RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294599.8

MEGF6-201, Transcript of multiple EGF like domains 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MEGF6, Length 4,501 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEGF6-201ENST00000294599 LINC00336Q6ZUF6 198 aa10.6□□□□□ -0.71
MEGF6-201ENST00000294599 TLX1NBP0CAT3 122 aa10.59□□□□□ -0.71
MEGF6-201ENST00000294599 TYMSOSQ8TAI1 123 aa10.59□□□□□ -0.71
MEGF6-201ENST00000294599 A0A1W2PNM2 257 aa10.59□□□□□ -0.71
MEGF6-201ENST00000294599 FAM229AH3BQW9 127 aa10.58□□□□□ -0.72
MEGF6-201ENST00000294599 K7EIL1 84 aa10.58□□□□□ -0.72
MEGF6-201ENST00000294599 DCHS1Q96JQ0 3298 aa10.57□□□□□ -0.72
MEGF6-201ENST00000294599 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa10.56□□□□□ -0.72
MEGF6-201ENST00000294599 MUC3AQ02505 3323 aa10.56□□□□□ -0.72
MEGF6-201ENST00000294599 C8orf17Q9NRJ1 99 aa10.56□□□□□ -0.72
MEGF6-201ENST00000294599 ITPR2Q14571 2701 aa10.55□□□□□ -0.72
MEGF6-201ENST00000294599 CYSTM1Q9H1C7 97 aa10.54□□□□□ -0.72
MEGF6-201ENST00000294599 ASPMQ8IZT6 3477 aa10.54□□□□□ -0.72
MEGF6-201ENST00000294599 C9orf163Q8N9P6 203 aa10.54□□□□□ -0.72
MEGF6-201ENST00000294599 C8orf87E5RJ46 101 aa10.53□□□□□ -0.72
MEGF6-201ENST00000294599 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa10.53□□□□□ -0.72
MEGF6-201ENST00000294599 Q96NJ1 140 aa10.52□□□□□ -0.72
MEGF6-201ENST00000294599 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa10.52□□□□□ -0.72
MEGF6-201ENST00000294599 NF1P21359 2839 aa10.49□□□□□ -0.73
MEGF6-201ENST00000294599 ZNF861PO60384 105 aa10.49□□□□□ -0.73
MEGF6-201ENST00000294599 A0A1B0GVX0 72 aa10.49□□□□□ -0.73
MEGF6-201ENST00000294599 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
MEGF6-201ENST00000294599 ANAPC11Q9NYG5 84 aa10.48□□□□□ -0.73
MEGF6-201ENST00000294599 DMDP11532 3685 aa10.47□□□□□ -0.73
MEGF6-201ENST00000294599 ZFHX4Q86UP3 3567 aa10.47□□□□□ -0.73
MEGF6-201ENST00000294599 RELNP78509 3460 aa10.47□□□□□ -0.73
MEGF6-201ENST00000294599 DSCR10P59022 87 aa10.46□□□□□ -0.73
MEGF6-201ENST00000294599 FBN2P35556 2912 aa10.46□□□□□ -0.74
MEGF6-201ENST00000294599 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
MEGF6-201ENST00000294599 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa10.45□□□□□ -0.74
MEGF6-201ENST00000294599 CELSR2Q9HCU4 2923 aa10.45□□□□□ -0.74
MEGF6-201ENST00000294599 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa10.45□□□□□ -0.74
MEGF6-201ENST00000294599 OCR1Q9BZK8 76 aa10.45□□□□□ -0.74
MEGF6-201ENST00000294599 DCHS2Q6V1P9 2916 aa10.44□□□□□ -0.74
MEGF6-201ENST00000294599 APCP25054 2843 aa10.44□□□□□ -0.74
MEGF6-201ENST00000294599 LAMA5O15230 3695 aa10.44□□□□□ -0.74
MEGF6-201ENST00000294599 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa10.43□□□□□ -0.74
MEGF6-201ENST00000294599 WIPF1O43516 503 aa10.43□□□□□ -0.74
MEGF6-201ENST00000294599 A0A087WTM6 91 aa10.43□□□□□ -0.74
MEGF6-201ENST00000294599 UQCR11O14957 56 aa10.43□□□□□ -0.74
MEGF6-201ENST00000294599 CNBPP62633 177 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
MEGF6-201ENST00000294599 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
MEGF6-201ENST00000294599 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa10.39□□□□□ -0.75
MEGF6-201ENST00000294599 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa10.38□□□□□ -0.75
MEGF6-201ENST00000294599 SPRR4Q96PI1 79 aa10.37□□□□□ -0.75
MEGF6-201ENST00000294599 BAHCC1Q9P281 2608 aa10.36□□□□□ -0.75
MEGF6-201ENST00000294599 STAB2Q8WWQ8 2551 aa10.35□□□□□ -0.75
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa10.34□□□□□ -0.75
MEGF6-201ENST00000294599 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa10.33□□□□□ -0.76
MEGF6-201ENST00000294599 MXRA5Q9NR99 2828 aa10.33□□□□□ -0.76
MEGF6-201ENST00000294599 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP10.32□□□□□ -0.76
MEGF6-201ENST00000294599 MIR22HGQ0VDD5 57 aa10.31□□□□□ -0.76
MEGF6-201ENST00000294599 IGLV7-43P04211 117 aa10.31□□□□□ -0.76
MEGF6-201ENST00000294599 APLNQ9ULZ1 77 aa10.31□□□□□ -0.76
MEGF6-201ENST00000294599 SPRR1AP35321 89 aa10.3□□□□□ -0.76
MEGF6-201ENST00000294599 HIVEP1P15822 2718 aa10.3□□□□□ -0.76
MEGF6-201ENST00000294599 LINC00304Q8N9R0 145 aa10.28□□□□□ -0.76
MEGF6-201ENST00000294599 Q5XG85 94 aa10.26□□□□□ -0.77
MEGF6-201ENST00000294599 PRR26Q8N8Z3 221 aa10.26□□□□□ -0.77
MEGF6-201ENST00000294599 OXTP01178 125 aa10.25□□□□□ -0.77
MEGF6-201ENST00000294599 C9orf92A6NGG3 77 aa10.24□□□□□ -0.77
MEGF6-201ENST00000294599 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
MEGF6-201ENST00000294599 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
MEGF6-201ENST00000294599 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.78
MEGF6-201ENST00000294599 CD164Q04900 197 aa10.2□□□□□ -0.78
MEGF6-201ENST00000294599 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa10.2□□□□□ -0.78
MEGF6-201ENST00000294599 SPINT4Q6UDR6 99 aa10.18□□□□□ -0.78
MEGF6-201ENST00000294599 Q1T7F1 81 aa10.17□□□□□ -0.78
MEGF6-201ENST00000294599 FAM229BQ4G0N7 80 aa10.17□□□□□ -0.78
MEGF6-201ENST00000294599 Q8N1X5 172 aa10.16□□□□□ -0.78
MEGF6-201ENST00000294599 CSMD1Q96PZ7 3565 aa10.16□□□□□ -0.78
MEGF6-201ENST00000294599 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
MEGF6-201ENST00000294599 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa10.15□□□□□ -0.78
MEGF6-201ENST00000294599 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa10.14□□□□□ -0.79
MEGF6-201ENST00000294599 TNP2Q05952 138 aa10.12□□□□□ -0.79
MEGF6-201ENST00000294599 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa10.12□□□□□ -0.79
MEGF6-201ENST00000294599 LCA10Q71F78 164 aa10.1□□□□□ -0.79
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
MEGF6-201ENST00000294599 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa10.08□□□□□ -0.8
MEGF6-201ENST00000294599 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa10.07□□□□□ -0.8
MEGF6-201ENST00000294599 CRIPTQ9P021 101 aa10.05□□□□□ -0.8
MEGF6-201ENST00000294599 SPRR1BP22528 89 aa10.05□□□□□ -0.8
MEGF6-201ENST00000294599 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
MEGF6-201ENST00000294599 LINC00472Q9H8W2 130 aa10.04□□□□□ -0.8
MEGF6-201ENST00000294599 HRES1P13985 223 aa10.04□□□□□ -0.8
MEGF6-201ENST00000294599 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
MEGF6-201ENST00000294599 A0A0D9SG42 100 aa9.99□□□□□ -0.81
MEGF6-201ENST00000294599 Q75L30 129 aa9.97□□□□□ -0.81
MEGF6-201ENST00000294599 SVEP1Q4LDE5 3571 aa9.96□□□□□ -0.82
MEGF6-201ENST00000294599 COX6B2Q6YFQ2 88 aa9.94□□□□□ -0.82
MEGF6-201ENST00000294599 J3QL48 77 aa9.94□□□□□ -0.82
MEGF6-201ENST00000294599 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa9.94□□□□□ -0.82
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa9.92□□□□□ -0.82
MEGF6-201ENST00000294599 PLAC8Q9NZF1 115 aa9.92□□□□□ -0.82
MEGF6-201ENST00000294599 LINC01554Q52M75 96 aa9.9□□□□□ -0.82
MEGF6-201ENST00000294599 PANO1I0J062 215 aa9.89□□□□□ -0.83
MEGF6-201ENST00000294599 Q5VV11 94 aa9.89□□□□□ -0.83
MEGF6-201ENST00000294599 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
MEGF6-201ENST00000294599 A0A1B0GU33 70 aa9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 134.5 ms