RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462507.1

FBXO18-206, Transcript of F-box DNA helicase 1, humanhuman

TSL 2

Gene FBXO18, Length 906 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO18-206ENST00000462507 A0A087X002 238 aa7.24□□□□□ -1.25
FBXO18-206ENST00000462507 SNCGO76070 127 aa7.24□□□□□ -1.25
FBXO18-206ENST00000462507 ATXN8Q156A1 80 aa7.24□□□□□ -1.25
FBXO18-206ENST00000462507 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
FBXO18-206ENST00000462507 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.24□□□□□ -1.25
FBXO18-206ENST00000462507 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
FBXO18-206ENST00000462507 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.23□□□□□ -1.25
FBXO18-206ENST00000462507 TRACP01848 142 aa7.23□□□□□ -1.25
FBXO18-206ENST00000462507 GAGE2AQ6NT46 116 aa7.23□□□□□ -1.25
FBXO18-206ENST00000462507 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.23□□□□□ -1.25
FBXO18-206ENST00000462507 ANAPC11Q9NYG5 84 aa7.23□□□□□ -1.25
FBXO18-206ENST00000462507 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.23□□□□□ -1.25
FBXO18-206ENST00000462507 DNAL4O96015 105 aa7.22□□□□□ -1.25
FBXO18-206ENST00000462507 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
FBXO18-206ENST00000462507 MUC17Q685J3 4493 aa7.22□□□□□ -1.25
FBXO18-206ENST00000462507 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.21□□□□□ -1.26
FBXO18-206ENST00000462507 LINC00483Q53H64 154 aa7.2□□□□□ -1.26
FBXO18-206ENST00000462507 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.2□□□□□ -1.26
FBXO18-206ENST00000462507 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.19□□□□□ -1.26
FBXO18-206ENST00000462507 K7EP34 96 aa7.19□□□□□ -1.26
FBXO18-206ENST00000462507 SPRR1BP22528 89 aa7.19□□□□□ -1.26
FBXO18-206ENST00000462507 Q8N377 158 aa7.19□□□□□ -1.26
FBXO18-206ENST00000462507 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.19□□□□□ -1.26
FBXO18-206ENST00000462507 H3BMG7 143 aa7.18□□□□□ -1.26
FBXO18-206ENST00000462507 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.18□□□□□ -1.26
FBXO18-206ENST00000462507 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.18□□□□□ -1.26
FBXO18-206ENST00000462507 CDIP1Q9H305 208 aa7.18□□□□□ -1.26
FBXO18-206ENST00000462507 C9JAW5 83 aa7.17□□□□□ -1.26
FBXO18-206ENST00000462507 A0A1B0GV90 55 aa7.16□□□□□ -1.26
FBXO18-206ENST00000462507 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.16□□□□□ -1.26
FBXO18-206ENST00000462507 SMIM29Q86T20 159 aa7.16□□□□□ -1.26
FBXO18-206ENST00000462507 MTURNQ8N3F0 131 aa7.16□□□□□ -1.26
FBXO18-206ENST00000462507 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.16□□□□□ -1.26
FBXO18-206ENST00000462507 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.15□□□□□ -1.26
FBXO18-206ENST00000462507 CRYGAP11844 174 aa7.15□□□□□ -1.26
FBXO18-206ENST00000462507 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.15□□□□□ -1.26
FBXO18-206ENST00000462507 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.14□□□□□ -1.27
FBXO18-206ENST00000462507 GHRHP01286 108 aa7.14□□□□□ -1.27
FBXO18-206ENST00000462507 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa7.14□□□□□ -1.27
FBXO18-206ENST00000462507 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.14□□□□□ -1.27
FBXO18-206ENST00000462507 TPRXLQ17RH7 258 aa7.13□□□□□ -1.27
FBXO18-206ENST00000462507 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.12□□□□□ -1.27
FBXO18-206ENST00000462507 H3BQ85 93 aa7.12□□□□□ -1.27
FBXO18-206ENST00000462507 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.12□□□□□ -1.27
FBXO18-206ENST00000462507 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
FBXO18-206ENST00000462507 MOBPQ13875 183 aa7.12□□□□□ -1.27
FBXO18-206ENST00000462507 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.12□□□□□ -1.27
FBXO18-206ENST00000462507 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
FBXO18-206ENST00000462507 LINC00304Q8N9R0 145 aa7.11□□□□□ -1.27
FBXO18-206ENST00000462507 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.11□□□□□ -1.27
FBXO18-206ENST00000462507 A0A1B0GV72 72 aa7.1□□□□□ -1.27
FBXO18-206ENST00000462507 F8WEM9 126 aa7.1□□□□□ -1.27
FBXO18-206ENST00000462507 H3BT86 120 aa7.1□□□□□ -1.27
FBXO18-206ENST00000462507 UBE2V1Q13404 147 aa7.1□□□□□ -1.27
FBXO18-206ENST00000462507 PRO0461Q9UI25 63 aa7.1□□□□□ -1.27
FBXO18-206ENST00000462507 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
FBXO18-206ENST00000462507 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.09□□□□□ -1.27
FBXO18-206ENST00000462507 Q8NBF4 154 aa7.09□□□□□ -1.27
FBXO18-206ENST00000462507 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.06□□□□□ -1.28
FBXO18-206ENST00000462507 A0A0G2JQZ4 141 aa7.06□□□□□ -1.28
FBXO18-206ENST00000462507 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.05□□□□□ -1.28
FBXO18-206ENST00000462507 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.05□□□□□ -1.28
FBXO18-206ENST00000462507 FSIP2Q5CZC0 6907 aa7.04□□□□□ -1.28
FBXO18-206ENST00000462507 IGFL1Q6UW32 110 aa7.04□□□□□ -1.28
FBXO18-206ENST00000462507 F8W1H4 67 aa7.03□□□□□ -1.28
FBXO18-206ENST00000462507 Q6JHZ5 121 aa7.03□□□□□ -1.28
FBXO18-206ENST00000462507 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa7.02□□□□□ -1.29
FBXO18-206ENST00000462507 RBM3P98179 157 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
FBXO18-206ENST00000462507 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.01□□□□□ -1.29
FBXO18-206ENST00000462507 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.01□□□□□ -1.29
FBXO18-206ENST00000462507 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7□□□□□ -1.29
FBXO18-206ENST00000462507 C14orf132Q9NPU4 83 aa7□□□□□ -1.29
FBXO18-206ENST00000462507 DSCR8Q96T75 97 aa6.99□□□□□ -1.29
FBXO18-206ENST00000462507 ETDBQ3ZM63 59 aa6.98□□□□□ -1.29
FBXO18-206ENST00000462507 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.98□□□□□ -1.29
FBXO18-206ENST00000462507 TEN1Q86WV5 123 aa6.98□□□□□ -1.29
FBXO18-206ENST00000462507 A0A1W2PNM2 257 aa6.97□□□□□ -1.29
FBXO18-206ENST00000462507 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.97□□□□□ -1.29
FBXO18-206ENST00000462507 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.97□□□□□ -1.29
FBXO18-206ENST00000462507 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.96□□□□□ -1.3
FBXO18-206ENST00000462507 Q6ZQT0 140 aa6.96□□□□□ -1.3
FBXO18-206ENST00000462507 VPS25Q9BRG1 176 aa6.96□□□□□ -1.3
FBXO18-206ENST00000462507 CCKP06307 115 aa6.95□□□□□ -1.3
FBXO18-206ENST00000462507 CD164Q04900 197 aa6.95□□□□□ -1.3
FBXO18-206ENST00000462507 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.95□□□□□ -1.3
FBXO18-206ENST00000462507 SPINK1P00995 79 aa6.94□□□□□ -1.3
FBXO18-206ENST00000462507 Q6Q795 121 aa6.94□□□□□ -1.3
FBXO18-206ENST00000462507 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.93□□□□□ -1.3
FBXO18-206ENST00000462507 PDE6GP18545 87 aa6.93□□□□□ -1.3
FBXO18-206ENST00000462507 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
FBXO18-206ENST00000462507 LCE2CQ5TA81 110 aa6.91□□□□□ -1.3
FBXO18-206ENST00000462507 A0A087WSZ3 146 aa6.9□□□□□ -1.3
FBXO18-206ENST00000462507 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
FBXO18-206ENST00000462507 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
FBXO18-206ENST00000462507 LIMD2Q9BT23 127 aa6.89□□□□□ -1.31
FBXO18-206ENST00000462507 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.88□□□□□ -1.31
FBXO18-206ENST00000462507 Q5XG85 94 aa6.86□□□□□ -1.31
FBXO18-206ENST00000462507 MT1HP80294 61 aa6.85□□□□□ -1.31
FBXO18-206ENST00000462507 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.85□□□□□ -1.31
FBXO18-206ENST00000462507 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms