RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479054.5

NISCH-207, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,173 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-207ENST00000479054 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
NISCH-207ENST00000479054 COA5Q86WW8 74 aa8.84□□□□□ -0.99
NISCH-207ENST00000479054 MUC3AQ02505 3323 aa8.83□□□□□ -1
NISCH-207ENST00000479054 A8MWP4 228 aa8.83□□□□□ -1
NISCH-207ENST00000479054 K7EQZ3 153 aa8.82□□□□□ -1
NISCH-207ENST00000479054 ZZEF1O43149 2961 aa8.82□□□□□ -1
NISCH-207ENST00000479054 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa8.82□□□□□ -1
NISCH-207ENST00000479054 STAB1Q9NY15 2570 aa8.82□□□□□ -1
NISCH-207ENST00000479054 LOC400499M0QZD8 3231 aa8.81□□□□□ -1
NISCH-207ENST00000479054 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
NISCH-207ENST00000479054 ITPR1Q14643 2758 aa8.81□□□□□ -1
NISCH-207ENST00000479054 LCA10Q71F78 164 aa8.81□□□□□ -1
NISCH-207ENST00000479054 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
NISCH-207ENST00000479054 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa8.79□□□□□ -1
NISCH-207ENST00000479054 NOTCH1P46531 2555 aa8.79□□□□□ -1
NISCH-207ENST00000479054 TACC2O95359 2948 aa8.78□□□□□ -1
NISCH-207ENST00000479054 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa8.78□□□□□ -1
NISCH-207ENST00000479054 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa8.77□□□□□ -1.01
NISCH-207ENST00000479054 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa8.76□□□□□ -1.01
NISCH-207ENST00000479054 TNP2Q05952 138 aa8.76□□□□□ -1.01
NISCH-207ENST00000479054 Q8N377 158 aa8.75□□□□□ -1.01
NISCH-207ENST00000479054 CYSTM1Q9H1C7 97 aa8.75□□□□□ -1.01
NISCH-207ENST00000479054 IGFL1Q6UW32 110 aa8.75□□□□□ -1.01
NISCH-207ENST00000479054 SPRR4Q96PI1 79 aa8.75□□□□□ -1.01
NISCH-207ENST00000479054 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
NISCH-207ENST00000479054 A0A1W2PNN7 141 aa8.74□□□□□ -1.01
NISCH-207ENST00000479054 Q1T7F1 81 aa8.72□□□□□ -1.01
NISCH-207ENST00000479054 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa8.71□□□□□ -1.01
NISCH-207ENST00000479054 A0A1B0GVX0 72 aa8.7□□□□□ -1.02
NISCH-207ENST00000479054 C8orf17Q9NRJ1 99 aa8.7□□□□□ -1.02
NISCH-207ENST00000479054 ITPR2Q14571 2701 aa8.7□□□□□ -1.02
NISCH-207ENST00000479054 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa8.69□□□□□ -1.02
NISCH-207ENST00000479054 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
NISCH-207ENST00000479054 ASPMQ8IZT6 3477 aa8.68□□□□□ -1.02
NISCH-207ENST00000479054 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa8.68□□□□□ -1.02
NISCH-207ENST00000479054 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa8.67□□□□□ -1.02
NISCH-207ENST00000479054 DSCR10P59022 87 aa8.67□□□□□ -1.02
NISCH-207ENST00000479054 UQCR11O14957 56 aa8.65□□□□□ -1.02
NISCH-207ENST00000479054 OXTP01178 125 aa8.64□□□□□ -1.03
NISCH-207ENST00000479054 OCR1Q9BZK8 76 aa8.64□□□□□ -1.03
NISCH-207ENST00000479054 SPINT4Q6UDR6 99 aa8.64□□□□□ -1.03
NISCH-207ENST00000479054 LCE6AA0A183 80 aa8.64□□□□□ -1.03
NISCH-207ENST00000479054 C9orf92A6NGG3 77 aa8.64□□□□□ -1.03
NISCH-207ENST00000479054 FAM229BQ4G0N7 80 aa8.64□□□□□ -1.03
NISCH-207ENST00000479054 BAHCC1Q9P281 2608 aa8.63□□□□□ -1.03
NISCH-207ENST00000479054 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa8.63□□□□□ -1.03
NISCH-207ENST00000479054 APCP25054 2843 aa8.62□□□□□ -1.03
NISCH-207ENST00000479054 A0A0G2JQZ4 141 aa8.62□□□□□ -1.03
NISCH-207ENST00000479054 MIR22HGQ0VDD5 57 aa8.62□□□□□ -1.03
NISCH-207ENST00000479054 ZANQ9Y493 2812 aa8.62□□□□□ -1.03
NISCH-207ENST00000479054 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
NISCH-207ENST00000479054 A0A1W2PNM2 257 aa8.59□□□□□ -1.03
NISCH-207ENST00000479054 Q8NDZ9 215 aa8.59□□□□□ -1.03
NISCH-207ENST00000479054 PLAC8Q9NZF1 115 aa8.59□□□□□ -1.03
NISCH-207ENST00000479054 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa8.59□□□□□ -1.03
NISCH-207ENST00000479054 ANAPC11Q9NYG5 84 aa8.58□□□□□ -1.04
NISCH-207ENST00000479054 ZFHX4Q86UP3 3567 aa8.57□□□□□ -1.04
NISCH-207ENST00000479054 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa8.56□□□□□ -1.04
NISCH-207ENST00000479054 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-207ENST00000479054 HIVEP1P15822 2718 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-207ENST00000479054 Q6ZSA8 131 aa8.53□□□□□ -1.04
NISCH-207ENST00000479054 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa8.53□□□□□ -1.04
NISCH-207ENST00000479054 LAMA5O15230 3695 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-207ENST00000479054 H3BS24 57 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-207ENST00000479054 Q75L30 129 aa8.51□□□□□ -1.05
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.51□□□□□ -1.05
NISCH-207ENST00000479054 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
NISCH-207ENST00000479054 PRR26Q8N8Z3 221 aa8.49□□□□□ -1.05
NISCH-207ENST00000479054 SPRR1AP35321 89 aa8.46□□□□□ -1.06
NISCH-207ENST00000479054 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
NISCH-207ENST00000479054 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.45□□□□□ -1.06
NISCH-207ENST00000479054 LINC01554Q52M75 96 aa8.45□□□□□ -1.06
NISCH-207ENST00000479054 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa8.45□□□□□ -1.06
NISCH-207ENST00000479054 Q5VV11 94 aa8.44□□□□□ -1.06
NISCH-207ENST00000479054 DCHS1Q96JQ0 3298 aa8.43□□□□□ -1.06
NISCH-207ENST00000479054 Q5VSD8 79 aa8.42□□□□□ -1.06
NISCH-207ENST00000479054 CELSR2Q9HCU4 2923 aa8.41□□□□□ -1.06
NISCH-207ENST00000479054 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP8.4□□□□□ -1.062e-6■□□□□ 11.3
NISCH-207ENST00000479054 PRAC1Q96KF2 57 aa8.4□□□□□ -1.06
NISCH-207ENST00000479054 NF1P21359 2839 aa8.39□□□□□ -1.07
NISCH-207ENST00000479054 RELNP78509 3460 aa8.39□□□□□ -1.07
NISCH-207ENST00000479054 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa8.38□□□□□ -1.07
NISCH-207ENST00000479054 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
NISCH-207ENST00000479054 DCHS2Q6V1P9 2916 aa8.37□□□□□ -1.07
NISCH-207ENST00000479054 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
NISCH-207ENST00000479054 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
NISCH-207ENST00000479054 FBN2P35556 2912 aa8.35□□□□□ -1.07
NISCH-207ENST00000479054 SPRR1BP22528 89 aa8.34□□□□□ -1.07
NISCH-207ENST00000479054 M0R2T5 61 aa8.33□□□□□ -1.08
NISCH-207ENST00000479054 CRIPTQ9P021 101 aa8.33□□□□□ -1.08
NISCH-207ENST00000479054 Q6ZR54 194 aa8.32□□□□□ -1.08
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP10-1P60331 282 aa8.31□□□□□ -1.08
NISCH-207ENST00000479054 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
NISCH-207ENST00000479054 MXRA5Q9NR99 2828 aa8.28□□□□□ -1.08
NISCH-207ENST00000479054 SPINK7P58062 85 aa8.27□□□□□ -1.09
NISCH-207ENST00000479054 STAB2Q8WWQ8 2551 aa8.26□□□□□ -1.09
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP10-2P60368 255 aa8.26□□□□□ -1.09
NISCH-207ENST00000479054 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms