RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486420.1

C9orf16-202, Transcript of chromosome 9 open reading frame 16, humanhuman

TSL 5

Gene C9orf16, Length 434 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16-202ENST00000486420 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf16-202ENST00000486420 PRO1933Q9H354 126 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf16-202ENST00000486420 DNAL4O96015 105 aa7.23□□□□□ -1.25
C9orf16-202ENST00000486420 Q6ZQY7 126 aa7.23□□□□□ -1.25
C9orf16-202ENST00000486420 CD164Q04900 197 aa7.22□□□□□ -1.25
C9orf16-202ENST00000486420 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.21□□□□□ -1.26
C9orf16-202ENST00000486420 Q6JHZ5 121 aa7.21□□□□□ -1.26
C9orf16-202ENST00000486420 LIMD2Q9BT23 127 aa7.21□□□□□ -1.26
C9orf16-202ENST00000486420 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.21□□□□□ -1.26
C9orf16-202ENST00000486420 TRIAP1O43715 76 aa7.19□□□□□ -1.26
C9orf16-202ENST00000486420 Q8N377 158 aa7.19□□□□□ -1.26
C9orf16-202ENST00000486420 UBR4Q5T4S7 5183 aa7.18□□□□□ -1.26
C9orf16-202ENST00000486420 TSPAN13O95857 204 aa7.18□□□□□ -1.26
C9orf16-202ENST00000486420 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.18□□□□□ -1.26
C9orf16-202ENST00000486420 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
C9orf16-202ENST00000486420 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
C9orf16-202ENST00000486420 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.16□□□□□ -1.26
C9orf16-202ENST00000486420 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.16□□□□□ -1.26
C9orf16-202ENST00000486420 K7ERJ3 54 aa7.16□□□□□ -1.26
C9orf16-202ENST00000486420 SMIM29Q86T20 159 aa7.16□□□□□ -1.26
C9orf16-202ENST00000486420 LRP2P98164 4655 aa7.16□□□□□ -1.26
C9orf16-202ENST00000486420 TRACP01848 142 aa7.15□□□□□ -1.26
C9orf16-202ENST00000486420 PRR4Q16378 134 aa7.15□□□□□ -1.26
C9orf16-202ENST00000486420 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.15□□□□□ -1.26
C9orf16-202ENST00000486420 Q5XG85 94 aa7.13□□□□□ -1.27
C9orf16-202ENST00000486420 CLEC2BQ92478 149 aa7.13□□□□□ -1.27
C9orf16-202ENST00000486420 TCL1BO95988 128 aa7.12□□□□□ -1.27
C9orf16-202ENST00000486420 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.11□□□□□ -1.27
C9orf16-202ENST00000486420 LST1O00453 97 aa7.11□□□□□ -1.27
C9orf16-202ENST00000486420 FABP2P12104 132 aa7.11□□□□□ -1.27
C9orf16-202ENST00000486420 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
C9orf16-202ENST00000486420 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.11□□□□□ -1.27
C9orf16-202ENST00000486420 ATXN8Q156A1 80 aa7.1□□□□□ -1.27
C9orf16-202ENST00000486420 UBE2V1Q13404 147 aa7.09□□□□□ -1.27
C9orf16-202ENST00000486420 BATFQ16520 125 aa7.08□□□□□ -1.28
C9orf16-202ENST00000486420 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.08□□□□□ -1.28
C9orf16-202ENST00000486420 TPRXLQ17RH7 258 aa7.08□□□□□ -1.28
C9orf16-202ENST00000486420 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.08□□□□□ -1.28
C9orf16-202ENST00000486420 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.07□□□□□ -1.28
C9orf16-202ENST00000486420 H3BMG7 143 aa7.07□□□□□ -1.28
C9orf16-202ENST00000486420 Q6Q795 121 aa7.07□□□□□ -1.28
C9orf16-202ENST00000486420 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.05□□□□□ -1.28
C9orf16-202ENST00000486420 TEN1Q86WV5 123 aa7.05□□□□□ -1.28
C9orf16-202ENST00000486420 IGFL1Q6UW32 110 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf16-202ENST00000486420 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf16-202ENST00000486420 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf16-202ENST00000486420 C9orf118A6NHY6 69 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf16-202ENST00000486420 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf16-202ENST00000486420 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf16-202ENST00000486420 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf16-202ENST00000486420 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf16-202ENST00000486420 H3BUT2 72 aa7.01□□□□□ -1.29
C9orf16-202ENST00000486420 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.01□□□□□ -1.29
C9orf16-202ENST00000486420 DSCR8Q96T75 97 aa7.01□□□□□ -1.29
C9orf16-202ENST00000486420 CDIP1Q9H305 208 aa7.01□□□□□ -1.29
C9orf16-202ENST00000486420 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7□□□□□ -1.29
C9orf16-202ENST00000486420 PDE6GP18545 87 aa7□□□□□ -1.29
C9orf16-202ENST00000486420 RBM3P98179 157 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
C9orf16-202ENST00000486420 A0A1B0GW54 56 aa6.99□□□□□ -1.29
C9orf16-202ENST00000486420 A0A1W2PPM0 123 aa6.99□□□□□ -1.29
C9orf16-202ENST00000486420 LPAP08519 4548 aa6.98□□□□□ -1.29
C9orf16-202ENST00000486420 TAX1BP3O14907 124 aa6.97□□□□□ -1.29
C9orf16-202ENST00000486420 RNF213Q63HN8 5207 aa6.96□□□□□ -1.29
C9orf16-202ENST00000486420 C9JAW5 83 aa6.96□□□□□ -1.3
C9orf16-202ENST00000486420 H3BT86 120 aa6.96□□□□□ -1.3
C9orf16-202ENST00000486420 C1orf195Q5TG92 126 aa6.95□□□□□ -1.3
C9orf16-202ENST00000486420 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
C9orf16-202ENST00000486420 CCKP06307 115 aa6.94□□□□□ -1.3
C9orf16-202ENST00000486420 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.94□□□□□ -1.3
C9orf16-202ENST00000486420 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.92□□□□□ -1.3
C9orf16-202ENST00000486420 A0A087WSZ3 146 aa6.91□□□□□ -1.3
C9orf16-202ENST00000486420 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.91□□□□□ -1.3
C9orf16-202ENST00000486420 A0A0G2JQZ4 141 aa6.91□□□□□ -1.3
C9orf16-202ENST00000486420 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.91□□□□□ -1.3
C9orf16-202ENST00000486420 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.91□□□□□ -1.3
C9orf16-202ENST00000486420 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.9□□□□□ -1.3
C9orf16-202ENST00000486420 A0A1W2PNM2 257 aa6.89□□□□□ -1.31
C9orf16-202ENST00000486420 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.89□□□□□ -1.31
C9orf16-202ENST00000486420 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
C9orf16-202ENST00000486420 VPS25Q9BRG1 176 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf16-202ENST00000486420 A0A1B0GV72 72 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf16-202ENST00000486420 J3KT08 172 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf16-202ENST00000486420 XP32Q5T750 250 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf16-202ENST00000486420 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf16-202ENST00000486420 A0A0U1RQV1 116 aa6.84□□□□□ -1.31
C9orf16-202ENST00000486420 K7EP34 96 aa6.84□□□□□ -1.31
C9orf16-202ENST00000486420 Q6ZQT0 140 aa6.84□□□□□ -1.31
C9orf16-202ENST00000486420 F8W1H4 67 aa6.81□□□□□ -1.32
C9orf16-202ENST00000486420 SIGMAR1Q99720 223 aa6.81□□□□□ -1.32
C9orf16-202ENST00000486420 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.81□□□□□ -1.32
C9orf16-202ENST00000486420 IGKV4-1P06312 121 aa6.8□□□□□ -1.32
C9orf16-202ENST00000486420 C9orf92A6NGG3 77 aa6.79□□□□□ -1.32
C9orf16-202ENST00000486420 NDUFB1O75438 58 aa6.79□□□□□ -1.32
C9orf16-202ENST00000486420 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.79□□□□□ -1.32
C9orf16-202ENST00000486420 Q96NJ1 140 aa6.78□□□□□ -1.32
C9orf16-202ENST00000486420 NREPQ16612 68 aa6.77□□□□□ -1.33
C9orf16-202ENST00000486420 C8orf87E5RJ46 101 aa6.76□□□□□ -1.33
C9orf16-202ENST00000486420 LINC00313P59037 77 aa6.75□□□□□ -1.33
C9orf16-202ENST00000486420 MUC2Q02817 5179 aa6.74□□□□□ -1.33
C9orf16-202ENST00000486420 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 104.9 ms