RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa8.8□□□□□ -1
SPCS1-201ENST00000233025 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa8.79□□□□□ -1
SPCS1-201ENST00000233025 LCE5AQ5TCM9 118 aa8.79□□□□□ -1
SPCS1-201ENST00000233025 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa8.79□□□□□ -1
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa8.78□□□□□ -1
SPCS1-201ENST00000233025 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa8.76□□□□□ -1.01
SPCS1-201ENST00000233025 ACYP1P07311 99 aa8.73□□□□□ -1.01
SPCS1-201ENST00000233025 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa8.73□□□□□ -1.01
SPCS1-201ENST00000233025 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa8.72□□□□□ -1.01
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa8.72□□□□□ -1.01
SPCS1-201ENST00000233025 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa8.71□□□□□ -1.02
SPCS1-201ENST00000233025 RBM3P98179 157 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
SPCS1-201ENST00000233025 C9orf153Q5TBE3 101 aa8.71□□□□□ -1.02
SPCS1-201ENST00000233025 C14orf132Q9NPU4 83 aa8.71□□□□□ -1.02
SPCS1-201ENST00000233025 NEBP20929 6669 aa8.71□□□□□ -1.02
SPCS1-201ENST00000233025 C9orf92A6NGG3 77 aa8.7□□□□□ -1.02
SPCS1-201ENST00000233025 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa8.7□□□□□ -1.02
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1B0GV72 72 aa8.68□□□□□ -1.02
SPCS1-201ENST00000233025 PDE6GP18545 87 aa8.68□□□□□ -1.02
SPCS1-201ENST00000233025 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
SPCS1-201ENST00000233025 DEFB105AQ8NG35 78 aa8.68□□□□□ -1.02
SPCS1-201ENST00000233025 DSCR8Q96T75 97 aa8.68□□□□□ -1.02
SPCS1-201ENST00000233025 SPRR1BP22528 89 aa8.67□□□□□ -1.02
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa8.67□□□□□ -1.02
SPCS1-201ENST00000233025 CCKP06307 115 aa8.65□□□□□ -1.02
SPCS1-201ENST00000233025 SIGMAR1Q99720 223 aa8.65□□□□□ -1.02
SPCS1-201ENST00000233025 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa8.63□□□□□ -1.03
SPCS1-201ENST00000233025 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa8.62□□□□□ -1.03
SPCS1-201ENST00000233025 F8WEM9 126 aa8.62□□□□□ -1.03
SPCS1-201ENST00000233025 Q6ZQT0 140 aa8.6□□□□□ -1.03
SPCS1-201ENST00000233025 LIMD2Q9BT23 127 aa8.59□□□□□ -1.03
SPCS1-201ENST00000233025 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa8.58□□□□□ -1.04
SPCS1-201ENST00000233025 RPL37P61927 97 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
SPCS1-201ENST00000233025 HRCT1Q6UXD1 115 aa8.58□□□□□ -1.04
SPCS1-201ENST00000233025 MT2AP02795 61 aa8.56□□□□□ -1.04
SPCS1-201ENST00000233025 LINC00643Q86TS7 51 aa8.56□□□□□ -1.04
SPCS1-201ENST00000233025 UBL5Q9BZL1 73 aa8.55□□□□□ -1.04
SPCS1-201ENST00000233025 Q6Q795 121 aa8.54□□□□□ -1.04
SPCS1-201ENST00000233025 MT-ATP8P03928 68 aa8.53□□□□□ -1.04
SPCS1-201ENST00000233025 CD164Q04900 197 aa8.53□□□□□ -1.04
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa8.53□□□□□ -1.04
SPCS1-201ENST00000233025 SMIM29Q86T20 159 aa8.53□□□□□ -1.04
SPCS1-201ENST00000233025 LINC00846Q9NV44 126 aa8.52□□□□□ -1.05
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1B0GW54 56 aa8.5□□□□□ -1.05
SPCS1-201ENST00000233025 MT1FP04733 61 aa8.5□□□□□ -1.05
SPCS1-201ENST00000233025 Q5XG85 94 aa8.5□□□□□ -1.05
SPCS1-201ENST00000233025 SCGB1A1P11684 91 aa8.49□□□□□ -1.05
SPCS1-201ENST00000233025 Q6JHZ5 121 aa8.48□□□□□ -1.05
SPCS1-201ENST00000233025 A0A0G2JQZ4 141 aa8.47□□□□□ -1.05
SPCS1-201ENST00000233025 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa8.47□□□□□ -1.05
SPCS1-201ENST00000233025 C1orf195Q5TG92 126 aa8.46□□□□□ -1.06
SPCS1-201ENST00000233025 IMUPQ9GZP8 106 aa8.46□□□□□ -1.06
SPCS1-201ENST00000233025 MUC12Q9UKN1 5478 aa8.45□□□□□ -1.06
SPCS1-201ENST00000233025 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa8.44□□□□□ -1.06
SPCS1-201ENST00000233025 NREPQ16612 68 aa8.43□□□□□ -1.06
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa8.43□□□□□ -1.06
SPCS1-201ENST00000233025 IGFL1Q6UW32 110 aa8.42□□□□□ -1.06
SPCS1-201ENST00000233025 Q6ZVQ6 151 aa8.42□□□□□ -1.06
SPCS1-201ENST00000233025 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa8.41□□□□□ -1.06
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1W2PNM2 257 aa8.41□□□□□ -1.06
SPCS1-201ENST00000233025 CXCL6P80162 114 aa8.37□□□□□ -1.07
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP10-10P60014 251 aa8.36□□□□□ -1.07
SPCS1-201ENST00000233025 PCP4P48539 62 aa8.35□□□□□ -1.07
SPCS1-201ENST00000233025 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SPCS1-201ENST00000233025 BPY2O14599 106 aa8.33□□□□□ -1.08
SPCS1-201ENST00000233025 A0A087WSZ3 146 aa8.31□□□□□ -1.08
SPCS1-201ENST00000233025 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa8.3□□□□□ -1.08
SPCS1-201ENST00000233025 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa8.3□□□□□ -1.08
SPCS1-201ENST00000233025 SS18L2Q9UHA2 77 aa8.28□□□□□ -1.08
SPCS1-201ENST00000233025 ANAPC13Q9BS18 74 aa8.27□□□□□ -1.09
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa8.27□□□□□ -1.09
SPCS1-201ENST00000233025 A0A087WVE0 104 aa8.24□□□□□ -1.09
SPCS1-201ENST00000233025 ATOX1O00244 68 aa8.24□□□□□ -1.09
SPCS1-201ENST00000233025 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa8.22□□□□□ -1.09
SPCS1-201ENST00000233025 J3KT08 172 aa8.21□□□□□ -1.1
SPCS1-201ENST00000233025 Q75L30 129 aa8.21□□□□□ -1.1
SPCS1-201ENST00000233025 IGKV4-1P06312 121 aa8.19□□□□□ -1.1
SPCS1-201ENST00000233025 Q8N9L7 120 aa8.17□□□□□ -1.1
SPCS1-201ENST00000233025 NDUFB1O75438 58 aa8.16□□□□□ -1.1
SPCS1-201ENST00000233025 DSCR10P59022 87 aa8.16□□□□□ -1.1
SPCS1-201ENST00000233025 DEFB116Q30KQ4 102 aa8.16□□□□□ -1.1
SPCS1-201ENST00000233025 SMIM20Q8N5G0 67 aa8.16□□□□□ -1.1
SPCS1-201ENST00000233025 LINC00472Q9H8W2 130 aa8.16□□□□□ -1.1
SPCS1-201ENST00000233025 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa8.14□□□□□ -1.11
SPCS1-201ENST00000233025 K7EQZ3 153 aa8.13□□□□□ -1.11
SPCS1-201ENST00000233025 A8MWP4 228 aa8.12□□□□□ -1.11
SPCS1-201ENST00000233025 PRR15Q8IV56 129 aa8.1□□□□□ -1.11
SPCS1-201ENST00000233025 SERP2Q8N6R1 65 aa8.1□□□□□ -1.11
SPCS1-201ENST00000233025 HCG22E2RYF7 251 aa8.09□□□□□ -1.11
SPCS1-201ENST00000233025 Q96NJ1 140 aa8.09□□□□□ -1.11
SPCS1-201ENST00000233025 MDN1Q9NU22 5596 aa8.09□□□□□ -1.11
SPCS1-201ENST00000233025 A8MUU9 505 aa8.08□□□□□ -1.12
SPCS1-201ENST00000233025 COX7CP15954 63 aa8.08□□□□□ -1.12
SPCS1-201ENST00000233025 TRAV7A0A075B6U4 112 aa8.07□□□□□ -1.12
SPCS1-201ENST00000233025 UQCRQO14949 82 aa8.07□□□□□ -1.12
SPCS1-201ENST00000233025 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa8.03□□□□□ -1.12
SPCS1-201ENST00000233025 FAM236CP0DP71 79 aa8.03□□□□□ -1.12
SPCS1-201ENST00000233025 CASC2Q6XLA1 102 aa8.03□□□□□ -1.12
SPCS1-201ENST00000233025 WFDC13Q8IUB5 93 aa8.03□□□□□ -1.12
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1B0GVX0 72 aa8.02□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms