RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356183.8

GTF3C1-201, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF3C1, Length 7,018 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1-201ENST00000356183 IGFL1Q6UW32 110 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF3C1-201ENST00000356183 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF3C1-201ENST00000356183 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
GTF3C1-201ENST00000356183 C8orf17Q9NRJ1 99 aa7.39□□□□□ -1.23
GTF3C1-201ENST00000356183 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.38□□□□□ -1.23
GTF3C1-201ENST00000356183 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
GTF3C1-201ENST00000356183 PRR15Q8IV56 129 aa7.37□□□□□ -1.23
GTF3C1-201ENST00000356183 LINC01554Q52M75 96 aa7.37□□□□□ -1.23
GTF3C1-201ENST00000356183 ACANP16112 2415 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF3C1-201ENST00000356183 FASNP49327 2511 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
GTF3C1-201ENST00000356183 POLQO75417 2590 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF3C1-201ENST00000356183 LINC00588Q9Y4M8 146 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF3C1-201ENST00000356183 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.35□□□□□ -1.23
GTF3C1-201ENST00000356183 KLK9Q2XQG4 91 aa7.35□□□□□ -1.23
GTF3C1-201ENST00000356183 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
GTF3C1-201ENST00000356183 CHD7Q9P2D1 2997 aa7.34□□□□□ -1.23
GTF3C1-201ENST00000356183 COX6B2Q6YFQ2 88 aa7.34□□□□□ -1.24
GTF3C1-201ENST00000356183 A0A1B0GVX0 72 aa7.33□□□□□ -1.24
GTF3C1-201ENST00000356183 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa7.33□□□□□ -1.24
GTF3C1-201ENST00000356183 H3BNG1 76 aa7.33□□□□□ -1.24
GTF3C1-201ENST00000356183 LUZP6Q538Z0 58 aa7.32□□□□□ -1.24
GTF3C1-201ENST00000356183 COL4A2P08572 1712 aa7.32□□□□□ -1.24
GTF3C1-201ENST00000356183 BPTFQ12830 3046 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF3C1-201ENST00000356183 Q8N377 158 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF3C1-201ENST00000356183 Q8N1X5 172 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF3C1-201ENST00000356183 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF3C1-201ENST00000356183 Q8NAQ8 132 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF3C1-201ENST00000356183 H3BS24 57 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF3C1-201ENST00000356183 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF3C1-201ENST00000356183 FAM104AQ969W3 186 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF3C1-201ENST00000356183 ANAPC11Q9NYG5 84 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF3C1-201ENST00000356183 LAMA3Q16787 3333 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF3C1-201ENST00000356183 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
GTF3C1-201ENST00000356183 BRCA2P51587 3418 aa7.26□□□□□ -1.25
GTF3C1-201ENST00000356183 CFAP54Q96N23 3096 aa7.26□□□□□ -1.25
GTF3C1-201ENST00000356183 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.26□□□□□ -1.25
GTF3C1-201ENST00000356183 ZNF575Q86XF7 245 aa7.26□□□□□ -1.25
GTF3C1-201ENST00000356183 C15orf56Q8N910 161 aa7.25□□□□□ -1.25
GTF3C1-201ENST00000356183 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.25□□□□□ -1.25
GTF3C1-201ENST00000356183 A0A0C4DFX4 3053 aa7.25□□□□□ -1.25
GTF3C1-201ENST00000356183 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa7.25□□□□□ -1.25
GTF3C1-201ENST00000356183 LINC00304Q8N9R0 145 aa7.25□□□□□ -1.25
GTF3C1-201ENST00000356183 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7.24□□□□□ -1.25
GTF3C1-201ENST00000356183 HTTP42858 3142 aa7.23□□□□□ -1.25
GTF3C1-201ENST00000356183 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa7.23□□□□□ -1.25
GTF3C1-201ENST00000356183 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF3C1-201ENST00000356183 Q1T7F1 81 aa7.21□□□□□ -1.26
GTF3C1-201ENST00000356183 Q5XG85 94 aa7.21□□□□□ -1.26
GTF3C1-201ENST00000356183 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.2□□□□□ -1.26
GTF3C1-201ENST00000356183 ZNF861PO60384 105 aa7.18□□□□□ -1.26
GTF3C1-201ENST00000356183 F8P00451 2351 aa7.18□□□□□ -1.26
GTF3C1-201ENST00000356183 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.18□□□□□ -1.26
GTF3C1-201ENST00000356183 PRAC1Q96KF2 57 aa7.16□□□□□ -1.26
GTF3C1-201ENST00000356183 EPG5Q9HCE0 2579 aa7.15□□□□□ -1.27
GTF3C1-201ENST00000356183 XIRP2A4UGR9 3374 aa7.15□□□□□ -1.27
GTF3C1-201ENST00000356183 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.15□□□□□ -1.27
GTF3C1-201ENST00000356183 USP24Q9UPU5 2620 aa7.14□□□□□ -1.27
GTF3C1-201ENST00000356183 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa7.14□□□□□ -1.27
GTF3C1-201ENST00000356183 LINC00483Q53H64 154 aa7.14□□□□□ -1.27
GTF3C1-201ENST00000356183 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
GTF3C1-201ENST00000356183 A0A1W2PNM2 257 aa7.13□□□□□ -1.27
GTF3C1-201ENST00000356183 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa7.12□□□□□ -1.27
GTF3C1-201ENST00000356183 CYSTM1Q9H1C7 97 aa7.12□□□□□ -1.27
GTF3C1-201ENST00000356183 Q75L30 129 aa7.11□□□□□ -1.27
GTF3C1-201ENST00000356183 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa7.11□□□□□ -1.27
GTF3C1-201ENST00000356183 OCR1Q9BZK8 76 aa7.11□□□□□ -1.27
GTF3C1-201ENST00000356183 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.11□□□□□ -1.27
GTF3C1-201ENST00000356183 A0A1B0GU33 70 aa7.09□□□□□ -1.27
GTF3C1-201ENST00000356183 CSAG1Q6PB30 78 aa7.09□□□□□ -1.27
GTF3C1-201ENST00000356183 UNC80Q8N2C7 3258 aa7.09□□□□□ -1.27
GTF3C1-201ENST00000356183 IGLV7-43P04211 117 aa7.09□□□□□ -1.27
GTF3C1-201ENST00000356183 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
GTF3C1-201ENST00000356183 KRTAP10-11P60412 298 aa7.09□□□□□ -1.28
GTF3C1-201ENST00000356183 SPRR4Q96PI1 79 aa7.08□□□□□ -1.28
GTF3C1-201ENST00000356183 PRR34Q9NV39 138 aa7.08□□□□□ -1.28
GTF3C1-201ENST00000356183 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.07□□□□□ -1.28
GTF3C1-201ENST00000356183 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.07□□□□□ -1.28
GTF3C1-201ENST00000356183 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa7.06□□□□□ -1.28
GTF3C1-201ENST00000356183 CHD9Q3L8U1 2897 aa7.06□□□□□ -1.28
GTF3C1-201ENST00000356183 CASC10Q5T4H9 136 aa7.06□□□□□ -1.28
GTF3C1-201ENST00000356183 A0A087WTM6 91 aa7.05□□□□□ -1.28
GTF3C1-201ENST00000356183 A0A0A0MQY5 61 aa7.04□□□□□ -1.28
GTF3C1-201ENST00000356183 TRIOO75962 3097 aa7.04□□□□□ -1.28
GTF3C1-201ENST00000356183 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa7.04□□□□□ -1.28
GTF3C1-201ENST00000356183 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.04□□□□□ -1.28
GTF3C1-201ENST00000356183 CDH23Q9H251 3354 aa7.04□□□□□ -1.28
GTF3C1-201ENST00000356183 WDFY4Q6ZS81 3184 aa7.03□□□□□ -1.28
GTF3C1-201ENST00000356183 HRES1P13985 223 aa7.03□□□□□ -1.28
GTF3C1-201ENST00000356183 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
GTF3C1-201ENST00000356183 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
GTF3C1-201ENST00000356183 VPS13AQ96RL7 3174 aa7.02□□□□□ -1.29
GTF3C1-201ENST00000356183 OXTP01178 125 aa7.02□□□□□ -1.29
GTF3C1-201ENST00000356183 MGAQ8IWI9 3026 aa7.01□□□□□ -1.29
GTF3C1-201ENST00000356183 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
GTF3C1-201ENST00000356183 TRANK1O15050 2925 aa7□□□□□ -1.29
GTF3C1-201ENST00000356183 A0A096LNT2 108 aa6.99□□□□□ -1.29
GTF3C1-201ENST00000356183 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF3C1-201ENST00000356183 Q5VV11 94 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF3C1-201ENST00000356183 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.98□□□□□ -1.29
GTF3C1-201ENST00000356183 K7EIL1 84 aa6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms