RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583667.1

GGA3-217, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-217ENST00000583667 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-217ENST00000583667 Q9BRP9 147 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-217ENST00000583667 FAT4Q6V0I7 4981 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-217ENST00000583667 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-217ENST00000583667 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.37□□□□□ -1.23
GGA3-217ENST00000583667 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.37□□□□□ -1.23
GGA3-217ENST00000583667 BCE1O60756 84 aa7.37□□□□□ -1.23
GGA3-217ENST00000583667 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
GGA3-217ENST00000583667 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-217ENST00000583667 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.35□□□□□ -1.23
GGA3-217ENST00000583667 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
GGA3-217ENST00000583667 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.34□□□□□ -1.23
GGA3-217ENST00000583667 Q8N377 158 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-217ENST00000583667 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-217ENST00000583667 ERC2-IT1O76042 136 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-217ENST00000583667 MT1HL1P0DM35 61 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-217ENST00000583667 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-217ENST00000583667 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-217ENST00000583667 ACYP1P07311 99 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-217ENST00000583667 PDE6GP18545 87 aa7.31□□□□□ -1.24
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GGA3-217ENST00000583667 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-217ENST00000583667 PRLHP81277 87 aa7.3□□□□□ -1.24
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GGA3-217ENST00000583667 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-217ENST00000583667 UBE2AP49459 152 aa7.29□□□□□ -1.24
GGA3-217ENST00000583667 SCXQ7RTU7 201 aa7.29□□□□□ -1.24
GGA3-217ENST00000583667 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.29□□□□□ -1.24
GGA3-217ENST00000583667 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-217ENST00000583667 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-217ENST00000583667 ZNF861PO60384 105 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-217ENST00000583667 CCKP06307 115 aa7.27□□□□□ -1.25
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GGA3-217ENST00000583667 C14orf132Q9NPU4 83 aa7.26□□□□□ -1.25
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GGA3-217ENST00000583667 IGLV7-43P04211 117 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-217ENST00000583667 C1orf137Q5JT78 98 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-217ENST00000583667 Q6ZQT0 140 aa7.24□□□□□ -1.25
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GGA3-217ENST00000583667 CDIP1Q9H305 208 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-217ENST00000583667 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
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GGA3-217ENST00000583667 F8WEM9 126 aa7.17□□□□□ -1.26
GGA3-217ENST00000583667 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
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GGA3-217ENST00000583667 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.17□□□□□ -1.26
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GGA3-217ENST00000583667 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
GGA3-217ENST00000583667 IGFL1Q6UW32 110 aa7.12□□□□□ -1.27
GGA3-217ENST00000583667 FSIP2Q5CZC0 6907 aa7.12□□□□□ -1.27
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GGA3-217ENST00000583667 IMUPQ9GZP8 106 aa7.09□□□□□ -1.27
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GGA3-217ENST00000583667 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.07□□□□□ -1.28
GGA3-217ENST00000583667 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.07□□□□□ -1.28
GGA3-217ENST00000583667 A0A0U1RQV1 116 aa7.06□□□□□ -1.28
GGA3-217ENST00000583667 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.04□□□□□ -1.28
GGA3-217ENST00000583667 CXCL6P80162 114 aa7.04□□□□□ -1.28
GGA3-217ENST00000583667 SCGB1A1P11684 91 aa7.03□□□□□ -1.28
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GGA3-217ENST00000583667 NREPQ16612 68 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-217ENST00000583667 ANAPC11Q9NYG5 84 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-217ENST00000583667 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.02□□□□□ -1.29
GGA3-217ENST00000583667 MOBPQ13875 183 aa7.01□□□□□ -1.29
GGA3-217ENST00000583667 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.01□□□□□ -1.29
GGA3-217ENST00000583667 A0A0G2JQZ4 141 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-217ENST00000583667 A0A087WSZ3 146 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-217ENST00000583667 A0A087X002 238 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-217ENST00000583667 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-217ENST00000583667 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-217ENST00000583667 BPY2O14599 106 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-217ENST00000583667 KRTAP10-8P60410 259 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-217ENST00000583667 Q5XG85 94 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-217ENST00000583667 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-217ENST00000583667 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-217ENST00000583667 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-217ENST00000583667 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
GGA3-217ENST00000583667 J3KT08 172 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-217ENST00000583667 DSCR10P59022 87 aa6.91□□□□□ -1.3
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