RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 XGP55808 180 aa11.43□□□□□ -0.58
ACTB-201ENST00000331789 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
ACTB-201ENST00000331789 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa11.4□□□□□ -0.58
ACTB-201ENST00000331789 MT-ATP8P03928 68 aa11.4□□□□□ -0.58
ACTB-201ENST00000331789 Q6ZR54 194 aa11.4□□□□□ -0.58
ACTB-201ENST00000331789 A0A1W2PNN7 141 aa11.39□□□□□ -0.59
ACTB-201ENST00000331789 PRYO14603 147 aa11.39□□□□□ -0.59
ACTB-201ENST00000331789 GAGE2AQ6NT46 116 aa11.39□□□□□ -0.59
ACTB-201ENST00000331789 C9orf163Q8N9P6 203 aa11.39□□□□□ -0.59
ACTB-201ENST00000331789 CHTF8P0CG12 524 aa11.38□□□□□ -0.59
ACTB-201ENST00000331789 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
ACTB-201ENST00000331789 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa11.35□□□□□ -0.59
ACTB-201ENST00000331789 ACYP1P07311 99 aa11.35□□□□□ -0.59
ACTB-201ENST00000331789 SPRR1AP35321 89 aa11.35□□□□□ -0.59
ACTB-201ENST00000331789 A0A087WTM6 91 aa11.35□□□□□ -0.59
ACTB-201ENST00000331789 B5MCH6 92 aa11.35□□□□□ -0.59
ACTB-201ENST00000331789 LY6G6CO95867 125 aa11.35□□□□□ -0.59
ACTB-201ENST00000331789 SDIM1Q6ZPB5 146 aa11.34□□□□□ -0.59
ACTB-201ENST00000331789 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa11.34□□□□□ -0.59
ACTB-201ENST00000331789 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa11.33□□□□□ -0.6
ACTB-201ENST00000331789 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa11.33□□□□□ -0.6
ACTB-201ENST00000331789 TGP01266 2768 aa11.33□□□□□ -0.6
ACTB-201ENST00000331789 H3BQ85 93 aa11.32□□□□□ -0.6
ACTB-201ENST00000331789 PCP4P48539 62 aa11.32□□□□□ -0.6
ACTB-201ENST00000331789 Q6ZRX8 168 aa11.32□□□□□ -0.6
ACTB-201ENST00000331789 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP11.31□□□□□ -0.66e-7■■■□□ 15.9
ACTB-201ENST00000331789 Q9BRP9 147 aa11.31□□□□□ -0.6
ACTB-201ENST00000331789 REG3GQ6UW15 175 aa11.3□□□□□ -0.6
ACTB-201ENST00000331789 SMCR5Q8TEV8 140 aa11.3□□□□□ -0.6
ACTB-201ENST00000331789 KMT2AQ03164 3969 aa11.3□□□□□ -0.6
ACTB-201ENST00000331789 CCKP06307 115 aa11.29□□□□□ -0.6
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ACTB-201ENST00000331789 PANO1I0J062 215 aa11.29□□□□□ -0.6
ACTB-201ENST00000331789 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
ACTB-201ENST00000331789 C1orf134Q5TEV5 83 aa11.28□□□□□ -0.6
ACTB-201ENST00000331789 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa11.28□□□□□ -0.6
ACTB-201ENST00000331789 LINC00476Q8WZB0 136 aa11.27□□□□□ -0.6
ACTB-201ENST00000331789 PKIGQ9Y2B9 76 aa11.27□□□□□ -0.6
ACTB-201ENST00000331789 GHRHP01286 108 aa11.27□□□□□ -0.61
ACTB-201ENST00000331789 DEFB105AQ8NG35 78 aa11.27□□□□□ -0.61
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa11.26□□□□□ -0.61
ACTB-201ENST00000331789 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
ACTB-201ENST00000331789 ERC2-IT1O76042 136 aa11.24□□□□□ -0.61
ACTB-201ENST00000331789 Q6ZQT0 140 aa11.24□□□□□ -0.61
ACTB-201ENST00000331789 LINC00846Q9NV44 126 aa11.24□□□□□ -0.61
ACTB-201ENST00000331789 LINC00474Q9P2X8 69 aa11.24□□□□□ -0.61
ACTB-201ENST00000331789 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
ACTB-201ENST00000331789 UBE2BP63146 152 aa11.23□□□□□ -0.61
ACTB-201ENST00000331789 DPH3Q96FX2 82 aa11.23□□□□□ -0.61
ACTB-201ENST00000331789 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
ACTB-201ENST00000331789 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa11.23□□□□□ -0.61
ACTB-201ENST00000331789 RTL8CO15255 209 aa11.23□□□□□ -0.61
ACTB-201ENST00000331789 SCGB1A1P11684 91 aa11.23□□□□□ -0.61
ACTB-201ENST00000331789 Q8N377 158 aa11.23□□□□□ -0.61
ACTB-201ENST00000331789 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa11.23□□□□□ -0.61
ACTB-201ENST00000331789 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa11.22□□□□□ -0.61
ACTB-201ENST00000331789 DSCR8Q96T75 97 aa11.22□□□□□ -0.61
ACTB-201ENST00000331789 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa11.21□□□□□ -0.61
ACTB-201ENST00000331789 LINC00643Q86TS7 51 aa11.21□□□□□ -0.62
ACTB-201ENST00000331789 SPACA4Q8TDM5 124 aa11.2□□□□□ -0.62
ACTB-201ENST00000331789 PRLHP81277 87 aa11.19□□□□□ -0.62
ACTB-201ENST00000331789 C3orf84H3BNL1 204 aa11.18□□□□□ -0.62
ACTB-201ENST00000331789 DNAH2Q9P225 4427 aa11.18□□□□□ -0.62
ACTB-201ENST00000331789 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa11.17□□□□□ -0.62
ACTB-201ENST00000331789 TNP2Q05952 138 aa11.17□□□□□ -0.62
ACTB-201ENST00000331789 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa11.17□□□□□ -0.62
ACTB-201ENST00000331789 C3orf22Q8N5N4 141 aa11.17□□□□□ -0.62
ACTB-201ENST00000331789 DNAH6Q9C0G6 4158 aa11.16□□□□□ -0.62
ACTB-201ENST00000331789 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa11.15□□□□□ -0.62
ACTB-201ENST00000331789 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa11.15□□□□□ -0.62
ACTB-201ENST00000331789 PDE6GP18545 87 aa11.15□□□□□ -0.62
ACTB-201ENST00000331789 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa11.13□□□□□ -0.63
ACTB-201ENST00000331789 EPM2AB3EWF7 344 aa11.13□□□□□ -0.63
ACTB-201ENST00000331789 ALMS1Q8TCU4 4167 aa11.13□□□□□ -0.63
ACTB-201ENST00000331789 Q6Q795 121 aa11.13□□□□□ -0.63
ACTB-201ENST00000331789 HIGD2AQ9BW72 106 aa11.13□□□□□ -0.63
ACTB-201ENST00000331789 DNAH17Q9UFH2 4485 aa11.11□□□□□ -0.63
ACTB-201ENST00000331789 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa11.1□□□□□ -0.63
ACTB-201ENST00000331789 Q6JHZ5 121 aa11.09□□□□□ -0.63
ACTB-201ENST00000331789 UBE2AP49459 152 aa11.08□□□□□ -0.64
ACTB-201ENST00000331789 H0Y9J4 135 aa11.07□□□□□ -0.64
ACTB-201ENST00000331789 SMIM29Q86T20 159 aa11.07□□□□□ -0.64
ACTB-201ENST00000331789 BCE1O60756 84 aa11.07□□□□□ -0.64
ACTB-201ENST00000331789 UBL5Q9BZL1 73 aa11.07□□□□□ -0.64
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP10-2P60368 255 aa11.06□□□□□ -0.64
ACTB-201ENST00000331789 IMUPQ9GZP8 106 aa11.06□□□□□ -0.64
ACTB-201ENST00000331789 PLAC8Q9NZF1 115 aa11.05□□□□□ -0.64
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa11.03□□□□□ -0.64
ACTB-201ENST00000331789 FRAS1Q86XX4 4008 aa11.02□□□□□ -0.64
ACTB-201ENST00000331789 HYDINQ4G0P3 5121 aa11.02□□□□□ -0.65
ACTB-201ENST00000331789 C1orf137Q5JT78 98 aa11.02□□□□□ -0.65
ACTB-201ENST00000331789 Q6ZVQ6 151 aa11.02□□□□□ -0.65
ACTB-201ENST00000331789 A0A1W2PNM2 257 aa10.99□□□□□ -0.65
ACTB-201ENST00000331789 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa10.99□□□□□ -0.65
ACTB-201ENST00000331789 F8WEM9 126 aa10.98□□□□□ -0.65
ACTB-201ENST00000331789 FAM30AQ9NZY2 134 aa10.97□□□□□ -0.65
ACTB-201ENST00000331789 A0A0G2JQZ4 141 aa10.97□□□□□ -0.65
ACTB-201ENST00000331789 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa10.97□□□□□ -0.65
ACTB-201ENST00000331789 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa10.97□□□□□ -0.65
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