa-4.06□□□□□ -3.06
RNU6-662P-201ENST00000384253 SFTA3P0C7M3 94 aa-4.07□□□□□ -3.06
RNU6-662P-201ENST00000384253 LINC00643Q86TS7 51 aa-4.07□□□□□ -3.06
RNU6-662P-201ENST00000384253 PIK3C2BO00750 1634 aa-4.07□□□□□ -3.06
RNU6-662P-201ENST00000384253 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP-4.08□□□□□ -3.06
RNU6-662P-201ENST00000384253 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa-4.08□□□□□ -3.06
RNU6-662P-201ENST00000384253 UNC13AQ9UPW8 1703 aa-4.08□□□□□ -3.06
RNU6-662P-201ENST00000384253 DNMBPQ6XZF7 1577 aa-4.1□□□□□ -3.07
RNU6-662P-201ENST00000384253 RBP2P50120 134 aa-4.1□□□□□ -3.07
RNU6-662P-201ENST00000384253 RICTORQ6R327 1708 aa-4.11□□□□□ -3.07
RNU6-662P-201ENST00000384253 MED14O60244 1454 aa-4.12□□□□□ -3.07
RNU6-662P-201ENST00000384253 RALGAPBQ86X10 1494 aa-4.12□□□□□ -3.07
RNU6-662P-201ENST00000384253 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-662P-201ENST00000384253 DEFB136Q30KP8 78 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-662P-201ENST00000384253 LINC00587B1AMM8 73 aa-4.14□□□□□ -3.07
RNU6-662P-201ENST00000384253 CFAP43Q8NDM7 1665 aa-4.14□□□□□ -3.07
RNU6-662P-201ENST00000384253 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa-4.15□□□□□ -3.07
RNU6-662P-201ENST00000384253 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa-4.16□□□□□ -3.08
RNU6-662P-201ENST00000384253 NCMAPQ5T1S8 102 aa-4.16□□□□□ -3.08
RNU6-662P-201ENST00000384253 DCHS1Q96JQ0 3298 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-662P-201ENST00000384253 FRYLO94915 3013 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-662P-201ENST00000384253 PPLO60437 1756 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-662P-201ENST00000384253 CEP250Q9BV73 2442 aa-4.18□□□□□ -3.08
RNU6-662P-201ENST00000384253 WDFY4Q6ZS81 3184 aa-4.18□□□□□ -3.08
RNU6-662P-201ENST00000384253 LEAP2Q969E1 77 aa-4.19□□□□□ -3.08
RNU6-662P-201ENST00000384253 CNTLNQ9NXG0 1405 aa-4.2□□□□□ -3.08
RNU6-662P-201ENST00000384253 PCNTO95613 3336 aa-4.2□□□□□ -3.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms