RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326277.5

SNX18-201, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX18, Length 2,063 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-201ENST00000326277 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa14.71□□□□□ -0.05
SNX18-201ENST00000326277 DNAH10Q8IVF4 4471 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX18-201ENST00000326277 GHRHP01286 108 aa14.7□□□□□ -0.06
SNX18-201ENST00000326277 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa14.69□□□□□ -0.06
SNX18-201ENST00000326277 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SNX18-201ENST00000326277 NUPR2A6NF83 97 aa14.68□□□□□ -0.06
SNX18-201ENST00000326277 DSCR8Q96T75 97 aa14.68□□□□□ -0.06
SNX18-201ENST00000326277 TENM2Q9NT68 2774 aa14.68□□□□□ -0.06
SNX18-201ENST00000326277 Q6JHZ5 121 aa14.67□□□□□ -0.06
SNX18-201ENST00000326277 CNBPP62633 177 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SNX18-201ENST00000326277 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX18-201ENST00000326277 PRYO14603 147 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX18-201ENST00000326277 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SNX18-201ENST00000326277 DNAH7Q8WXX0 4024 aa14.65□□□□□ -0.06
SNX18-201ENST00000326277 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SNX18-201ENST00000326277 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX18-201ENST00000326277 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX18-201ENST00000326277 M0R2N4 97 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX18-201ENST00000326277 SPRR1AP35321 89 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX18-201ENST00000326277 Q6ZRX8 168 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX18-201ENST00000326277 A0A096LNI7 61 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX18-201ENST00000326277 B5MCH6 92 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX18-201ENST00000326277 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SNX18-201ENST00000326277 PDE6GP18545 87 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX18-201ENST00000326277 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SNX18-201ENST00000326277 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX18-201ENST00000326277 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX18-201ENST00000326277 C16orf90A8MZG2 172 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX18-201ENST00000326277 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX18-201ENST00000326277 Q9BRP9 147 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX18-201ENST00000326277 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX18-201ENST00000326277 C14orf177Q52M58 125 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX18-201ENST00000326277 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX18-201ENST00000326277 UBL5Q9BZL1 73 aa14.57□□□□□ -0.08
SNX18-201ENST00000326277 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SNX18-201ENST00000326277 DEFB105AQ8NG35 78 aa14.56□□□□□ -0.08
SNX18-201ENST00000326277 Q8N377 158 aa14.54□□□□□ -0.08
SNX18-201ENST00000326277 A0A1W2PNN7 141 aa14.54□□□□□ -0.08
SNX18-201ENST00000326277 LRCOL1A6NCL2 159 aa14.54□□□□□ -0.08
SNX18-201ENST00000326277 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa14.54□□□□□ -0.08
SNX18-201ENST00000326277 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SNX18-201ENST00000326277 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa14.52□□□□□ -0.09
SNX18-201ENST00000326277 REG3GQ6UW15 175 aa14.52□□□□□ -0.09
SNX18-201ENST00000326277 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SNX18-201ENST00000326277 A0A087WVE0 104 aa14.5□□□□□ -0.09
SNX18-201ENST00000326277 CCDC179H3BU77 68 aa14.5□□□□□ -0.09
SNX18-201ENST00000326277 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SNX18-201ENST00000326277 STARD9Q9P2P6 4700 aa14.49□□□□□ -0.09
SNX18-201ENST00000326277 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa14.48□□□□□ -0.09
SNX18-201ENST00000326277 ERC2-IT1O76042 136 aa14.48□□□□□ -0.09
SNX18-201ENST00000326277 CHTF8P0CG12 524 aa14.48□□□□□ -0.09
SNX18-201ENST00000326277 Q6ZVQ6 151 aa14.48□□□□□ -0.09
SNX18-201ENST00000326277 UBE2BP63146 152 aa14.47□□□□□ -0.09
SNX18-201ENST00000326277 C9orf163Q8N9P6 203 aa14.46□□□□□ -0.09
SNX18-201ENST00000326277 C3orf22Q8N5N4 141 aa14.46□□□□□ -0.09
SNX18-201ENST00000326277 DNHD1Q96M86 4753 aa14.45□□□□□ -0.1
SNX18-201ENST00000326277 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa14.44□□□□□ -0.1
SNX18-201ENST00000326277 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa14.43□□□□□ -0.1
SNX18-201ENST00000326277 VPS13DQ5THJ4 4388 aa14.42□□□□□ -0.1
SNX18-201ENST00000326277 HAMPP81172 84 aa14.41□□□□□ -0.1
SNX18-201ENST00000326277 ATOX1O00244 68 aa14.39□□□□□ -0.11
SNX18-201ENST00000326277 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
SNX18-201ENST00000326277 PRLHP81277 87 aa14.38□□□□□ -0.11
SNX18-201ENST00000326277 TNP2Q05952 138 aa14.37□□□□□ -0.11
SNX18-201ENST00000326277 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa14.37□□□□□ -0.11
SNX18-201ENST00000326277 PKIGQ9Y2B9 76 aa14.36□□□□□ -0.11
SNX18-201ENST00000326277 CXCL6P80162 114 aa14.34□□□□□ -0.11
SNX18-201ENST00000326277 PANO1I0J062 215 aa14.33□□□□□ -0.12
SNX18-201ENST00000326277 LINC00474Q9P2X8 69 aa14.32□□□□□ -0.12
SNX18-201ENST00000326277 A0A087WTM6 91 aa14.3□□□□□ -0.12
SNX18-201ENST00000326277 C3orf84H3BNL1 204 aa14.3□□□□□ -0.12
SNX18-201ENST00000326277 C1orf137Q5JT78 98 aa14.3□□□□□ -0.12
SNX18-201ENST00000326277 SMIM29Q86T20 159 aa14.3□□□□□ -0.12
SNX18-201ENST00000326277 HIGD2AQ9BW72 106 aa14.3□□□□□ -0.12
SNX18-201ENST00000326277 UQCRQO14949 82 aa14.29□□□□□ -0.12
SNX18-201ENST00000326277 Q6ZR54 194 aa14.29□□□□□ -0.12
SNX18-201ENST00000326277 SCXQ7RTU7 201 aa14.29□□□□□ -0.12
SNX18-201ENST00000326277 A0A1W2PNM2 257 aa14.29□□□□□ -0.12
SNX18-201ENST00000326277 COX7CP15954 63 aa14.29□□□□□ -0.12
SNX18-201ENST00000326277 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP14.26□□□□□ -0.13
SNX18-201ENST00000326277 NREPQ16612 68 aa14.26□□□□□ -0.13
SNX18-201ENST00000326277 DPH3Q96FX2 82 aa14.26□□□□□ -0.13
SNX18-201ENST00000326277 EPM2AB3EWF7 344 aa14.24□□□□□ -0.13
SNX18-201ENST00000326277 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
SNX18-201ENST00000326277 SERP2Q8N6R1 65 aa14.23□□□□□ -0.13
SNX18-201ENST00000326277 Q8NBF4 154 aa14.23□□□□□ -0.13
SNX18-201ENST00000326277 SPACA4Q8TDM5 124 aa14.23□□□□□ -0.13
SNX18-201ENST00000326277 H0Y9J4 135 aa14.22□□□□□ -0.13
SNX18-201ENST00000326277 C9orf153Q5TBE3 101 aa14.22□□□□□ -0.13
SNX18-201ENST00000326277 KMT2AQ03164 3969 aa14.21□□□□□ -0.13
SNX18-201ENST00000326277 A0A1B0GW54 56 aa14.21□□□□□ -0.13
SNX18-201ENST00000326277 F8WEM9 126 aa14.21□□□□□ -0.14
SNX18-201ENST00000326277 LINC00476Q8WZB0 136 aa14.21□□□□□ -0.14
SNX18-201ENST00000326277 FBN3Q75N90 2809 aa14.2□□□□□ -0.14
SNX18-201ENST00000326277 SPRR4Q96PI1 79 aa14.19□□□□□ -0.14
SNX18-201ENST00000326277 SS18L2Q9UHA2 77 aa14.19□□□□□ -0.14
SNX18-201ENST00000326277 RTL8CO15255 209 aa14.18□□□□□ -0.14
SNX18-201ENST00000326277 UBE2AP49459 152 aa14.18□□□□□ -0.14
SNX18-201ENST00000326277 DNAH2Q9P225 4427 aa14.17□□□□□ -0.14
SNX18-201ENST00000326277 A0A0G2JQZ4 141 aa14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms