RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318074.9

SYTL1-201, Transcript of synaptotagmin like 1, humanhuman

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Gene SYTL1, Length 1,900 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL1-201ENST00000318074 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
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SYTL1-201ENST00000318074 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa11.71□□□□□ -0.53
SYTL1-201ENST00000318074 RYR1P21817 5038 aa11.71□□□□□ -0.54
SYTL1-201ENST00000318074 FAT1Q14517 4588 aa11.7□□□□□ -0.54
SYTL1-201ENST00000318074 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa11.7□□□□□ -0.54
SYTL1-201ENST00000318074 LINC00643Q86TS7 51 aa11.7□□□□□ -0.54
SYTL1-201ENST00000318074 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
SYTL1-201ENST00000318074 HSPG2P98160 4391 aa11.7□□□□□ -0.54
SYTL1-201ENST00000318074 H3BQ85 93 aa11.7□□□□□ -0.54
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SYTL1-201ENST00000318074 SPINK6Q6UWN8 80 aa11.67□□□□□ -0.54
SYTL1-201ENST00000318074 Q8N377 158 aa11.67□□□□□ -0.54
SYTL1-201ENST00000318074 SPRR4Q96PI1 79 aa11.66□□□□□ -0.54
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SYTL1-201ENST00000318074 SPRR1BP22528 89 aa11.61□□□□□ -0.55
SYTL1-201ENST00000318074 C3orf22Q8N5N4 141 aa11.6□□□□□ -0.55
SYTL1-201ENST00000318074 LINC00483Q53H64 154 aa11.6□□□□□ -0.55
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SYTL1-201ENST00000318074 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa11.56□□□□□ -0.56
SYTL1-201ENST00000318074 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa11.56□□□□□ -0.56
SYTL1-201ENST00000318074 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa11.56□□□□□ -0.56
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SYTL1-201ENST00000318074 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa11.52□□□□□ -0.56
SYTL1-201ENST00000318074 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa11.52□□□□□ -0.57
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SYTL1-201ENST00000318074 Q6JHZ5 121 aa11.52□□□□□ -0.57
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SYTL1-201ENST00000318074 C9orf153Q5TBE3 101 aa11.48□□□□□ -0.57
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SYTL1-201ENST00000318074 A0A087X002 238 aa11.47□□□□□ -0.57
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SYTL1-201ENST00000318074 SS18L2Q9UHA2 77 aa11.45□□□□□ -0.58
SYTL1-201ENST00000318074 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa11.44□□□□□ -0.58
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SYTL1-201ENST00000318074 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa11.41□□□□□ -0.58
SYTL1-201ENST00000318074 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa11.41□□□□□ -0.58
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SYTL1-201ENST00000318074 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa11.39□□□□□ -0.59
SYTL1-201ENST00000318074 A0A0G2JQZ4 141 aa11.38□□□□□ -0.59
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SYTL1-201ENST00000318074 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa11.38□□□□□ -0.59
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SYTL1-201ENST00000318074 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
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SYTL1-201ENST00000318074 LIMD2Q9BT23 127 aa11.13□□□□□ -0.63
SYTL1-201ENST00000318074 CYSTM1Q9H1C7 97 aa11.13□□□□□ -0.63
SYTL1-201ENST00000318074 NREPQ16612 68 aa11.12□□□□□ -0.63
SYTL1-201ENST00000318074 RPS29P62273 56 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
SYTL1-201ENST00000318074 TNXBP22105 4242 aa11.1□□□□□ -0.63
SYTL1-201ENST00000318074 Q5XG85 94 aa11.09□□□□□ -0.63
SYTL1-201ENST00000318074 TMEM258P61165 79 aa11.07□□□□□ -0.64
SYTL1-201ENST00000318074 J3QL48 77 aa11.06□□□□□ -0.64
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