RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559257.5

USP3-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 5

Gene USP3, Length 2,217 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-211ENST00000559257 LELP1Q5T871 98 aa4.97□□□□□ -1.61
USP3-211ENST00000559257 LRBAP50851 2863 aa4.97□□□□□ -1.61
USP3-211ENST00000559257 DCHS2Q6V1P9 2916 aa4.97□□□□□ -1.61
USP3-211ENST00000559257 A0A096LPF7 62 aa4.96□□□□□ -1.62
USP3-211ENST00000559257 CEP295Q9C0D2 2601 aa4.96□□□□□ -1.62
USP3-211ENST00000559257 DEFB130BP0DP73 79 aa4.96□□□□□ -1.62
USP3-211ENST00000559257 DEFB130AP0DP74 79 aa4.96□□□□□ -1.62
USP3-211ENST00000559257 Q96NJ1 140 aa4.96□□□□□ -1.62
USP3-211ENST00000559257 SPRR1BP22528 89 aa4.95□□□□□ -1.62
USP3-211ENST00000559257 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa4.95□□□□□ -1.62
USP3-211ENST00000559257 IGF2RP11717 2491 aa4.95□□□□□ -1.62
USP3-211ENST00000559257 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa4.95□□□□□ -1.62
USP3-211ENST00000559257 C15orf56Q8N910 161 aa4.95□□□□□ -1.62
USP3-211ENST00000559257 A0A1B0GVX0 72 aa4.94□□□□□ -1.62
USP3-211ENST00000559257 ATRXP46100 2492 aa4.94□□□□□ -1.62
USP3-211ENST00000559257 ANAPC11Q9NYG5 84 aa4.93□□□□□ -1.62
USP3-211ENST00000559257 CSPG4Q6UVK1 2322 aa4.93□□□□□ -1.62
USP3-211ENST00000559257 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa4.92□□□□□ -1.62
USP3-211ENST00000559257 H0YAA0 97 aa4.92□□□□□ -1.62
USP3-211ENST00000559257 PANO1I0J062 215 aa4.92□□□□□ -1.62
USP3-211ENST00000559257 J3QL48 77 aa4.91□□□□□ -1.62
USP3-211ENST00000559257 XP32Q5T750 250 aa4.91□□□□□ -1.62
USP3-211ENST00000559257 SPTBN4Q9H254 2564 aa4.9□□□□□ -1.62
USP3-211ENST00000559257 COL12A1Q99715 3063 aa4.9□□□□□ -1.62
USP3-211ENST00000559257 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa4.9□□□□□ -1.63
USP3-211ENST00000559257 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa4.89□□□□□ -1.63
USP3-211ENST00000559257 OTOGQ6ZRI0 2925 aa4.89□□□□□ -1.63
USP3-211ENST00000559257 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa4.89□□□□□ -1.63
USP3-211ENST00000559257 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-211ENST00000559257 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
USP3-211ENST00000559257 K7EIL1 84 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-211ENST00000559257 Q6ZSA8 131 aa4.88□□□□□ -1.63
USP3-211ENST00000559257 CREBBPQ92793 2442 aa4.87□□□□□ -1.63
USP3-211ENST00000559257 ITPR1Q14643 2758 aa4.87□□□□□ -1.63
USP3-211ENST00000559257 NOTCH3Q9UM47 2321 aa4.87□□□□□ -1.63
USP3-211ENST00000559257 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
USP3-211ENST00000559257 CRIPTQ9P021 101 aa4.86□□□□□ -1.63
USP3-211ENST00000559257 KRTAP10-9P60411 292 aa4.85□□□□□ -1.63
USP3-211ENST00000559257 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa4.85□□□□□ -1.63
USP3-211ENST00000559257 PIEZO1Q92508 2521 aa4.85□□□□□ -1.63
USP3-211ENST00000559257 IGKV2-30P06310 120 aa4.82□□□□□ -1.64
USP3-211ENST00000559257 SPG11Q96JI7 2443 aa4.82□□□□□ -1.64
USP3-211ENST00000559257 RELNP78509 3460 aa4.82□□□□□ -1.64
USP3-211ENST00000559257 SPART-AS1P0CW21 52 aa4.82□□□□□ -1.64
USP3-211ENST00000559257 TENM2Q9NT68 2774 aa4.82□□□□□ -1.64
USP3-211ENST00000559257 TPRXLQ17RH7 258 aa4.81□□□□□ -1.64
USP3-211ENST00000559257 H3BNG1 76 aa4.81□□□□□ -1.64
USP3-211ENST00000559257 AKAP9Q99996 3911 aa4.81□□□□□ -1.64
USP3-211ENST00000559257 CHD8Q9HCK8 2581 aa4.8□□□□□ -1.64
USP3-211ENST00000559257 FAM229AH3BQW9 127 aa4.8□□□□□ -1.64
USP3-211ENST00000559257 KRTAP1-1Q07627 177 aa4.8□□□□□ -1.64
USP3-211ENST00000559257 A0A1B0GU33 70 aa4.8□□□□□ -1.64
USP3-211ENST00000559257 NCOR2Q9Y618 2525 aa4.79□□□□□ -1.64
USP3-211ENST00000559257 PKD1L2Q7Z442 2459 aa4.79□□□□□ -1.64
USP3-211ENST00000559257 PRLHP81277 87 aa4.79□□□□□ -1.64
USP3-211ENST00000559257 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa4.78□□□□□ -1.64
USP3-211ENST00000559257 DEFB135Q30KP9 77 aa4.77□□□□□ -1.65
USP3-211ENST00000559257 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa4.77□□□□□ -1.65
USP3-211ENST00000559257 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa4.77□□□□□ -1.65
USP3-211ENST00000559257 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa4.77□□□□□ -1.65
USP3-211ENST00000559257 SVEP1Q4LDE5 3571 aa4.77□□□□□ -1.65
USP3-211ENST00000559257 CELSR2Q9HCU4 2923 aa4.77□□□□□ -1.65
USP3-211ENST00000559257 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
USP3-211ENST00000559257 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
USP3-211ENST00000559257 ACACBO00763 2458 aa4.75□□□□□ -1.65
USP3-211ENST00000559257 CACNA1AO00555 2505 aa4.74□□□□□ -1.65
USP3-211ENST00000559257 EPG5Q9HCE0 2579 aa4.74□□□□□ -1.65
USP3-211ENST00000559257 NAV2Q8IVL1 2488 aa4.74□□□□□ -1.65
USP3-211ENST00000559257 MYO9AB2RTY4 2548 aa4.73□□□□□ -1.65
USP3-211ENST00000559257 KRTAP10-3P60369 221 aa4.72□□□□□ -1.65
USP3-211ENST00000559257 HTN3P15516 51 aa4.72□□□□□ -1.65
USP3-211ENST00000559257 VPS13CQ709C8 3753 aa4.71□□□□□ -1.66
USP3-211ENST00000559257 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
USP3-211ENST00000559257 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa4.7□□□□□ -1.66
USP3-211ENST00000559257 DEFB4AO15263 64 aa4.7□□□□□ -1.66
USP3-211ENST00000559257 LINC01556Q5JQF7 62 aa4.7□□□□□ -1.66
USP3-211ENST00000559257 FAM208BQ5VWN6 2430 aa4.7□□□□□ -1.66
USP3-211ENST00000559257 PTPN13Q12923 2485 aa4.69□□□□□ -1.66
USP3-211ENST00000559257 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa4.69□□□□□ -1.66
USP3-211ENST00000559257 TLN2Q9Y4G6 2542 aa4.68□□□□□ -1.66
USP3-211ENST00000559257 A0A096LNI7 61 aa4.68□□□□□ -1.66
USP3-211ENST00000559257 COX6B2Q6YFQ2 88 aa4.68□□□□□ -1.66
USP3-211ENST00000559257 J3QKU1 62 aa4.68□□□□□ -1.66
USP3-211ENST00000559257 IGSF10Q6WRI0 2623 aa4.68□□□□□ -1.66
USP3-211ENST00000559257 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
USP3-211ENST00000559257 MYO18BQ8IUG5 2567 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-211ENST00000559257 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
USP3-211ENST00000559257 MXRA5Q9NR99 2828 aa4.67□□□□□ -1.66
USP3-211ENST00000559257 FBN2P35556 2912 aa4.66□□□□□ -1.66
USP3-211ENST00000559257 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
USP3-211ENST00000559257 CFAP46Q8IYW2 2715 aa4.66□□□□□ -1.66
USP3-211ENST00000559257 TEX15Q9BXT5 2789 aa4.65□□□□□ -1.66
USP3-211ENST00000559257 USP24Q9UPU5 2620 aa4.65□□□□□ -1.66
USP3-211ENST00000559257 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa4.65□□□□□ -1.66
USP3-211ENST00000559257 LRRK2Q5S007 2527 aa4.65□□□□□ -1.67
USP3-211ENST00000559257 ITPR3Q14573 2671 aa4.65□□□□□ -1.67
USP3-211ENST00000559257 ZNF462Q96JM2 2506 aa4.64□□□□□ -1.67
USP3-211ENST00000559257 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa4.64□□□□□ -1.67
USP3-211ENST00000559257 FLNCQ14315 2725 aa4.64□□□□□ -1.67
USP3-211ENST00000559257 POLQO75417 2590 aa4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms