RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CELSR2Q9HCU4 2923 aa10.71□□□□□ -0.7
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q96NJ1 140 aa10.7□□□□□ -0.7
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRR15Q8IV56 129 aa10.7□□□□□ -0.7
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A087WTM6 91 aa10.7□□□□□ -0.7
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TLX1NBP0CAT3 122 aa10.69□□□□□ -0.7
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KLKP1Q107X0 134 aa10.68□□□□□ -0.7
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LINC00336Q6ZUF6 198 aa10.68□□□□□ -0.7
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LINC01600Q96MT4 127 aa10.68□□□□□ -0.7
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa10.67□□□□□ -0.7
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COA5Q86WW8 74 aa10.67□□□□□ -0.7
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa10.67□□□□□ -0.7
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF861PO60384 105 aa10.67□□□□□ -0.7
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CD164Q04900 197 aa10.66□□□□□ -0.7
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 H7BZZ5 65 aa10.66□□□□□ -0.7
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WIPF1O43516 503 aa10.66□□□□□ -0.7
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZANQ9Y493 2812 aa10.65□□□□□ -0.7
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UQCR11O14957 56 aa10.65□□□□□ -0.7
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DSCR10P59022 87 aa10.65□□□□□ -0.7
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa10.64□□□□□ -0.71
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C8orf17Q9NRJ1 99 aa10.64□□□□□ -0.71
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM229AH3BQW9 127 aa10.63□□□□□ -0.71
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa10.63□□□□□ -0.71
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa10.62□□□□□ -0.71
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HIVEP1P15822 2718 aa10.62□□□□□ -0.71
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LOC400499M0QZD8 3231 aa10.61□□□□□ -0.71
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 APLNQ9ULZ1 77 aa10.6□□□□□ -0.71
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 USP34Q70CQ2 3546 aa10.58□□□□□ -0.71
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A1B0GVX0 72 aa10.58□□□□□ -0.72
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q8NDZ9 215 aa10.58□□□□□ -0.72
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CNBPP62633 177 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa10.55□□□□□ -0.72
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa10.54□□□□□ -0.72
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPRR4Q96PI1 79 aa10.53□□□□□ -0.72
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MIR22HGQ0VDD5 57 aa10.53□□□□□ -0.72
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MYO15AQ9UKN7 3530 aa10.53□□□□□ -0.72
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LCA10Q71F78 164 aa10.51□□□□□ -0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGLV7-43P04211 117 aa10.51□□□□□ -0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C9orf92A6NGG3 77 aa10.51□□□□□ -0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DCHS2Q6V1P9 2916 aa10.5□□□□□ -0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa10.49□□□□□ -0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP10.49□□□□□ -0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CRIPTQ9P021 101 aa10.48□□□□□ -0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LINC00304Q8N9R0 145 aa10.47□□□□□ -0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 APCP25054 2843 aa10.47□□□□□ -0.73
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NF1P21359 2839 aa10.46□□□□□ -0.74
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa10.45□□□□□ -0.74
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TNP2Q05952 138 aa10.44□□□□□ -0.74
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OCR1Q9BZK8 76 aa10.42□□□□□ -0.74
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TENM4Q6N022 2769 aa10.4□□□□□ -0.74
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FBN2P35556 2912 aa10.37□□□□□ -0.75
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRR26Q8N8Z3 221 aa10.34□□□□□ -0.75
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q8N1X5 172 aa10.34□□□□□ -0.75
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CYSTM1Q9H1C7 97 aa10.33□□□□□ -0.76
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa10.33□□□□□ -0.76
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa10.33□□□□□ -0.76
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa10.31□□□□□ -0.76
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MUC3AQ02505 3323 aa10.27□□□□□ -0.77
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPRR1AP35321 89 aa10.27□□□□□ -0.77
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 J3QL48 77 aa10.26□□□□□ -0.77
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q1T7F1 81 aa10.22□□□□□ -0.77
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa10.22□□□□□ -0.77
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COX6B2Q6YFQ2 88 aa10.17□□□□□ -0.78
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa10.16□□□□□ -0.78
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DCHS1Q96JQ0 3298 aa10.15□□□□□ -0.78
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LUZP6Q538Z0 58 aa10.15□□□□□ -0.78
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa10.14□□□□□ -0.79
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A0D9SG42 100 aa10.13□□□□□ -0.79
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM229BQ4G0N7 80 aa10.13□□□□□ -0.79
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HRES1P13985 223 aa10.12□□□□□ -0.79
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLAC8Q9NZF1 115 aa10.11□□□□□ -0.79
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa10.1□□□□□ -0.79
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DMDP11532 3685 aa10.1□□□□□ -0.79
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LINC00472Q9H8W2 130 aa10.1□□□□□ -0.79
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LINC01554Q52M75 96 aa10.09□□□□□ -0.79
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TENM3Q9P273 2699 aa10.09□□□□□ -0.79
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa10.08□□□□□ -0.8
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RELNP78509 3460 aa10.07□□□□□ -0.8
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q75L30 129 aa10.06□□□□□ -0.8
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPRR1BP22528 89 aa10.05□□□□□ -0.8
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PANO1I0J062 215 aa10.05□□□□□ -0.8
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LAMA5O15230 3695 aa10.04□□□□□ -0.8
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q5XG85 94 aa10.03□□□□□ -0.8
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 H3BS24 57 aa10□□□□□ -0.81
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MXRA5Q9NR99 2828 aa10□□□□□ -0.81
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP10-2P60368 255 aa9.97□□□□□ -0.81
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OXTP01178 125 aa9.97□□□□□ -0.81
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A1B0GU33 70 aa9.96□□□□□ -0.81
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa9.95□□□□□ -0.82
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRAC1Q96KF2 57 aa9.94□□□□□ -0.82
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q5W150 140 aa9.93□□□□□ -0.82
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRTAP10-1P60331 282 aa9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.3 ms