RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-241ENST00000487169 SPATA3Q8NHX4 192 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-241ENST00000487169 A6NED7 52 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-241ENST00000487169 FAM218AQ96MZ4 157 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-241ENST00000487169 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa9.05□□□□□ -0.96
HDLBP-241ENST00000487169 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
HDLBP-241ENST00000487169 LRBAP50851 2863 aa9.04□□□□□ -0.96
HDLBP-241ENST00000487169 MOBPQ13875 183 aa9.04□□□□□ -0.96
HDLBP-241ENST00000487169 DCHS1Q96JQ0 3298 aa9.03□□□□□ -0.96
HDLBP-241ENST00000487169 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa9.03□□□□□ -0.96
HDLBP-241ENST00000487169 CHTF8P0CG12 524 aa9.02□□□□□ -0.96
HDLBP-241ENST00000487169 DNAH10OSP0CZ25 163 aa9.02□□□□□ -0.96
HDLBP-241ENST00000487169 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
HDLBP-241ENST00000487169 LIMD2Q9BT23 127 aa9.02□□□□□ -0.97
HDLBP-241ENST00000487169 A0A0U1RQV1 116 aa9.01□□□□□ -0.97
HDLBP-241ENST00000487169 HCG22E2RYF7 251 aa9.01□□□□□ -0.97
HDLBP-241ENST00000487169 K7EIL1 84 aa9.01□□□□□ -0.97
HDLBP-241ENST00000487169 TMEM254Q8TBM7 123 aa9.01□□□□□ -0.97
HDLBP-241ENST00000487169 SPACA4Q8TDM5 124 aa9.01□□□□□ -0.97
HDLBP-241ENST00000487169 C19orf73Q9NVV2 129 aa9.01□□□□□ -0.97
HDLBP-241ENST00000487169 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
HDLBP-241ENST00000487169 H0Y9P7 68 aa9.01□□□□□ -0.97
HDLBP-241ENST00000487169 RTL8CO15255 209 aa9.01□□□□□ -0.97
HDLBP-241ENST00000487169 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
HDLBP-241ENST00000487169 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa9.01□□□□□ -0.97
HDLBP-241ENST00000487169 SMIM26A0A096LP01 95 aa9□□□□□ -0.97
HDLBP-241ENST00000487169 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
HDLBP-241ENST00000487169 Q6ZRX8 168 aa9□□□□□ -0.97
HDLBP-241ENST00000487169 C16orf90A8MZG2 172 aa9□□□□□ -0.97
HDLBP-241ENST00000487169 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
HDLBP-241ENST00000487169 IGSF10Q6WRI0 2623 aa9□□□□□ -0.97
HDLBP-241ENST00000487169 Q6ZRP5 223 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-241ENST00000487169 CXCL6P80162 114 aa8.98□□□□□ -0.97
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP10-11P60412 298 aa8.98□□□□□ -0.97
HDLBP-241ENST00000487169 EPM2AB3EWF7 344 aa8.97□□□□□ -0.97
HDLBP-241ENST00000487169 SPINK1P00995 79 aa8.97□□□□□ -0.97
HDLBP-241ENST00000487169 ZZEF1O43149 2961 aa8.97□□□□□ -0.97
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP10-3P60369 221 aa8.97□□□□□ -0.97
HDLBP-241ENST00000487169 LITAFQ99732 161 aa8.96□□□□□ -0.97
HDLBP-241ENST00000487169 Q8NBF4 154 aa8.96□□□□□ -0.97
HDLBP-241ENST00000487169 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
HDLBP-241ENST00000487169 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-241ENST00000487169 VPREB1P12018 145 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-241ENST00000487169 LINC00476Q8WZB0 136 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-241ENST00000487169 CRYGAP11844 174 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-241ENST00000487169 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-241ENST00000487169 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-241ENST00000487169 IGKV2-30P06310 120 aa8.94□□□□□ -0.98
HDLBP-241ENST00000487169 RELNP78509 3460 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-241ENST00000487169 C1orf64Q8NEQ6 169 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-241ENST00000487169 SMIM29Q86T20 159 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-241ENST00000487169 PRR34Q9NV39 138 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-241ENST00000487169 FLNCQ14315 2725 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP1-1Q07627 177 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-241ENST00000487169 FAM168BA1KXE4 195 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-241ENST00000487169 FAM229AH3BQW9 127 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-241ENST00000487169 Q6ZQT0 140 aa8.91□□□□□ -0.98
HDLBP-241ENST00000487169 A0A1B0GW54 56 aa8.9□□□□□ -0.98
HDLBP-241ENST00000487169 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-241ENST00000487169 hDV103S1A0JD37 113 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-241ENST00000487169 BCE1O60756 84 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-241ENST00000487169 IGLV6-57P01721 117 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-241ENST00000487169 STAB2Q8WWQ8 2551 aa8.89□□□□□ -0.99
HDLBP-241ENST00000487169 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa8.88□□□□□ -0.99
HDLBP-241ENST00000487169 TYMSOSQ8TAI1 123 aa8.88□□□□□ -0.99
HDLBP-241ENST00000487169 LINC00612Q8N6U2 182 aa8.88□□□□□ -0.99
HDLBP-241ENST00000487169 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
HDLBP-241ENST00000487169 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa8.85□□□□□ -0.99
HDLBP-241ENST00000487169 LINC01600Q96MT4 127 aa8.85□□□□□ -0.99
HDLBP-241ENST00000487169 COL12A1Q99715 3063 aa8.84□□□□□ -0.99
HDLBP-241ENST00000487169 PSPHP1O15172 72 aa8.84□□□□□ -0.99
HDLBP-241ENST00000487169 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa8.84□□□□□ -0.99
HDLBP-241ENST00000487169 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
HDLBP-241ENST00000487169 C15orf56Q8N910 161 aa8.84□□□□□ -1
HDLBP-241ENST00000487169 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
HDLBP-241ENST00000487169 TM2D3Q9BRN9 247 aa8.83□□□□□ -1
HDLBP-241ENST00000487169 KCNQ1DNQ9H478 68 aa8.83□□□□□ -1
HDLBP-241ENST00000487169 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa8.82□□□□□ -1
HDLBP-241ENST00000487169 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.82□□□□□ -1
HDLBP-241ENST00000487169 RPS28P62857 69 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
HDLBP-241ENST00000487169 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
HDLBP-241ENST00000487169 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
HDLBP-241ENST00000487169 ITPR1Q14643 2758 aa8.8□□□□□ -1
HDLBP-241ENST00000487169 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa8.8□□□□□ -1
HDLBP-241ENST00000487169 C9orf163Q8N9P6 203 aa8.8□□□□□ -1
HDLBP-241ENST00000487169 LINC00313P59037 77 aa8.78□□□□□ -1
HDLBP-241ENST00000487169 C4orf26Q17RF5 130 aa8.78□□□□□ -1
HDLBP-241ENST00000487169 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
HDLBP-241ENST00000487169 TRAV22A0A0B4J277 110 aa8.78□□□□□ -1
HDLBP-241ENST00000487169 DCHS2Q6V1P9 2916 aa8.77□□□□□ -1
HDLBP-241ENST00000487169 A0A087WTM6 91 aa8.77□□□□□ -1
HDLBP-241ENST00000487169 PMAIP1Q13794 54 aa8.77□□□□□ -1.01
HDLBP-241ENST00000487169 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
HDLBP-241ENST00000487169 C7orf65Q6ZTY9 151 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-241ENST00000487169 CR1P17927 2039 aa8.74□□□□□ -1.01
HDLBP-241ENST00000487169 CASC10Q5T4H9 136 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-241ENST00000487169 FAM104AQ969W3 186 aa8.73□□□□□ -1.01
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF861PO60384 105 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-241ENST00000487169 CSMD1Q96PZ7 3565 aa8.72□□□□□ -1.01
HDLBP-241ENST00000487169 Q8N377 158 aa8.71□□□□□ -1.01
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