RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRO-201ENST00000281171 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRO-201ENST00000281171 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRO-201ENST00000281171 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRO-201ENST00000281171 Q6ZSA8 131 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRO-201ENST00000281171 PANO1I0J062 215 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRO-201ENST00000281171 A8MUU9 505 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRO-201ENST00000281171 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRO-201ENST00000281171 CENPFP49454 3210 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRO-201ENST00000281171 HECTD1Q9ULT8 2610 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRO-201ENST00000281171 S4R3F8 94 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRO-201ENST00000281171 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRO-201ENST00000281171 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRO-201ENST00000281171 MGAM2Q2M2H8 2515 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRO-201ENST00000281171 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRO-201ENST00000281171 ITPR3Q14573 2671 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRO-201ENST00000281171 R4GN34 69 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRO-201ENST00000281171 PLAC4Q8WY50 150 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRO-201ENST00000281171 USP24Q9UPU5 2620 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRO-201ENST00000281171 RPS29P62273 56 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRO-201ENST00000281171 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRO-201ENST00000281171 ATRQ13535 2644 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRO-201ENST00000281171 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRO-201ENST00000281171 Q5VSD8 79 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP10-1P60331 282 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRO-201ENST00000281171 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRO-201ENST00000281171 MAST4O15021 2626 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRO-201ENST00000281171 M0QZ58 72 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRO-201ENST00000281171 M0R2T5 61 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP10-2P60368 255 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRO-201ENST00000281171 CFAP46Q8IYW2 2715 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRO-201ENST00000281171 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRO-201ENST00000281171 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
PTPRO-201ENST00000281171 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRO-201ENST00000281171 BPTFQ12830 3046 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRO-201ENST00000281171 P0C880 135 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRO-201ENST00000281171 C10orf95Q9H7T3 257 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF292O60281 2723 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRO-201ENST00000281171 H0YAA0 97 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRO-201ENST00000281171 STAB1Q9NY15 2570 aa8.02□□□□□ -1.12
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRO-201ENST00000281171 CHD9Q3L8U1 2897 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRO-201ENST00000281171 CHD7Q9P2D1 2997 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRO-201ENST00000281171 UNC79Q9P2D8 2635 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRO-201ENST00000281171 PP632Q6XCG6 107 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRO-201ENST00000281171 A0A0C4DFX4 3053 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRO-201ENST00000281171 TRANK1O15050 2925 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRO-201ENST00000281171 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
PTPRO-201ENST00000281171 COL6A5A8TX70 2615 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRO-201ENST00000281171 DNAH12Q6ZR08 3092 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRO-201ENST00000281171 PCNTO95613 3336 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRO-201ENST00000281171 CEP350Q5VT06 3117 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRO-201ENST00000281171 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRO-201ENST00000281171 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRO-201ENST00000281171 UTRNP46939 3433 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRO-201ENST00000281171 TEX15Q9BXT5 2789 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRO-201ENST00000281171 CENPEQ02224 2701 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRO-201ENST00000281171 TNP1P09430 55 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRO-201ENST00000281171 IGSF10Q6WRI0 2623 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRO-201ENST00000281171 CHD6Q8TD26 2715 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRO-201ENST00000281171 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
PTPRO-201ENST00000281171 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
PTPRO-201ENST00000281171 AKAP13Q12802 2813 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRO-201ENST00000281171 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
PTPRO-201ENST00000281171 BAHCC1Q9P281 2608 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRO-201ENST00000281171 NOTCH1P46531 2555 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP10-8P60410 259 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRO-201ENST00000281171 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
PTPRO-201ENST00000281171 ITPR2Q14571 2701 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRO-201ENST00000281171 MGAQ8IWI9 3026 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRO-201ENST00000281171 HTTP42858 3142 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRO-201ENST00000281171 TPRXLQ17RH7 258 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRO-201ENST00000281171 C5orf42Q9H799 3197 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRO-201ENST00000281171 STAB2Q8WWQ8 2551 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRO-201ENST00000281171 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRO-201ENST00000281171 ITPR1Q14643 2758 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRO-201ENST00000281171 CFAP54Q96N23 3096 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRO-201ENST00000281171 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRO-201ENST00000281171 XP32Q5T750 250 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRO-201ENST00000281171 DSPP15924 2871 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRO-201ENST00000281171 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRO-201ENST00000281171 HIVEP1P15822 2718 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRO-201ENST00000281171 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRO-201ENST00000281171 KRTAP12-2P59991 146 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRO-201ENST00000281171 BRCA2P51587 3418 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRO-201ENST00000281171 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP7.3□□□□□ -1.24
PTPRO-201ENST00000281171 INE1O15225 51 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRO-201ENST00000281171 FLNCQ14315 2725 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRO-201ENST00000281171 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRO-201ENST00000281171 LAMA3Q16787 3333 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRO-201ENST00000281171 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.23□□□□□ -1.25
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