RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DEFB4AO15263 64 aa-3.1□□□□□ -2.91
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP-3.1□□□□□ -2.91
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FREM2Q5SZK8 3169 aa-3.1□□□□□ -2.91
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MLH3Q9UHC1 1453 aa-3.1□□□□□ -2.91
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UQCRHP07919 91 aa-3.11□□□□□ -2.91
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ALKAL2Q6UX46 152 aa-3.11□□□□□ -2.91
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FYCO1Q9BQS8 1478 aa-3.11□□□□□ -2.91
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa-3.12□□□□□ -2.91
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CHD1O14646 1710 aa-3.12□□□□□ -2.91
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RGPD1P0DJD0 1748 aa-3.12□□□□□ -2.91
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TEX14Q8IWB6 1497 aa-3.12□□□□□ -2.91
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP-3.12□□□□□ -2.91
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa-3.12□□□□□ -2.91
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HMGN3Q15651 99 aa-3.13□□□□□ -2.91
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP-3.13□□□□□ -2.91
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa-3.13□□□□□ -2.91
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ABCC2Q92887 1545 aa-3.14□□□□□ -2.91
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa-3.14□□□□□ -2.91
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NESP48681 1621 aa-3.14□□□□□ -2.91
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa-3.14□□□□□ -2.91
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LCE6AA0A183 80 aa-3.14□□□□□ -2.91
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IQCF6A8MYZ5 107 aa-3.14□□□□□ -2.91
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MPC2O95563 127 aa-3.14□□□□□ -2.91
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa-3.14□□□□□ -2.91
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa-3.14□□□□□ -2.91
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa-3.15□□□□□ -2.91
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZFHX4Q86UP3 3567 aa-3.15□□□□□ -2.91
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NDUFC1O43677 76 aa-3.15□□□□□ -2.91
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SNAPC5O75971 98 aa-3.15□□□□□ -2.91
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ETDBQ3ZM63 59 aa-3.15□□□□□ -2.91
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SVBPQ8N300 66 aa-3.15□□□□□ -2.91
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa-3.15□□□□□ -2.91
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PKD1L3Q7Z443 1732 aa-3.16□□□□□ -2.91
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NWD1Q149M9 1564 aa-3.16□□□□□ -2.91
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP-3.16□□□□□ -2.91
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MYOM2P54296 1465 aa-3.16□□□□□ -2.92
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRAV21A0A0B4J279 112 aa-3.17□□□□□ -2.92
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP-3.18□□□□□ -2.92
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa-3.18□□□□□ -2.92
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NDUFA2O43678 99 aa-3.18□□□□□ -2.92
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 WT1-ASQ06250 92 aa-3.18□□□□□ -2.92
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A1B0GUT8 65 aa-3.19□□□□□ -2.92
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CFAP54Q96N23 3096 aa-3.19□□□□□ -2.92
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP-3.2□□□□□ -2.92
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MAST1Q9Y2H9 1570 aa-3.2□□□□□ -2.92
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa-3.21□□□□□ -2.92
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GNGT2O14610 69 aa-3.21□□□□□ -2.92
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa-3.21□□□□□ -2.92
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP-3.22□□□□□ -2.93
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MYO15AQ9UKN7 3530 aa-3.22□□□□□ -2.93
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa-3.23□□□□□ -2.93
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF720Q7Z2F6 126 aa-3.23□□□□□ -2.93
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DOT1LQ8TEK3 1739 aa-3.23□□□□□ -2.93
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP-3.24□□□□□ -2.93
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP-3.24□□□□□ -2.93
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LINC01546A6NGU7 62 aa-3.24□□□□□ -2.93
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP-3.24□□□□□ -2.93
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NRKQ7Z2Y5 1582 aa-3.25□□□□□ -2.93
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ACYP1P07311 99 aa-3.25□□□□□ -2.93
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PPP3R1P63098 170 aa-3.25□□□□□ -2.93
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LY75O60449 1722 aa-3.25□□□□□ -2.93
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PZPP20742 1482 aa-3.27□□□□□ -2.93
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPS27P42677 84 aaKnown RBP-3.27□□□□□ -2.93
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PLGLAQ15195 96 aa-3.27□□□□□ -2.93
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP-3.27□□□□□ -2.93
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PLIN4Q96Q06 1357 aa-3.27□□□□□ -2.93
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GNG4P50150 75 aa-3.28□□□□□ -2.93
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PMCHL2Q9BQD1 86 aa-3.28□□□□□ -2.93
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ITSN2Q9NZM3 1697 aa-3.28□□□□□ -2.93
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ABCA3Q99758 1704 aa-3.29□□□□□ -2.94
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATOX1O00244 68 aa-3.3□□□□□ -2.94
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MT-ATP8P03928 68 aa-3.3□□□□□ -2.94
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCDC58Q4VC31 144 aa-3.3□□□□□ -2.94
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MYH4Q9Y623 1939 aa-3.31□□□□□ -2.94
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MT1FP04733 61 aa-3.31□□□□□ -2.94
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SMARCA2P51531 1590 aa-3.31□□□□□ -2.94
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CORTO00230 105 aa-3.32□□□□□ -2.94
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CYB5AP00167 134 aa-3.32□□□□□ -2.94
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DIP2BQ9P265 1576 aa-3.33□□□□□ -2.94
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UQCRHLA0A096LP55 91 aa-3.33□□□□□ -2.94
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP-3.33□□□□□ -2.94
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP-3.33□□□□□ -2.94
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa-3.33□□□□□ -2.94
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa-3.34□□□□□ -2.94
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NCOA2Q15596 1464 aa-3.35□□□□□ -2.94
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 VPS13CQ709C8 3753 aa-3.35□□□□□ -2.95
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LTN1O94822 1766 aa-3.35□□□□□ -2.95
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 S100A1P23297 94 aa-3.35□□□□□ -2.95
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAUP35544 74 aaKnown RBP-3.36□□□□□ -2.95
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa-3.36□□□□□ -2.95
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KIF1AQ12756 1690 aa-3.36□□□□□ -2.95
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPEGQ15772 3267 aa-3.37□□□□□ -2.95
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa-3.37□□□□□ -2.95
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 M0QZ58 72 aa-3.37□□□□□ -2.95
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NDUFA4O00483 81 aa-3.37□□□□□ -2.95
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa-3.37□□□□□ -2.95
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM203Q969S6 136 aa-3.37□□□□□ -2.95
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NALCNQ8IZF0 1738 aa-3.37□□□□□ -2.95
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATP10BO94823 1461 aa-3.37□□□□□ -2.95
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCNB3Q8WWL7 1395 aa-3.38□□□□□ -2.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.9 ms