RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 NISCHQ9Y2I1 1504 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRD-201ENST00000355233 MYT1Q01538 1121 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRD-201ENST00000355233 DCAF8L2P0C7V8 631 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-201ENST00000355233 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRD-201ENST00000355233 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
PTPRD-201ENST00000355233 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
PTPRD-201ENST00000355233 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
PTPRD-201ENST00000355233 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-201ENST00000355233 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
PTPRD-201ENST00000355233 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-201ENST00000355233 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRD-201ENST00000355233 CLSPNQ9HAW4 1339 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRD-201ENST00000355233 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRD-201ENST00000355233 APLP2Q06481 763 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRD-201ENST00000355233 ERICH6Q7L0X2 663 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRD-201ENST00000355233 MYT1LQ9UL68 1186 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRD-201ENST00000355233 NEFLP07196 543 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRD-201ENST00000355233 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRD-201ENST00000355233 ABCC9O60706 1549 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRD-201ENST00000355233 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
PTPRD-201ENST00000355233 TRIM41Q8WV44 630 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRD-201ENST00000355233 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-201ENST00000355233 HRCP23327 699 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-201ENST00000355233 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-201ENST00000355233 UBTFP17480 764 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRD-201ENST00000355233 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP7□□□□□ -1.29
PTPRD-201ENST00000355233 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRD-201ENST00000355233 EHMT2Q96KQ7 1210 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRD-201ENST00000355233 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRD-201ENST00000355233 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRD-201ENST00000355233 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRD-201ENST00000355233 PCGF6Q9BYE7 350 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRD-201ENST00000355233 EEA1Q15075 1411 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRD-201ENST00000355233 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRD-201ENST00000355233 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRD-201ENST00000355233 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
PTPRD-201ENST00000355233 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
PTPRD-201ENST00000355233 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRD-201ENST00000355233 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRD-201ENST00000355233 NEFMP07197 916 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRD-201ENST00000355233 ANP32EQ9BTT0 268 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRD-201ENST00000355233 NACADO15069 1562 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRD-201ENST00000355233 MYO15BQ96JP2 1530 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRD-201ENST00000355233 SCRIBQ14160 1630 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRD-201ENST00000355233 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRD-201ENST00000355233 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP6.78□□□□□ -1.32
PTPRD-201ENST00000355233 FBLN2P98095 1184 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRD-201ENST00000355233 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRD-201ENST00000355233 NEUROD1Q13562 356 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRD-201ENST00000355233 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRD-201ENST00000355233 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRD-201ENST00000355233 SLC24A1O60721 1099 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRD-201ENST00000355233 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRD-201ENST00000355233 ANP32CO43423 234 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRD-201ENST00000355233 CHIC1Q5VXU3 224 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRD-201ENST00000355233 ERICH6BQ5W0A0 696 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRD-201ENST00000355233 NCLP19338 710 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRD-201ENST00000355233 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRD-201ENST00000355233 CFAP44Q96MT7 982 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRD-201ENST00000355233 DDRGK1Q96HY6 314 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRD-201ENST00000355233 CSRNP3Q8WYN3 585 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRD-201ENST00000355233 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRD-201ENST00000355233 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRD-201ENST00000355233 PTMSP20962 102 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRD-201ENST00000355233 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRD-201ENST00000355233 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRD-201ENST00000355233 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRD-201ENST00000355233 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRD-201ENST00000355233 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRD-201ENST00000355233 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRD-201ENST00000355233 GOLGA3Q08378 1498 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRD-201ENST00000355233 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRD-201ENST00000355233 ERCC6Q03468 1493 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRD-201ENST00000355233 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRD-201ENST00000355233 ITGAEP38570 1179 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRD-201ENST00000355233 CEP164Q9UPV0 1460 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRD-201ENST00000355233 CEP162Q5TB80 1403 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRD-201ENST00000355233 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
PTPRD-201ENST00000355233 TRIM52Q96A61 297 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRD-201ENST00000355233 BECN1Q14457 450 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRD-201ENST00000355233 PDS5BQ9NTI5 1447 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-201ENST00000355233 FHAD1B1AJZ9 1412 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRD-201ENST00000355233 USP35Q9P2H5 1018 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-201ENST00000355233 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRD-201ENST00000355233 SMARCA2P51531 1590 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRD-201ENST00000355233 MS4A1P11836 297 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRD-201ENST00000355233 TONSLQ96HA7 1378 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRD-201ENST00000355233 BCANQ96GW7 911 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-201ENST00000355233 GOLGA6L22H0YM25 854 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-201ENST00000355233 CDCA8Q53HL2 280 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-201ENST00000355233 STAG3Q9UJ98 1225 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-201ENST00000355233 KIF27Q86VH2 1401 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-201ENST00000355233 PLEKHD1A6NEE1 506 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-201ENST00000355233 TSPY4P0CV99 314 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-201ENST00000355233 TSPY10P0CW01 314 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-201ENST00000355233 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-201ENST00000355233 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa6.5□□□□□ -1.37
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