RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356183.8

GTF3C1-201, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF3C1, Length 7,018 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1-201ENST00000356183 SPINK7P58062 85 aa6.97□□□□□ -1.29
GTF3C1-201ENST00000356183 CENPEQ02224 2701 aa6.97□□□□□ -1.29
GTF3C1-201ENST00000356183 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
GTF3C1-201ENST00000356183 KRTAP10-3P60369 221 aa6.96□□□□□ -1.3
GTF3C1-201ENST00000356183 S4R3F8 94 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF3C1-201ENST00000356183 DMAC1Q96GE9 116 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF3C1-201ENST00000356183 Q6ZSA8 131 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF3C1-201ENST00000356183 HECTD1Q9ULT8 2610 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF3C1-201ENST00000356183 DNAH14Q0VDD8 3507 aa6.94□□□□□ -1.3
GTF3C1-201ENST00000356183 M0R2T5 61 aa6.94□□□□□ -1.3
GTF3C1-201ENST00000356183 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.94□□□□□ -1.3
GTF3C1-201ENST00000356183 MGAM2Q2M2H8 2515 aa6.93□□□□□ -1.3
GTF3C1-201ENST00000356183 CFAP46Q8IYW2 2715 aa6.92□□□□□ -1.3
GTF3C1-201ENST00000356183 AKAP13Q12802 2813 aa6.92□□□□□ -1.3
GTF3C1-201ENST00000356183 ITPR3Q14573 2671 aa6.91□□□□□ -1.3
GTF3C1-201ENST00000356183 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
GTF3C1-201ENST00000356183 CR1P17927 2039 aa6.91□□□□□ -1.3
GTF3C1-201ENST00000356183 LAMA1P25391 3075 aa6.89□□□□□ -1.31
GTF3C1-201ENST00000356183 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.87□□□□□ -1.31
GTF3C1-201ENST00000356183 FREM2Q5SZK8 3169 aa6.87□□□□□ -1.31
GTF3C1-201ENST00000356183 ROMO1P60602 79 aa6.85□□□□□ -1.31
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GTF3C1-201ENST00000356183 ATRQ13535 2644 aa6.83□□□□□ -1.32
GTF3C1-201ENST00000356183 Q5W150 140 aa6.83□□□□□ -1.32
GTF3C1-201ENST00000356183 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
GTF3C1-201ENST00000356183 MAST4O15021 2626 aa6.83□□□□□ -1.32
GTF3C1-201ENST00000356183 SZT2Q5T011 3432 aa6.83□□□□□ -1.32
GTF3C1-201ENST00000356183 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
GTF3C1-201ENST00000356183 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
GTF3C1-201ENST00000356183 FRYQ5TBA9 3013 aa6.81□□□□□ -1.32
GTF3C1-201ENST00000356183 Q8NDZ9 215 aa6.8□□□□□ -1.32
GTF3C1-201ENST00000356183 CHD6Q8TD26 2715 aa6.8□□□□□ -1.32
GTF3C1-201ENST00000356183 R4GN34 69 aa6.77□□□□□ -1.33
GTF3C1-201ENST00000356183 TNP2Q05952 138 aa6.77□□□□□ -1.33
GTF3C1-201ENST00000356183 DSPP15924 2871 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
GTF3C1-201ENST00000356183 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.75□□□□□ -1.33
GTF3C1-201ENST00000356183 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
GTF3C1-201ENST00000356183 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.74□□□□□ -1.33
GTF3C1-201ENST00000356183 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.73□□□□□ -1.33
GTF3C1-201ENST00000356183 ZNF292O60281 2723 aa6.73□□□□□ -1.33
GTF3C1-201ENST00000356183 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.72□□□□□ -1.33
GTF3C1-201ENST00000356183 TEX15Q9BXT5 2789 aa6.71□□□□□ -1.34
GTF3C1-201ENST00000356183 SPRR1AP35321 89 aa6.7□□□□□ -1.34
GTF3C1-201ENST00000356183 COL6A3P12111 3177 aa6.69□□□□□ -1.34
GTF3C1-201ENST00000356183 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.69□□□□□ -1.34
GTF3C1-201ENST00000356183 M0QZ58 72 aa6.68□□□□□ -1.34
GTF3C1-201ENST00000356183 FRYLO94915 3013 aa6.67□□□□□ -1.34
GTF3C1-201ENST00000356183 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF3C1-201ENST00000356183 REV3LO60673 3130 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF3C1-201ENST00000356183 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF3C1-201ENST00000356183 KALRNO60229 2985 aa6.65□□□□□ -1.35
GTF3C1-201ENST00000356183 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.65□□□□□ -1.35
GTF3C1-201ENST00000356183 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF3C1-201ENST00000356183 SPEGQ15772 3267 aa6.64□□□□□ -1.35
GTF3C1-201ENST00000356183 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.63□□□□□ -1.35
GTF3C1-201ENST00000356183 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
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GTF3C1-201ENST00000356183 SPRR1BP22528 89 aa6.6□□□□□ -1.35
GTF3C1-201ENST00000356183 PLAC4Q8WY50 150 aa6.59□□□□□ -1.35
GTF3C1-201ENST00000356183 NBEAQ8NFP9 2946 aa6.59□□□□□ -1.35
GTF3C1-201ENST00000356183 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.58□□□□□ -1.36
GTF3C1-201ENST00000356183 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.58□□□□□ -1.36
GTF3C1-201ENST00000356183 A6NN06 94 aa6.58□□□□□ -1.36
GTF3C1-201ENST00000356183 EYSQ5T1H1 3165 aa6.57□□□□□ -1.36
GTF3C1-201ENST00000356183 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa6.57□□□□□ -1.36
GTF3C1-201ENST00000356183 Q6ZR54 194 aa6.56□□□□□ -1.36
GTF3C1-201ENST00000356183 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
GTF3C1-201ENST00000356183 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
GTF3C1-201ENST00000356183 NDUFAF8A1L188 74 aa6.54□□□□□ -1.36
GTF3C1-201ENST00000356183 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa6.54□□□□□ -1.36
GTF3C1-201ENST00000356183 LRBAP50851 2863 aa6.54□□□□□ -1.36
GTF3C1-201ENST00000356183 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa6.53□□□□□ -1.36
GTF3C1-201ENST00000356183 A8MU10 97 aa6.53□□□□□ -1.36
GTF3C1-201ENST00000356183 LCE6AA0A183 80 aa6.52□□□□□ -1.36
GTF3C1-201ENST00000356183 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.51□□□□□ -1.37
GTF3C1-201ENST00000356183 UNC79Q9P2D8 2635 aa6.51□□□□□ -1.37
GTF3C1-201ENST00000356183 STAB1Q9NY15 2570 aa6.5□□□□□ -1.37
GTF3C1-201ENST00000356183 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
GTF3C1-201ENST00000356183 ATMQ13315 3056 aa6.48□□□□□ -1.37
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GTF3C1-201ENST00000356183 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa6.48□□□□□ -1.37
GTF3C1-201ENST00000356183 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
GTF3C1-201ENST00000356183 COL6A5A8TX70 2615 aa6.47□□□□□ -1.37
GTF3C1-201ENST00000356183 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
GTF3C1-201ENST00000356183 COL12A1Q99715 3063 aa6.47□□□□□ -1.37
GTF3C1-201ENST00000356183 USP34Q70CQ2 3546 aa6.46□□□□□ -1.37
GTF3C1-201ENST00000356183 IGSF10Q6WRI0 2623 aa6.45□□□□□ -1.38
GTF3C1-201ENST00000356183 NOTCH1P46531 2555 aa6.45□□□□□ -1.38
GTF3C1-201ENST00000356183 TACC2O95359 2948 aa6.44□□□□□ -1.38
GTF3C1-201ENST00000356183 PANO1I0J062 215 aa6.43□□□□□ -1.38
GTF3C1-201ENST00000356183 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
GTF3C1-201ENST00000356183 A0A087X002 238 aa6.42□□□□□ -1.38
GTF3C1-201ENST00000356183 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.42□□□□□ -1.38
GTF3C1-201ENST00000356183 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.42□□□□□ -1.38
GTF3C1-201ENST00000356183 MYO15AQ9UKN7 3530 aa6.41□□□□□ -1.38
GTF3C1-201ENST00000356183 KRTAP10-1P60331 282 aa6.4□□□□□ -1.39
GTF3C1-201ENST00000356183 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
GTF3C1-201ENST00000356183 ITPR2Q14571 2701 aa6.39□□□□□ -1.39
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