RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356384.4

RXRA-201, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RXRA, Length 5,770 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-201ENST00000356384 PRAC1Q96KF2 57 aa9.99□□□□□ -0.81
RXRA-201ENST00000356384 KRTAP1-1Q07627 177 aa9.98□□□□□ -0.81
RXRA-201ENST00000356384 CSAG1Q6PB30 78 aa9.97□□□□□ -0.81
RXRA-201ENST00000356384 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
RXRA-201ENST00000356384 S4R3F8 94 aa9.96□□□□□ -0.81
RXRA-201ENST00000356384 FAM229BQ4G0N7 80 aa9.96□□□□□ -0.82
RXRA-201ENST00000356384 DMAC1Q96GE9 116 aa9.96□□□□□ -0.82
RXRA-201ENST00000356384 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa9.95□□□□□ -0.82
RXRA-201ENST00000356384 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa9.95□□□□□ -0.82
RXRA-201ENST00000356384 A0A0C4DFX4 3053 aa9.95□□□□□ -0.82
RXRA-201ENST00000356384 MGAQ8IWI9 3026 aa9.92□□□□□ -0.82
RXRA-201ENST00000356384 ZNF292O60281 2723 aa9.91□□□□□ -0.82
RXRA-201ENST00000356384 WDFY4Q6ZS81 3184 aa9.91□□□□□ -0.82
RXRA-201ENST00000356384 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
RXRA-201ENST00000356384 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
RXRA-201ENST00000356384 AKAP13Q12802 2813 aa9.89□□□□□ -0.83
RXRA-201ENST00000356384 A0A0A0MQY5 61 aa9.89□□□□□ -0.83
RXRA-201ENST00000356384 LAMA1P25391 3075 aa9.88□□□□□ -0.83
RXRA-201ENST00000356384 VCANP13611 3396 aa9.88□□□□□ -0.83
RXRA-201ENST00000356384 H3BS24 57 aa9.86□□□□□ -0.83
RXRA-201ENST00000356384 Q5W150 140 aa9.86□□□□□ -0.83
RXRA-201ENST00000356384 ITPR3Q14573 2671 aa9.86□□□□□ -0.83
RXRA-201ENST00000356384 R4GN34 69 aa9.85□□□□□ -0.83
RXRA-201ENST00000356384 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
RXRA-201ENST00000356384 Q5XG85 94 aa9.85□□□□□ -0.83
RXRA-201ENST00000356384 CFAP54Q96N23 3096 aa9.84□□□□□ -0.83
RXRA-201ENST00000356384 COL6A3P12111 3177 aa9.83□□□□□ -0.84
RXRA-201ENST00000356384 SPINK7P58062 85 aa9.83□□□□□ -0.84
RXRA-201ENST00000356384 PLAC8Q9NZF1 115 aa9.82□□□□□ -0.84
RXRA-201ENST00000356384 EYSQ5T1H1 3165 aa9.82□□□□□ -0.84
RXRA-201ENST00000356384 Q5VV11 94 aa9.82□□□□□ -0.84
RXRA-201ENST00000356384 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
RXRA-201ENST00000356384 Q8NDZ9 215 aa9.8□□□□□ -0.84
RXRA-201ENST00000356384 CYSTM1Q9H1C7 97 aa9.8□□□□□ -0.84
RXRA-201ENST00000356384 STAB1Q9NY15 2570 aa9.78□□□□□ -0.84
RXRA-201ENST00000356384 REV3LO60673 3130 aa9.78□□□□□ -0.84
RXRA-201ENST00000356384 SPRR1AP35321 89 aa9.76□□□□□ -0.85
RXRA-201ENST00000356384 VPS13AQ96RL7 3174 aa9.76□□□□□ -0.85
RXRA-201ENST00000356384 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa9.76□□□□□ -0.85
RXRA-201ENST00000356384 LINC00472Q9H8W2 130 aa9.75□□□□□ -0.85
RXRA-201ENST00000356384 CFAP46Q8IYW2 2715 aa9.74□□□□□ -0.85
RXRA-201ENST00000356384 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
RXRA-201ENST00000356384 CENPEQ02224 2701 aa9.71□□□□□ -0.86
RXRA-201ENST00000356384 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
RXRA-201ENST00000356384 RPL37P61927 97 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
RXRA-201ENST00000356384 ROMO1P60602 79 aa9.69□□□□□ -0.86
RXRA-201ENST00000356384 SPRR1BP22528 89 aa9.68□□□□□ -0.86
RXRA-201ENST00000356384 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
RXRA-201ENST00000356384 M0QZ58 72 aa9.67□□□□□ -0.86
RXRA-201ENST00000356384 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
RXRA-201ENST00000356384 DSPP15924 2871 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
RXRA-201ENST00000356384 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa9.62□□□□□ -0.87
RXRA-201ENST00000356384 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa9.61□□□□□ -0.87
RXRA-201ENST00000356384 Q5VSD8 79 aa9.61□□□□□ -0.87
RXRA-201ENST00000356384 SPEGQ15772 3267 aa9.59□□□□□ -0.87
RXRA-201ENST00000356384 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa9.58□□□□□ -0.88
RXRA-201ENST00000356384 TEX15Q9BXT5 2789 aa9.56□□□□□ -0.88
RXRA-201ENST00000356384 USP34Q70CQ2 3546 aa9.55□□□□□ -0.88
RXRA-201ENST00000356384 SPATA8Q6RVD6 105 aa9.55□□□□□ -0.88
RXRA-201ENST00000356384 PLAC4Q8WY50 150 aa9.53□□□□□ -0.88
RXRA-201ENST00000356384 ADM2Q7Z4H4 148 aa9.53□□□□□ -0.88
RXRA-201ENST00000356384 CHD6Q8TD26 2715 aa9.53□□□□□ -0.88
RXRA-201ENST00000356384 KRTAP10-1P60331 282 aa9.52□□□□□ -0.89
RXRA-201ENST00000356384 OXTP01178 125 aa9.52□□□□□ -0.89
RXRA-201ENST00000356384 MYO15AQ9UKN7 3530 aa9.51□□□□□ -0.89
RXRA-201ENST00000356384 IGSF10Q6WRI0 2623 aa9.49□□□□□ -0.89
RXRA-201ENST00000356384 KRTAP10-2P60368 255 aa9.48□□□□□ -0.89
RXRA-201ENST00000356384 Q6ZR54 194 aa9.48□□□□□ -0.89
RXRA-201ENST00000356384 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa9.47□□□□□ -0.89
RXRA-201ENST00000356384 FREM2Q5SZK8 3169 aa9.47□□□□□ -0.89
RXRA-201ENST00000356384 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa9.45□□□□□ -0.9
RXRA-201ENST00000356384 FRYLO94915 3013 aa9.45□□□□□ -0.9
RXRA-201ENST00000356384 FRYQ5TBA9 3013 aa9.45□□□□□ -0.9
RXRA-201ENST00000356384 LCE6AA0A183 80 aa9.43□□□□□ -0.9
RXRA-201ENST00000356384 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa9.41□□□□□ -0.9
RXRA-201ENST00000356384 COL6A5A8TX70 2615 aa9.4□□□□□ -0.91
RXRA-201ENST00000356384 DMXL1Q9Y485 3027 aa9.38□□□□□ -0.91
RXRA-201ENST00000356384 PANO1I0J062 215 aa9.37□□□□□ -0.91
RXRA-201ENST00000356384 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
RXRA-201ENST00000356384 UNC79Q9P2D8 2635 aa9.35□□□□□ -0.91
RXRA-201ENST00000356384 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
RXRA-201ENST00000356384 NOTCH1P46531 2555 aa9.33□□□□□ -0.92
RXRA-201ENST00000356384 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa9.33□□□□□ -0.92
RXRA-201ENST00000356384 A0A087X002 238 aa9.32□□□□□ -0.92
RXRA-201ENST00000356384 ATMQ13315 3056 aa9.31□□□□□ -0.92
RXRA-201ENST00000356384 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
RXRA-201ENST00000356384 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa9.3□□□□□ -0.92
RXRA-201ENST00000356384 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa9.29□□□□□ -0.92
RXRA-201ENST00000356384 STAB2Q8WWQ8 2551 aa9.27□□□□□ -0.93
RXRA-201ENST00000356384 LRBAP50851 2863 aa9.26□□□□□ -0.93
RXRA-201ENST00000356384 A8MU10 97 aa9.26□□□□□ -0.93
RXRA-201ENST00000356384 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa9.25□□□□□ -0.93
RXRA-201ENST00000356384 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
RXRA-201ENST00000356384 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa9.25□□□□□ -0.93
RXRA-201ENST00000356384 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
RXRA-201ENST00000356384 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa9.22□□□□□ -0.93
RXRA-201ENST00000356384 BAHCC1Q9P281 2608 aa9.21□□□□□ -0.94
RXRA-201ENST00000356384 LOC400499M0QZD8 3231 aa9.2□□□□□ -0.94
RXRA-201ENST00000356384 A8MUU9 505 aa9.19□□□□□ -0.94
RXRA-201ENST00000356384 COL12A1Q99715 3063 aa9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 179 ms