RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376510.7

MSRB2-201, Transcript of methionine sulfoxide reductase B2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSRB2, Length 1,803 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB2-201ENST00000376510 C8orf17Q9NRJ1 99 aa15.73■□□□□ 0.11
MSRB2-201ENST00000376510 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa15.71■□□□□ 0.11
MSRB2-201ENST00000376510 hDV103S1A0JD37 113 aa15.71■□□□□ 0.1
MSRB2-201ENST00000376510 RPS29P62273 56 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
MSRB2-201ENST00000376510 RYR1P21817 5038 aa15.68■□□□□ 0.1
MSRB2-201ENST00000376510 C20orf197Q8N268 126 aa15.66■□□□□ 0.1
MSRB2-201ENST00000376510 C8orf87E5RJ46 101 aa15.59■□□□□ 0.09
MSRB2-201ENST00000376510 Q8N1X5 172 aa15.59■□□□□ 0.09
MSRB2-201ENST00000376510 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa15.57■□□□□ 0.08
MSRB2-201ENST00000376510 TMEM254Q8TBM7 123 aa15.57■□□□□ 0.08
MSRB2-201ENST00000376510 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
MSRB2-201ENST00000376510 C5orf47Q569G3 176 aa15.54■□□□□ 0.08
MSRB2-201ENST00000376510 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
MSRB2-201ENST00000376510 LINC00313P59037 77 aa15.53■□□□□ 0.08
MSRB2-201ENST00000376510 KLKP1Q107X0 134 aa15.52■□□□□ 0.08
MSRB2-201ENST00000376510 SNURFQ9Y675 71 aa15.52■□□□□ 0.08
MSRB2-201ENST00000376510 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa15.52■□□□□ 0.07
MSRB2-201ENST00000376510 NDUFS5O43920 106 aa15.5■□□□□ 0.07
MSRB2-201ENST00000376510 CYSTM1Q9H1C7 97 aa15.49■□□□□ 0.07
MSRB2-201ENST00000376510 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa15.49■□□□□ 0.07
MSRB2-201ENST00000376510 KIAA1109Q2LD37 5005 aa15.47■□□□□ 0.07
MSRB2-201ENST00000376510 KRTAP10-8P60410 259 aa15.46■□□□□ 0.07
MSRB2-201ENST00000376510 A0A0U1RQV1 116 aa15.45■□□□□ 0.06
MSRB2-201ENST00000376510 MP68P56378 58 aa15.44■□□□□ 0.06
MSRB2-201ENST00000376510 H0Y9P7 68 aa15.39■□□□□ 0.05
MSRB2-201ENST00000376510 NDUFC1O43677 76 aa15.39■□□□□ 0.05
MSRB2-201ENST00000376510 TRAV22A0A0B4J277 110 aa15.36■□□□□ 0.05
MSRB2-201ENST00000376510 TMEM258P61165 79 aa15.33■□□□□ 0.05
MSRB2-201ENST00000376510 H3BPC8 53 aa15.33■□□□□ 0.04
MSRB2-201ENST00000376510 H7BZZ5 65 aa15.33■□□□□ 0.04
MSRB2-201ENST00000376510 LINC00208Q96KT6 92 aa15.32■□□□□ 0.04
MSRB2-201ENST00000376510 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
MSRB2-201ENST00000376510 TNXBP22105 4242 aa15.29■□□□□ 0.04
MSRB2-201ENST00000376510 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
MSRB2-201ENST00000376510 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
MSRB2-201ENST00000376510 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa15.28■□□□□ 0.04
MSRB2-201ENST00000376510 RETNLBQ9BQ08 111 aa15.28■□□□□ 0.04
MSRB2-201ENST00000376510 FAT3Q8TDW7 4589 aa15.26■□□□□ 0.03
MSRB2-201ENST00000376510 C1orf64Q8NEQ6 169 aa15.24■□□□□ 0.03
MSRB2-201ENST00000376510 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
MSRB2-201ENST00000376510 OXTP01178 125 aa15.17■□□□□ 0.02
MSRB2-201ENST00000376510 MT1HL1P0DM35 61 aa15.17■□□□□ 0.02
MSRB2-201ENST00000376510 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa15.15■□□□□ 0.02
MSRB2-201ENST00000376510 FAM236CP0DP71 79 aa15.15■□□□□ 0.02
MSRB2-201ENST00000376510 Q5W150 140 aa15.15■□□□□ 0.02
MSRB2-201ENST00000376510 C9orf92A6NGG3 77 aa15.14■□□□□ 0.01
MSRB2-201ENST00000376510 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa15.12■□□□□ 0.01
MSRB2-201ENST00000376510 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa15.09■□□□□ 0.01
MSRB2-201ENST00000376510 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
MSRB2-201ENST00000376510 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
MSRB2-201ENST00000376510 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa15.06■□□□□ 0
MSRB2-201ENST00000376510 MYCBP2O75592 4640 aa15.05■□□□□ 0
MSRB2-201ENST00000376510 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
MSRB2-201ENST00000376510 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa14.98□□□□□ -0.01
MSRB2-201ENST00000376510 PCOTHQ58A44 107 aa14.97□□□□□ -0.01
MSRB2-201ENST00000376510 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa14.96□□□□□ -0.01
MSRB2-201ENST00000376510 A8MUU9 505 aa14.96□□□□□ -0.01
MSRB2-201ENST00000376510 BIRC6Q9NR09 4857 aa14.94□□□□□ -0.02
MSRB2-201ENST00000376510 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa14.93□□□□□ -0.02
MSRB2-201ENST00000376510 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa14.92□□□□□ -0.02
MSRB2-201ENST00000376510 IGKV2-30P06310 120 aa14.89□□□□□ -0.03
MSRB2-201ENST00000376510 RPS28P62857 69 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
MSRB2-201ENST00000376510 SERP1Q9Y6X1 66 aa14.87□□□□□ -0.03
MSRB2-201ENST00000376510 PRR4Q16378 134 aa14.87□□□□□ -0.03
MSRB2-201ENST00000376510 Q75L30 129 aa14.83□□□□□ -0.04
MSRB2-201ENST00000376510 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa14.82□□□□□ -0.04
MSRB2-201ENST00000376510 J3QL48 77 aa14.78□□□□□ -0.04
MSRB2-201ENST00000376510 HERC2O95714 4834 aa14.78□□□□□ -0.04
MSRB2-201ENST00000376510 C7orf65Q6ZTY9 151 aa14.73□□□□□ -0.05
MSRB2-201ENST00000376510 ABCA13Q86UQ4 5058 aa14.72□□□□□ -0.05
MSRB2-201ENST00000376510 HRES1P13985 223 aa14.69□□□□□ -0.06
MSRB2-201ENST00000376510 XP32Q5T750 250 aa14.69□□□□□ -0.06
MSRB2-201ENST00000376510 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa14.68□□□□□ -0.06
MSRB2-201ENST00000376510 RPL37P61927 97 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
MSRB2-201ENST00000376510 TPRXLQ17RH7 258 aa14.62□□□□□ -0.07
MSRB2-201ENST00000376510 SPINK7P58062 85 aa14.54□□□□□ -0.08
MSRB2-201ENST00000376510 SMIM26A0A096LP01 95 aa14.5□□□□□ -0.09
MSRB2-201ENST00000376510 COA5Q86WW8 74 aa14.5□□□□□ -0.09
MSRB2-201ENST00000376510 ACYP2P14621 99 aa14.49□□□□□ -0.09
MSRB2-201ENST00000376510 DMAC1Q96GE9 116 aa14.49□□□□□ -0.09
MSRB2-201ENST00000376510 C4orf26Q17RF5 130 aa14.4□□□□□ -0.1
MSRB2-201ENST00000376510 A8MUN3 132 aa14.32□□□□□ -0.12
MSRB2-201ENST00000376510 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa14.29□□□□□ -0.12
MSRB2-201ENST00000376510 MPLKIPQ8TAP9 179 aa14.27□□□□□ -0.12
MSRB2-201ENST00000376510 LPAP08519 4548 aa14.25□□□□□ -0.13
MSRB2-201ENST00000376510 LRP2P98164 4655 aa14.19□□□□□ -0.14
MSRB2-201ENST00000376510 COX6B2Q6YFQ2 88 aa14.19□□□□□ -0.14
MSRB2-201ENST00000376510 Q1T7F1 81 aa14.17□□□□□ -0.14
MSRB2-201ENST00000376510 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
MSRB2-201ENST00000376510 V9GYY9 64 aa14.16□□□□□ -0.14
MSRB2-201ENST00000376510 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa14.14□□□□□ -0.15
MSRB2-201ENST00000376510 PCLOQ9Y6V0 5065 aa14.12□□□□□ -0.15
MSRB2-201ENST00000376510 SPTSSBQ8NFR3 76 aa13.97□□□□□ -0.17
MSRB2-201ENST00000376510 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa13.96□□□□□ -0.17
MSRB2-201ENST00000376510 PSPHP1O15172 72 aa13.94□□□□□ -0.18
MSRB2-201ENST00000376510 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa13.94□□□□□ -0.18
MSRB2-201ENST00000376510 PRR15LQ9BU68 103 aa13.9□□□□□ -0.18
MSRB2-201ENST00000376510 HERC1Q15751 4861 aa13.87□□□□□ -0.19
MSRB2-201ENST00000376510 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa13.81□□□□□ -0.2
MSRB2-201ENST00000376510 MUC17Q685J3 4493 aa13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 125 ms