RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 LST1O00453 97 aa13.89□□□□□ -0.19
CAPNS1-217ENST00000629983 MT2AP02795 61 aa13.89□□□□□ -0.19
CAPNS1-217ENST00000629983 VAMP3Q15836 100 aa13.89□□□□□ -0.19
CAPNS1-217ENST00000629983 Q6ZQY7 126 aa13.88□□□□□ -0.19
CAPNS1-217ENST00000629983 Q6ZVH6 145 aa13.86□□□□□ -0.19
CAPNS1-217ENST00000629983 OCIAD2Q56VL3 154 aa13.85□□□□□ -0.19
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa13.84□□□□□ -0.19
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM236CP0DP71 79 aa13.84□□□□□ -0.19
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00575Q6W349 94 aa13.84□□□□□ -0.19
CAPNS1-217ENST00000629983 hADV29S1A0JD25 119 aa13.82□□□□□ -0.2
CAPNS1-217ENST00000629983 LCE2BO14633 110 aa13.82□□□□□ -0.2
CAPNS1-217ENST00000629983 S100A1P23297 94 aa13.82□□□□□ -0.2
CAPNS1-217ENST00000629983 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa13.82□□□□□ -0.2
CAPNS1-217ENST00000629983 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
CAPNS1-217ENST00000629983 COLCA2A8K830 154 aa13.8□□□□□ -0.2
CAPNS1-217ENST00000629983 C3orf79P0CE67 100 aa13.79□□□□□ -0.2
CAPNS1-217ENST00000629983 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
CAPNS1-217ENST00000629983 A8MUU9 505 aa13.78□□□□□ -0.2
CAPNS1-217ENST00000629983 MT1FP04733 61 aa13.78□□□□□ -0.2
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD39Q53RE8 183 aa13.78□□□□□ -0.2
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP10-10P60014 251 aa13.76□□□□□ -0.21
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTDAPP60985 99 aa13.76□□□□□ -0.21
CAPNS1-217ENST00000629983 H3BUT2 72 aa13.74□□□□□ -0.21
CAPNS1-217ENST00000629983 HIST1H2BKO60814 126 aa13.73□□□□□ -0.21
CAPNS1-217ENST00000629983 HIST1H2BJP06899 126 aa13.73□□□□□ -0.21
CAPNS1-217ENST00000629983 HIST1H2BOP23527 126 aa13.73□□□□□ -0.21
CAPNS1-217ENST00000629983 HIST1H2BBP33778 126 aa13.73□□□□□ -0.21
CAPNS1-217ENST00000629983 HIST1H2BDP58876 126 aa13.73□□□□□ -0.21
CAPNS1-217ENST00000629983 HIST1H2BCP62807 126 aa13.73□□□□□ -0.21
CAPNS1-217ENST00000629983 HIST2H2BEQ16778 126 aa13.73□□□□□ -0.21
CAPNS1-217ENST00000629983 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
CAPNS1-217ENST00000629983 HIST1H2BHQ93079 126 aa13.73□□□□□ -0.21
CAPNS1-217ENST00000629983 HIST1H2BNQ99877 126 aa13.73□□□□□ -0.21
CAPNS1-217ENST00000629983 HIST1H2BMQ99879 126 aa13.73□□□□□ -0.21
CAPNS1-217ENST00000629983 SNHG12Q9BXW3 62 aa13.73□□□□□ -0.21
CAPNS1-217ENST00000629983 SS18L2Q9UHA2 77 aa13.73□□□□□ -0.21
CAPNS1-217ENST00000629983 ATOH7Q8N100 152 aa13.7□□□□□ -0.22
CAPNS1-217ENST00000629983 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa13.69□□□□□ -0.22
CAPNS1-217ENST00000629983 SCGB1D1O95968 90 aa13.67□□□□□ -0.22
CAPNS1-217ENST00000629983 DSCR10P59022 87 aa13.66□□□□□ -0.22
CAPNS1-217ENST00000629983 PPDPFLQ8WWR9 84 aa13.65□□□□□ -0.22
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00846Q9NV44 126 aa13.64□□□□□ -0.23
CAPNS1-217ENST00000629983 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa13.64□□□□□ -0.23
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A087WSZ3 146 aa13.57□□□□□ -0.24
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa13.55□□□□□ -0.24
CAPNS1-217ENST00000629983 TEN1Q86WV5 123 aa13.55□□□□□ -0.24
CAPNS1-217ENST00000629983 SIGMAR1Q99720 223 aa13.55□□□□□ -0.24
CAPNS1-217ENST00000629983 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa13.54□□□□□ -0.24
CAPNS1-217ENST00000629983 HRES1P13985 223 aa13.51□□□□□ -0.25
CAPNS1-217ENST00000629983 C12orf57Q99622 126 aa13.5□□□□□ -0.25
CAPNS1-217ENST00000629983 MPLKIPQ8TAP9 179 aa13.49□□□□□ -0.25
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00313P59037 77 aa13.47□□□□□ -0.25
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa13.45□□□□□ -0.26
CAPNS1-217ENST00000629983 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
CAPNS1-217ENST00000629983 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
CAPNS1-217ENST00000629983 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
CAPNS1-217ENST00000629983 SNCGO76070 127 aa13.41□□□□□ -0.26
CAPNS1-217ENST00000629983 IGKV4-1P06312 121 aa13.37□□□□□ -0.27
CAPNS1-217ENST00000629983 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa13.37□□□□□ -0.27
CAPNS1-217ENST00000629983 MTURNQ8N3F0 131 aa13.37□□□□□ -0.27
CAPNS1-217ENST00000629983 H3BMG7 143 aa13.36□□□□□ -0.27
CAPNS1-217ENST00000629983 HSBP1L1C9JCN9 74 aa13.35□□□□□ -0.27
CAPNS1-217ENST00000629983 HIST1H4GQ99525 98 aa13.33□□□□□ -0.28
CAPNS1-217ENST00000629983 FABP2P12104 132 aa13.3□□□□□ -0.28
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1W2PNM2 257 aa13.28□□□□□ -0.28
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa13.28□□□□□ -0.28
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM218AQ96MZ4 157 aa13.27□□□□□ -0.29
CAPNS1-217ENST00000629983 H0YGX0 51 aa13.26□□□□□ -0.29
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa13.25□□□□□ -0.29
CAPNS1-217ENST00000629983 DEFB116Q30KQ4 102 aa13.24□□□□□ -0.29
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB37Q96AX2 223 aa13.24□□□□□ -0.29
CAPNS1-217ENST00000629983 GHRHP01286 108 aa13.23□□□□□ -0.29
CAPNS1-217ENST00000629983 A8MWP4 228 aa13.19□□□□□ -0.3
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1B0GV72 72 aa13.17□□□□□ -0.3
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD29Q8N6D5 301 aa13.17□□□□□ -0.3
CAPNS1-217ENST00000629983 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
CAPNS1-217ENST00000629983 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa13.15□□□□□ -0.3
CAPNS1-217ENST00000629983 SPINK7P58062 85 aa13.12□□□□□ -0.31
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00472Q9H8W2 130 aa13.11□□□□□ -0.31
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1B0GX51 115 aa13.1□□□□□ -0.31
CAPNS1-217ENST00000629983 S100A2P29034 98 aa13.1□□□□□ -0.31
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CAPNS1-217ENST00000629983 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A0B4J2C4 111 aa13.07□□□□□ -0.32
CAPNS1-217ENST00000629983 C8orf87E5RJ46 101 aa13.07□□□□□ -0.32
CAPNS1-217ENST00000629983 HIST1H2BLQ99880 126 aa13.07□□□□□ -0.32
CAPNS1-217ENST00000629983 TRACP01848 142 aa13.06□□□□□ -0.32
CAPNS1-217ENST00000629983 NEBP20929 6669 aa13.06□□□□□ -0.32
CAPNS1-217ENST00000629983 COX8AP10176 69 aa13.04□□□□□ -0.32
CAPNS1-217ENST00000629983 HIST3H2BBQ8N257 126 aa13.04□□□□□ -0.32
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1B0GVX0 72 aa13.03□□□□□ -0.32
CAPNS1-217ENST00000629983 CCKP06307 115 aa13.03□□□□□ -0.32
CAPNS1-217ENST00000629983 WFDC13Q8IUB5 93 aa13.02□□□□□ -0.33
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAL4O96015 105 aa12.99□□□□□ -0.33
CAPNS1-217ENST00000629983 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa12.98□□□□□ -0.33
CAPNS1-217ENST00000629983 ORMDL1Q9P0S3 153 aa12.97□□□□□ -0.33
CAPNS1-217ENST00000629983 DLEU1O43261 78 aa12.94□□□□□ -0.34
CAPNS1-217ENST00000629983 VPS25Q9BRG1 176 aa12.94□□□□□ -0.34
CAPNS1-217ENST00000629983 PRO1854Q9UHT4 67 aa12.93□□□□□ -0.34
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