RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
UBP1-201ENST00000283628 H0Y9J4 135 aa17.52■□□□□ 0.4
UBP1-201ENST00000283628 APLNQ9ULZ1 77 aa17.52■□□□□ 0.39
UBP1-201ENST00000283628 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
UBP1-201ENST00000283628 A0A0G2JQZ4 141 aa17.51■□□□□ 0.39
UBP1-201ENST00000283628 UBE2AP49459 152 aa17.5■□□□□ 0.39
UBP1-201ENST00000283628 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
UBP1-201ENST00000283628 STAB2Q8WWQ8 2551 aa17.48■□□□□ 0.39
UBP1-201ENST00000283628 A0A087WSZ3 146 aa17.48■□□□□ 0.39
UBP1-201ENST00000283628 SPRR1BP22528 89 aa17.48■□□□□ 0.39
UBP1-201ENST00000283628 PKIGQ9Y2B9 76 aa17.48■□□□□ 0.39
UBP1-201ENST00000283628 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
UBP1-201ENST00000283628 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
UBP1-201ENST00000283628 CHTF8P0CG12 524 aa17.43■□□□□ 0.38
UBP1-201ENST00000283628 DNAH10Q8IVF4 4471 aa17.42■□□□□ 0.38
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa17.41■□□□□ 0.38
UBP1-201ENST00000283628 C9orf163Q8N9P6 203 aa17.41■□□□□ 0.38
UBP1-201ENST00000283628 LINC00474Q9P2X8 69 aa17.4■□□□□ 0.38
UBP1-201ENST00000283628 DEFB116Q30KQ4 102 aa17.38■□□□□ 0.37
UBP1-201ENST00000283628 LRCOL1A6NCL2 159 aa17.34■□□□□ 0.37
UBP1-201ENST00000283628 NUPR2A6NF83 97 aa17.34■□□□□ 0.37
UBP1-201ENST00000283628 FAM229BQ4G0N7 80 aa17.33■□□□□ 0.37
UBP1-201ENST00000283628 LYSTQ99698 3801 aa17.32■□□□□ 0.36
UBP1-201ENST00000283628 WFDC13Q8IUB5 93 aa17.32■□□□□ 0.36
UBP1-201ENST00000283628 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa17.28■□□□□ 0.36
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
UBP1-201ENST00000283628 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.35
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UBP1-201ENST00000283628 PRR15Q8IV56 129 aa17.26■□□□□ 0.35
UBP1-201ENST00000283628 MP68P56378 58 aa17.25■□□□□ 0.35
UBP1-201ENST00000283628 LINC00336Q6ZUF6 198 aa17.25■□□□□ 0.35
UBP1-201ENST00000283628 LINC00472Q9H8W2 130 aa17.25■□□□□ 0.35
UBP1-201ENST00000283628 A8MWP4 228 aa17.24■□□□□ 0.35
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa17.24■□□□□ 0.35
UBP1-201ENST00000283628 CSMD3Q7Z407 3707 aa17.23■□□□□ 0.35
UBP1-201ENST00000283628 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
UBP1-201ENST00000283628 CASC2Q6XLA1 102 aa17.21■□□□□ 0.35
UBP1-201ENST00000283628 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
UBP1-201ENST00000283628 DNAH7Q8WXX0 4024 aa17.21■□□□□ 0.35
UBP1-201ENST00000283628 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa17.2■□□□□ 0.34
UBP1-201ENST00000283628 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
UBP1-201ENST00000283628 PRO0628Q9UI54 55 aa17.19■□□□□ 0.34
UBP1-201ENST00000283628 MPLKIPQ8TAP9 179 aa17.19■□□□□ 0.34
UBP1-201ENST00000283628 C1orf64Q8NEQ6 169 aa17.18■□□□□ 0.34
UBP1-201ENST00000283628 PANO1I0J062 215 aa17.16■□□□□ 0.34
UBP1-201ENST00000283628 H3BPC8 53 aa17.16■□□□□ 0.34
UBP1-201ENST00000283628 TRAV22A0A0B4J277 110 aa17.14■□□□□ 0.33
UBP1-201ENST00000283628 DNHD1Q96M86 4753 aa17.14■□□□□ 0.33
UBP1-201ENST00000283628 SPACA4Q8TDM5 124 aa17.12■□□□□ 0.33
UBP1-201ENST00000283628 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
UBP1-201ENST00000283628 LINC00208Q96KT6 92 aa17.11■□□□□ 0.33
UBP1-201ENST00000283628 H0Y9P7 68 aa17.09■□□□□ 0.33
UBP1-201ENST00000283628 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa17.09■□□□□ 0.33
UBP1-201ENST00000283628 STARD9Q9P2P6 4700 aa17.07■□□□□ 0.32
UBP1-201ENST00000283628 VPS13DQ5THJ4 4388 aa17.06■□□□□ 0.32
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UBP1-201ENST00000283628 Q1T7F1 81 aa17.03■□□□□ 0.32
UBP1-201ENST00000283628 LINC00483Q53H64 154 aa17.03■□□□□ 0.32
UBP1-201ENST00000283628 TENM2Q9NT68 2774 aa17.03■□□□□ 0.32
UBP1-201ENST00000283628 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa17.02■□□□□ 0.32
UBP1-201ENST00000283628 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa17.02■□□□□ 0.32
UBP1-201ENST00000283628 PRR4Q16378 134 aa17■□□□□ 0.31
UBP1-201ENST00000283628 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa16.98■□□□□ 0.31
UBP1-201ENST00000283628 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
UBP1-201ENST00000283628 A0A087WTM6 91 aa16.97■□□□□ 0.31
UBP1-201ENST00000283628 Q96NJ1 140 aa16.97■□□□□ 0.31
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa16.96■□□□□ 0.31
UBP1-201ENST00000283628 BRK1Q8WUW1 75 aa16.96■□□□□ 0.31
UBP1-201ENST00000283628 MOBPQ13875 183 aa16.91■□□□□ 0.3
UBP1-201ENST00000283628 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa16.9■□□□□ 0.3
UBP1-201ENST00000283628 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa16.88■□□□□ 0.29
UBP1-201ENST00000283628 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa16.87■□□□□ 0.29
UBP1-201ENST00000283628 RTL8CO15255 209 aa16.87■□□□□ 0.29
UBP1-201ENST00000283628 Q6ZR54 194 aa16.87■□□□□ 0.29
UBP1-201ENST00000283628 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa16.87■□□□□ 0.29
UBP1-201ENST00000283628 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa16.85■□□□□ 0.29
UBP1-201ENST00000283628 PLAC8Q9NZF1 115 aa16.83■□□□□ 0.28
UBP1-201ENST00000283628 V9GYY9 64 aa16.83■□□□□ 0.28
UBP1-201ENST00000283628 C8orf17Q9NRJ1 99 aa16.82■□□□□ 0.28
UBP1-201ENST00000283628 ZNF861PO60384 105 aa16.8■□□□□ 0.28
UBP1-201ENST00000283628 A0A1B0GVX0 72 aa16.77■□□□□ 0.28
UBP1-201ENST00000283628 CDK2AP2O75956 126 aa16.74■□□□□ 0.27
UBP1-201ENST00000283628 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa16.73■□□□□ 0.27
UBP1-201ENST00000283628 FBN3Q75N90 2809 aa16.73■□□□□ 0.27
UBP1-201ENST00000283628 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa16.71■□□□□ 0.27
UBP1-201ENST00000283628 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa16.7■□□□□ 0.26
UBP1-201ENST00000283628 PSPHP1O15172 72 aa16.7■□□□□ 0.26
UBP1-201ENST00000283628 KMT2AQ03164 3969 aa16.68■□□□□ 0.26
UBP1-201ENST00000283628 DNAH6Q9C0G6 4158 aa16.67■□□□□ 0.26
UBP1-201ENST00000283628 C1orf134Q5TEV5 83 aa16.66■□□□□ 0.26
UBP1-201ENST00000283628 C1orf195Q5TG92 126 aa16.66■□□□□ 0.26
UBP1-201ENST00000283628 ANAPC11Q9NYG5 84 aa16.66■□□□□ 0.26
UBP1-201ENST00000283628 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
UBP1-201ENST00000283628 DNAH2Q9P225 4427 aa16.64■□□□□ 0.25
UBP1-201ENST00000283628 LY6G6CO95867 125 aa16.64■□□□□ 0.25
UBP1-201ENST00000283628 DNAH17Q9UFH2 4485 aa16.63■□□□□ 0.25
UBP1-201ENST00000283628 NDUFS5O43920 106 aa16.62■□□□□ 0.25
UBP1-201ENST00000283628 LIMD2Q9BT23 127 aa16.61■□□□□ 0.25
UBP1-201ENST00000283628 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
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