RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614459.4

MDM4-215, Transcript of MDM4, p53 regulator, human

TSL 5 BASIC

Gene MDM4, Length 9,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM4-215	ENST00000614459	MAST4	O15021	2626 aa		4.43	□□□□□ -1.7
MDM4-215	ENST00000614459		A0A096LNT2	108 aa		4.43	□□□□□ -1.7
MDM4-215	ENST00000614459		R4GN34	69 aa		4.42	□□□□□ -1.7
MDM4-215	ENST00000614459	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
MDM4-215	ENST00000614459	PLAC4	Q8WY50	150 aa		4.4	□□□□□ -1.71
MDM4-215	ENST00000614459	PANO1	I0J062	215 aa		4.39	□□□□□ -1.71
MDM4-215	ENST00000614459	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		4.39	□□□□□ -1.71
MDM4-215	ENST00000614459	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		4.38	□□□□□ -1.71
MDM4-215	ENST00000614459		Q6ZSA8	131 aa		4.38	□□□□□ -1.71
MDM4-215	ENST00000614459	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
MDM4-215	ENST00000614459		A0A087WTM6	91 aa		4.38	□□□□□ -1.71
MDM4-215	ENST00000614459	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
MDM4-215	ENST00000614459	C20orf166-AS1	Q96NR2	134 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MDM4-215	ENST00000614459	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MDM4-215	ENST00000614459	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
MDM4-215	ENST00000614459	C9orf92	A6NGG3	77 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MDM4-215	ENST00000614459	AKAP13	Q12802	2813 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM4-215	ENST00000614459	UTRN	P46939	3433 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM4-215	ENST00000614459	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM4-215	ENST00000614459	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM4-215	ENST00000614459		A0A1W2PNN7	141 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM4-215	ENST00000614459	CASC10	Q5T4H9	136 aa		4.33	□□□□□ -1.72
MDM4-215	ENST00000614459	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		4.33	□□□□□ -1.72
MDM4-215	ENST00000614459	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		4.33	□□□□□ -1.72
MDM4-215	ENST00000614459		A0A0G2JQZ4	141 aa		4.32	□□□□□ -1.72
MDM4-215	ENST00000614459	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		4.32	□□□□□ -1.72
MDM4-215	ENST00000614459	CENPF	P49454	3210 aa		4.31	□□□□□ -1.72
MDM4-215	ENST00000614459	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	4.3	□□□□□ -1.72
MDM4-215	ENST00000614459		A8MUU9	505 aa		4.29	□□□□□ -1.72
MDM4-215	ENST00000614459	PCNT	O95613	3336 aa		4.29	□□□□□ -1.72
MDM4-215	ENST00000614459	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		4.27	□□□□□ -1.73
MDM4-215	ENST00000614459	ATR	Q13535	2644 aa		4.27	□□□□□ -1.73
MDM4-215	ENST00000614459	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		4.27	□□□□□ -1.73
MDM4-215	ENST00000614459	STAB1	Q9NY15	2570 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MDM4-215	ENST00000614459		Q8NDZ9	215 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MDM4-215	ENST00000614459	TNP1	P09430	55 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MDM4-215	ENST00000614459	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
MDM4-215	ENST00000614459		M0R2T5	61 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MDM4-215	ENST00000614459	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
MDM4-215	ENST00000614459	CEP350	Q5VT06	3117 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MDM4-215	ENST00000614459	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
MDM4-215	ENST00000614459	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MDM4-215	ENST00000614459	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
MDM4-215	ENST00000614459	NOTCH1	P46531	2555 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MDM4-215	ENST00000614459	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MDM4-215	ENST00000614459		P0C880	135 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MDM4-215	ENST00000614459	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		4.15	□□□□□ -1.74
MDM4-215	ENST00000614459		Q5VSD8	79 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MDM4-215	ENST00000614459	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MDM4-215	ENST00000614459	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MDM4-215	ENST00000614459	C5orf42	Q9H799	3197 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MDM4-215	ENST00000614459	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MDM4-215	ENST00000614459	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MDM4-215	ENST00000614459	INE1	O15225	51 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MDM4-215	ENST00000614459	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MDM4-215	ENST00000614459	CHD6	Q8TD26	2715 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MDM4-215	ENST00000614459	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MDM4-215	ENST00000614459	KRTAP10-1	P60331	282 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MDM4-215	ENST00000614459	COL6A5	A8TX70	2615 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MDM4-215	ENST00000614459	ITPR3	Q14573	2671 aa		4.03	□□□□□ -1.76
MDM4-215	ENST00000614459		A8MU10	97 aa		4.01	□□□□□ -1.77
MDM4-215	ENST00000614459	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
MDM4-215	ENST00000614459	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
MDM4-215	ENST00000614459	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4	□□□□□ -1.77
MDM4-215	ENST00000614459	LAMA3	Q16787	3333 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MDM4-215	ENST00000614459	TRIO	O75962	3097 aa		3.98	□□□□□ -1.77
MDM4-215	ENST00000614459		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
MDM4-215	ENST00000614459		H0YAA0	97 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MDM4-215	ENST00000614459	CFAP54	Q96N23	3096 aa		3.97	□□□□□ -1.77
MDM4-215	ENST00000614459	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	3.96	□□□□□ -1.78
MDM4-215	ENST00000614459	HTT	P42858	3142 aa		3.96	□□□□□ -1.78
MDM4-215	ENST00000614459	BRCA2	P51587	3418 aa		3.96	□□□□□ -1.78
MDM4-215	ENST00000614459	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		3.95	□□□□□ -1.78
MDM4-215	ENST00000614459	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		3.95	□□□□□ -1.78
MDM4-215	ENST00000614459	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
MDM4-215	ENST00000614459	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		3.95	□□□□□ -1.78
MDM4-215	ENST00000614459	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		3.95	□□□□□ -1.78
MDM4-215	ENST00000614459	REV3L	O60673	3130 aa		3.93	□□□□□ -1.78
MDM4-215	ENST00000614459	ZNF292	O60281	2723 aa		3.93	□□□□□ -1.78
MDM4-215	ENST00000614459	USP34	Q70CQ2	3546 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM4-215	ENST00000614459		A0A0C4DFX4	3053 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM4-215	ENST00000614459	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		3.91	□□□□□ -1.78
MDM4-215	ENST00000614459	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM4-215	ENST00000614459	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		3.9	□□□□□ -1.79
MDM4-215	ENST00000614459	ITPR2	Q14571	2701 aa		3.88	□□□□□ -1.79
MDM4-215	ENST00000614459	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		3.87	□□□□□ -1.79
MDM4-215	ENST00000614459	APC	P25054	2843 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MDM4-215	ENST00000614459	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		3.86	□□□□□ -1.79
MDM4-215	ENST00000614459	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
MDM4-215	ENST00000614459	TRANK1	O15050	2925 aa		3.85	□□□□□ -1.79
MDM4-215	ENST00000614459	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		3.84	□□□□□ -1.8
MDM4-215	ENST00000614459	CDH23	Q9H251	3354 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM4-215	ENST00000614459	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MDM4-215	ENST00000614459	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
MDM4-215	ENST00000614459	VCAN	P13611	3396 aa		3.82	□□□□□ -1.8
MDM4-215	ENST00000614459	ITPR1	Q14643	2758 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM4-215	ENST00000614459	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM4-215	ENST00000614459	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MDM4-215	ENST00000614459	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MDM4-215	ENST00000614459	FRYL	O94915	3013 aa		3.8	□□□□□ -1.8

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