RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 IGFL1Q6UW32 110 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRD-201ENST00000355233 Q8N377 158 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRD-201ENST00000355233 PRR3P79522 188 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
PTPRD-201ENST00000355233 PRR4Q16378 134 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRD-201ENST00000355233 LINC00588Q9Y4M8 146 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRD-201ENST00000355233 LINC00483Q53H64 154 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRD-201ENST00000355233 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRD-201ENST00000355233 IGKV2-30P06310 120 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRD-201ENST00000355233 IGF2RP11717 2491 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRD-201ENST00000355233 TYMSOSQ8TAI1 123 aa3.21□□□□□ -1.89
PTPRD-201ENST00000355233 K7EIL1 84 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRD-201ENST00000355233 A0A0A0MQY5 61 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRD-201ENST00000355233 PRLHP81277 87 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRD-201ENST00000355233 LINC01554Q52M75 96 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRD-201ENST00000355233 HRES1P13985 223 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRD-201ENST00000355233 PKD1L2Q7Z442 2459 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRD-201ENST00000355233 A0A096LNI7 61 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRD-201ENST00000355233 RTL8CO15255 209 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRD-201ENST00000355233 SPRR1AP35321 89 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRD-201ENST00000355233 RPS29P62273 56 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
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PTPRD-201ENST00000355233 J3QL48 77 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP1-1Q07627 177 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRD-201ENST00000355233 FN1P02751 2386 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
PTPRD-201ENST00000355233 Q5XG85 94 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRD-201ENST00000355233 Q6ZR54 194 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRD-201ENST00000355233 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
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PTPRD-201ENST00000355233 Q9UF83 564 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRD-201ENST00000355233 LCE6AA0A183 80 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRD-201ENST00000355233 MYO18BQ8IUG5 2567 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRD-201ENST00000355233 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP10-11P60412 298 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRD-201ENST00000355233 CHD8Q9HCK8 2581 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRD-201ENST00000355233 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
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PTPRD-201ENST00000355233 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa3.15□□□□□ -1.9
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF462Q96JM2 2506 aa3.15□□□□□ -1.9
PTPRD-201ENST00000355233 CEP295Q9C0D2 2601 aa3.15□□□□□ -1.9
PTPRD-201ENST00000355233 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRD-201ENST00000355233 ABCA12Q86UK0 2595 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRD-201ENST00000355233 IGLV7-43P04211 117 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRD-201ENST00000355233 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF575Q86XF7 245 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRD-201ENST00000355233 APLNQ9ULZ1 77 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC168Q8NDH2 2452 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRD-201ENST00000355233 Q96NJ1 140 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRD-201ENST00000355233 A0A1B0GU33 70 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRD-201ENST00000355233 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
PTPRD-201ENST00000355233 A0A1W2PNM2 257 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRD-201ENST00000355233 DSCR10P59022 87 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP10-3P60369 221 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRD-201ENST00000355233 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRD-201ENST00000355233 Q5VV11 94 aa3.12□□□□□ -1.91
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PTPRD-201ENST00000355233 SPACA4Q8TDM5 124 aa3.11□□□□□ -1.91
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PTPRD-201ENST00000355233 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
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PTPRD-201ENST00000355233 PLAC8Q9NZF1 115 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRD-201ENST00000355233 ROMO1P60602 79 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRD-201ENST00000355233 DEFB116Q30KQ4 102 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRD-201ENST00000355233 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRD-201ENST00000355233 H3BS24 57 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRD-201ENST00000355233 CASC10Q5T4H9 136 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRD-201ENST00000355233 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRD-201ENST00000355233 MTORP42345 2549 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRD-201ENST00000355233 PRR26Q8N8Z3 221 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRD-201ENST00000355233 RPL37P61927 97 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRD-201ENST00000355233 CSAG1Q6PB30 78 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRD-201ENST00000355233 M0QZ58 72 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRD-201ENST00000355233 RYR1P21817 5038 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRD-201ENST00000355233 PP632Q6XCG6 107 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
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PTPRD-201ENST00000355233 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
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PTPRD-201ENST00000355233 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
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PTPRD-201ENST00000355233 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRD-201ENST00000355233 CENPEQ02224 2701 aa3□□□□□ -1.93
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa3□□□□□ -1.93
PTPRD-201ENST00000355233 ACANP16112 2415 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRD-201ENST00000355233 A0A1W2PNN7 141 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRD-201ENST00000355233 FASNP49327 2511 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
PTPRD-201ENST00000355233 OXTP01178 125 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRD-201ENST00000355233 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
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