RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531352.5

ACER3-210, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACER3, Length 2,093 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-210ENST00000531352 M0QXV9 152 aa7.22□□□□□ -1.25
ACER3-210ENST00000531352 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.22□□□□□ -1.25
ACER3-210ENST00000531352 HERC1Q15751 4861 aa7.22□□□□□ -1.25
ACER3-210ENST00000531352 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.21□□□□□ -1.25
ACER3-210ENST00000531352 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.21□□□□□ -1.25
ACER3-210ENST00000531352 C22orf24Q9Y442 160 aa7.21□□□□□ -1.25
ACER3-210ENST00000531352 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
ACER3-210ENST00000531352 LINC00158P58513 81 aa7.21□□□□□ -1.26
ACER3-210ENST00000531352 HERVK_113P61574 105 aa7.21□□□□□ -1.26
ACER3-210ENST00000531352 COX17Q14061 63 aa7.21□□□□□ -1.26
ACER3-210ENST00000531352 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.21□□□□□ -1.26
ACER3-210ENST00000531352 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
ACER3-210ENST00000531352 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
ACER3-210ENST00000531352 SFTA2Q6UW10 78 aa7.2□□□□□ -1.26
ACER3-210ENST00000531352 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.2□□□□□ -1.26
ACER3-210ENST00000531352 GAGE10A6NGK3 116 aa7.19□□□□□ -1.26
ACER3-210ENST00000531352 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.19□□□□□ -1.26
ACER3-210ENST00000531352 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.19□□□□□ -1.26
ACER3-210ENST00000531352 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.18□□□□□ -1.26
ACER3-210ENST00000531352 C20orf202A1L168 122 aa7.18□□□□□ -1.26
ACER3-210ENST00000531352 PCP2Q8IVA1 136 aa7.18□□□□□ -1.26
ACER3-210ENST00000531352 A0A0J9YXY3 114 aa7.18□□□□□ -1.26
ACER3-210ENST00000531352 HERV-K104P63124 156 aa7.18□□□□□ -1.26
ACER3-210ENST00000531352 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.18□□□□□ -1.26
ACER3-210ENST00000531352 NMUP48645 174 aa7.17□□□□□ -1.26
ACER3-210ENST00000531352 NPC2P61916 151 aa7.17□□□□□ -1.26
ACER3-210ENST00000531352 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.16□□□□□ -1.26
ACER3-210ENST00000531352 VPREB1P12018 145 aa7.16□□□□□ -1.26
ACER3-210ENST00000531352 C1orf137Q5JT78 98 aa7.16□□□□□ -1.26
ACER3-210ENST00000531352 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
ACER3-210ENST00000531352 LITAFQ99732 161 aa7.16□□□□□ -1.26
ACER3-210ENST00000531352 ZNF815PA8K554 130 aa7.16□□□□□ -1.26
ACER3-210ENST00000531352 SCGB1D1O95968 90 aa7.16□□□□□ -1.26
ACER3-210ENST00000531352 UBE2BP63146 152 aa7.16□□□□□ -1.26
ACER3-210ENST00000531352 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
ACER3-210ENST00000531352 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.16□□□□□ -1.26
ACER3-210ENST00000531352 LINC00167Q96N53 147 aa7.16□□□□□ -1.26
ACER3-210ENST00000531352 TNXBP22105 4242 aa7.16□□□□□ -1.26
ACER3-210ENST00000531352 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.15□□□□□ -1.26
ACER3-210ENST00000531352 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.13□□□□□ -1.27
ACER3-210ENST00000531352 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.13□□□□□ -1.27
ACER3-210ENST00000531352 NCR3O14931 201 aa7.13□□□□□ -1.27
ACER3-210ENST00000531352 IGKV2D-28P01615 120 aa7.13□□□□□ -1.27
ACER3-210ENST00000531352 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
ACER3-210ENST00000531352 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.13□□□□□ -1.27
ACER3-210ENST00000531352 IGLV7-43P04211 117 aa7.12□□□□□ -1.27
ACER3-210ENST00000531352 LINC00587B1AMM8 73 aa7.12□□□□□ -1.27
ACER3-210ENST00000531352 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
ACER3-210ENST00000531352 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
ACER3-210ENST00000531352 TMEM238C9JI98 176 aa7.1□□□□□ -1.27
ACER3-210ENST00000531352 PYY3Q5JQD4 70 aa7.1□□□□□ -1.27
ACER3-210ENST00000531352 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.1□□□□□ -1.27
ACER3-210ENST00000531352 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.09□□□□□ -1.27
ACER3-210ENST00000531352 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.09□□□□□ -1.27
ACER3-210ENST00000531352 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
ACER3-210ENST00000531352 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.09□□□□□ -1.27
ACER3-210ENST00000531352 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.08□□□□□ -1.28
ACER3-210ENST00000531352 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.08□□□□□ -1.28
ACER3-210ENST00000531352 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.08□□□□□ -1.28
ACER3-210ENST00000531352 OXTP01178 125 aa7.07□□□□□ -1.28
ACER3-210ENST00000531352 MT1HL1P0DM35 61 aa7.07□□□□□ -1.28
ACER3-210ENST00000531352 C14orf144Q96I85 54 aa7.07□□□□□ -1.28
ACER3-210ENST00000531352 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.06□□□□□ -1.28
ACER3-210ENST00000531352 M0R378 163 aa7.06□□□□□ -1.28
ACER3-210ENST00000531352 BCE1O60756 84 aa7.06□□□□□ -1.28
ACER3-210ENST00000531352 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.05□□□□□ -1.28
ACER3-210ENST00000531352 J3QL48 77 aa7.05□□□□□ -1.28
ACER3-210ENST00000531352 TIMM17BO60830 172 aa7.05□□□□□ -1.28
ACER3-210ENST00000531352 AKR1D1P51857 326 aa7.05□□□□□ -1.28
ACER3-210ENST00000531352 TMEM126AQ9H061 195 aa7.05□□□□□ -1.28
ACER3-210ENST00000531352 ZNF861PO60384 105 aa7.05□□□□□ -1.28
ACER3-210ENST00000531352 SPATA45Q537H7 98 aa7.05□□□□□ -1.28
ACER3-210ENST00000531352 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.05□□□□□ -1.28
ACER3-210ENST00000531352 H0Y9J4 135 aa7.04□□□□□ -1.28
ACER3-210ENST00000531352 PRLHP81277 87 aa7.04□□□□□ -1.28
ACER3-210ENST00000531352 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.04□□□□□ -1.28
ACER3-210ENST00000531352 REG3GQ6UW15 175 aa7.04□□□□□ -1.28
ACER3-210ENST00000531352 LINC01600Q96MT4 127 aa7.04□□□□□ -1.28
ACER3-210ENST00000531352 COX8AP10176 69 aa7.03□□□□□ -1.28
ACER3-210ENST00000531352 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.03□□□□□ -1.28
ACER3-210ENST00000531352 DIRC1Q969H9 104 aa7.03□□□□□ -1.28
ACER3-210ENST00000531352 VAMP8Q9BV40 100 aa7.03□□□□□ -1.28
ACER3-210ENST00000531352 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.03□□□□□ -1.28
ACER3-210ENST00000531352 SPANXCQ9NY87 97 aa7.03□□□□□ -1.28
ACER3-210ENST00000531352 NDUFC2O95298 119 aa7.02□□□□□ -1.29
ACER3-210ENST00000531352 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.02□□□□□ -1.29
ACER3-210ENST00000531352 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.01□□□□□ -1.29
ACER3-210ENST00000531352 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7□□□□□ -1.29
ACER3-210ENST00000531352 KRTAP10-8P60410 259 aa7□□□□□ -1.29
ACER3-210ENST00000531352 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7□□□□□ -1.29
ACER3-210ENST00000531352 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7□□□□□ -1.29
ACER3-210ENST00000531352 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
ACER3-210ENST00000531352 DDTP30046 118 aa7□□□□□ -1.29
ACER3-210ENST00000531352 RPL28P46779 137 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
ACER3-210ENST00000531352 UBE2AP49459 152 aa7□□□□□ -1.29
ACER3-210ENST00000531352 C2orf91Q6ZV80 131 aa7□□□□□ -1.29
ACER3-210ENST00000531352 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
ACER3-210ENST00000531352 IGLV6-57P01721 117 aa6.99□□□□□ -1.29
ACER3-210ENST00000531352 SPRR1AP35321 89 aa6.99□□□□□ -1.29
ACER3-210ENST00000531352 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 117.6 ms