RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545193.5

GRSF1-208, Transcript of G-rich RNA sequence binding factor 1, human

TSL 2 BASIC

Gene GRSF1, Length 2,682 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRSF1-208	ENST00000545193	HAMP	P81172	84 aa		10.3	□□□□□ -0.76
GRSF1-208	ENST00000545193		F8WDY8	70 aa		10.29	□□□□□ -0.76
GRSF1-208	ENST00000545193	IGLV6-57	P01721	117 aa		10.29	□□□□□ -0.76
GRSF1-208	ENST00000545193	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		10.29	□□□□□ -0.76
GRSF1-208	ENST00000545193	APLN	Q9ULZ1	77 aa		10.29	□□□□□ -0.76
GRSF1-208	ENST00000545193	CASC10	Q5T4H9	136 aa		10.28	□□□□□ -0.76
GRSF1-208	ENST00000545193	RMI2	Q96E14	147 aa		10.28	□□□□□ -0.76
GRSF1-208	ENST00000545193	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		10.28	□□□□□ -0.76
GRSF1-208	ENST00000545193	SYCN	Q0VAF6	134 aa		10.28	□□□□□ -0.76
GRSF1-208	ENST00000545193	C20orf197	Q8N268	126 aa		10.28	□□□□□ -0.76
GRSF1-208	ENST00000545193	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
GRSF1-208	ENST00000545193	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GRSF1-208	ENST00000545193	PRO0628	Q9UI54	55 aa		10.26	□□□□□ -0.77
GRSF1-208	ENST00000545193		Q6ZVQ6	151 aa		10.25	□□□□□ -0.77
GRSF1-208	ENST00000545193	LOC110117498	A0A087WWA1	95 aa		10.25	□□□□□ -0.77
GRSF1-208	ENST00000545193	LYST	Q99698	3801 aa		10.24	□□□□□ -0.77
GRSF1-208	ENST00000545193		Q6ZRP5	223 aa		10.24	□□□□□ -0.77
GRSF1-208	ENST00000545193	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		10.24	□□□□□ -0.77
GRSF1-208	ENST00000545193	EPM2A	B3EWF7	344 aa		10.23	□□□□□ -0.77
GRSF1-208	ENST00000545193	SCX	Q7RTU7	201 aa		10.23	□□□□□ -0.77
GRSF1-208	ENST00000545193	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		10.23	□□□□□ -0.77
GRSF1-208	ENST00000545193	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		10.23	□□□□□ -0.77
GRSF1-208	ENST00000545193	FAM236C	P0DP71	79 aa		10.23	□□□□□ -0.77
GRSF1-208	ENST00000545193	DIRC1	Q969H9	104 aa		10.23	□□□□□ -0.77
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
GRSF1-208	ENST00000545193	VPREB1	P12018	145 aa		10.21	□□□□□ -0.77
GRSF1-208	ENST00000545193	DNHD1	Q96M86	4753 aa		10.21	□□□□□ -0.77
GRSF1-208	ENST00000545193	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		10.21	□□□□□ -0.77
GRSF1-208	ENST00000545193	NUPR2	A6NF83	97 aa		10.2	□□□□□ -0.78
GRSF1-208	ENST00000545193	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
GRSF1-208	ENST00000545193		H7BZZ5	65 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GRSF1-208	ENST00000545193	COX7B	P24311	80 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GRSF1-208	ENST00000545193	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GRSF1-208	ENST00000545193	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GRSF1-208	ENST00000545193	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
GRSF1-208	ENST00000545193	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		10.17	□□□□□ -0.78
GRSF1-208	ENST00000545193		M0R378	163 aa		10.17	□□□□□ -0.78
GRSF1-208	ENST00000545193	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		10.17	□□□□□ -0.78
GRSF1-208	ENST00000545193	SNURF	Q9Y675	71 aa		10.17	□□□□□ -0.78
GRSF1-208	ENST00000545193	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
GRSF1-208	ENST00000545193	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
GRSF1-208	ENST00000545193	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		10.15	□□□□□ -0.78
GRSF1-208	ENST00000545193	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
GRSF1-208	ENST00000545193	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GRSF1-208	ENST00000545193	TENM2	Q9NT68	2774 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GRSF1-208	ENST00000545193	PDE6G	P18545	87 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GRSF1-208	ENST00000545193	PSCA	O43653	123 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GRSF1-208	ENST00000545193	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GRSF1-208	ENST00000545193	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GRSF1-208	ENST00000545193	CXCL6	P80162	114 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GRSF1-208	ENST00000545193		Q8N9L7	120 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GRSF1-208	ENST00000545193	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
GRSF1-208	ENST00000545193	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GRSF1-208	ENST00000545193	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GRSF1-208	ENST00000545193	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GRSF1-208	ENST00000545193	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GRSF1-208	ENST00000545193	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GRSF1-208	ENST00000545193	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GRSF1-208	ENST00000545193		H3BQ85	93 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GRSF1-208	ENST00000545193	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GRSF1-208	ENST00000545193	FAM168B	A1KXE4	195 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GRSF1-208	ENST00000545193	KLKP1	Q107X0	134 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GRSF1-208	ENST00000545193	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GRSF1-208	ENST00000545193	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GRSF1-208	ENST00000545193	C7orf33	Q8WU49	177 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GRSF1-208	ENST00000545193	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
GRSF1-208	ENST00000545193	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GRSF1-208	ENST00000545193		F8WEM9	126 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GRSF1-208	ENST00000545193	C3orf84	H3BNL1	204 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GRSF1-208	ENST00000545193	BCE1	O60756	84 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GRSF1-208	ENST00000545193	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GRSF1-208	ENST00000545193	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GRSF1-208	ENST00000545193	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		10.04	□□□□□ -0.8
GRSF1-208	ENST00000545193	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GRSF1-208	ENST00000545193	C14orf177	Q52M58	125 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GRSF1-208	ENST00000545193	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.8
GRSF1-208	ENST00000545193	BPY2	O14599	106 aa		10.02	□□□□□ -0.8
GRSF1-208	ENST00000545193	BRK1	Q8WUW1	75 aa		10.02	□□□□□ -0.8
GRSF1-208	ENST00000545193		A0A0U1RQV1	116 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GRSF1-208	ENST00000545193	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GRSF1-208	ENST00000545193	NREP	Q16612	68 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GRSF1-208	ENST00000545193	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		10.01	□□□□□ -0.81
GRSF1-208	ENST00000545193		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
GRSF1-208	ENST00000545193	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		10	□□□□□ -0.81
GRSF1-208	ENST00000545193		A0A096LNI7	61 aa		10	□□□□□ -0.81
GRSF1-208	ENST00000545193	C16orf90	A8MZG2	172 aa		10	□□□□□ -0.81
GRSF1-208	ENST00000545193	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
GRSF1-208	ENST00000545193	IGKV4-1	P06312	121 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GRSF1-208	ENST00000545193	SEC61G	P60059	68 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GRSF1-208	ENST00000545193	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		9.98	□□□□□ -0.81
GRSF1-208	ENST00000545193	C1orf195	Q5TG92	126 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GRSF1-208	ENST00000545193		Q8N377	158 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GRSF1-208	ENST00000545193	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		9.97	□□□□□ -0.81
GRSF1-208	ENST00000545193	FBN3	Q75N90	2809 aa		9.96	□□□□□ -0.81
GRSF1-208	ENST00000545193	PRY	O14603	147 aa		9.96	□□□□□ -0.81
GRSF1-208	ENST00000545193	TMEM254	Q8TBM7	123 aa		9.96	□□□□□ -0.81
GRSF1-208	ENST00000545193		V9GYY9	64 aa		9.96	□□□□□ -0.81
GRSF1-208	ENST00000545193	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	9.95	□□□□□ -0.82
GRSF1-208	ENST00000545193	SPRR1A	P35321	89 aa		9.94	□□□□□ -0.82
GRSF1-208	ENST00000545193	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		9.94	□□□□□ -0.82

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