RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461653.5

RABGGTB-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 1,702 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-204ENST00000461653 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 BPESC1Q9GZL8 116 aa2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 UQCR10Q9UDW1 63 aa2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 FREM3P0C091 2139 aa2.47□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 COL7A1Q02388 2944 aa2.47□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 DNAH9Q9NYC9 4486 aa2.47□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa2.47□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa2.47□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 TRAV2A0A0B4J234 112 aa2.47□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 GNGT2O14610 69 aa2.47□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 CBLN1P23435 193 aa2.47□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 RHOHQ15669 191 aa2.47□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 C10orf82Q8WW14 230 aa2.47□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 CSAG1Q6PB30 78 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 SSSCA1O60232 199 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 OR10AG1Q8NH19 301 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 PPDPFLQ8WWR9 84 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 MED12LQ86YW9 2145 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 NINQ8N4C6 2090 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 CYB5AP00167 134 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 SPRNQ5BIV9 151 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 LYPD5Q6UWN5 251 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 NPVFQ9HCQ7 196 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 IGLC7A0M8Q6 106 aa2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 K7EP34 96 aa2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 CFDP00746 253 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 TDRG1Q3Y452 100 aa2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 COMMD6Q7Z4G1 85 aa2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 ORMDL1Q9P0S3 153 aa2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 LYNX1G3V0Z9 82 aa2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 LYNX1P0DP58 116 aa2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 Q0VG73 95 aa2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 HEPN1Q6WQI6 88 aa2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 LIMD2Q9BT23 127 aa2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 LINC00474Q9P2X8 69 aa2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 STAB2Q8WWQ8 2551 aa2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 KIAA1109Q2LD37 5005 aa2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 HERC1Q15751 4861 aa2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 LCE6AA0A183 80 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 hADV29S1A0JD25 119 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 H3BRN7 92 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 CCKP06307 115 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 ADIRFQ15847 76 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 IGFL1Q6UW32 110 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 TVP23CQ96ET8 276 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 PMCHL2Q9BQD1 86 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 CSMD3Q7Z407 3707 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 ABCA13Q86UQ4 5058 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 HCG22E2RYF7 251 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 SIX6O95475 246 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 SFT2D2O95562 160 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 IGHV3-33P01772 117 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 C4orf3Q8WVX3 66 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 IFI27L1Q96BM0 104 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 DNAH3Q8TD57 4116 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 CLPSL1A2RUU4 121 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 H3BRM9 83 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 K7EIL1 84 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 DEFB121Q5J5C9 76 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 LYSTQ99698 3801 aa2.4□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa2.4□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa2.4□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 ST20Q9HBF5 79 aa2.4□□□□□ -2.02
RABGGTB-204ENST00000461653 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.4□□□□□ -2.03
RABGGTB-204ENST00000461653 EXPH5Q8NEV8 1989 aa2.4□□□□□ -2.03
RABGGTB-204ENST00000461653 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa2.39□□□□□ -2.03
RABGGTB-204ENST00000461653 C7orf77A4D0Y5 90 aa2.39□□□□□ -2.03
RABGGTB-204ENST00000461653 GYPAP02724 150 aa2.39□□□□□ -2.03
RABGGTB-204ENST00000461653 IGLC2P0DOY2 106 aa2.39□□□□□ -2.03
RABGGTB-204ENST00000461653 IGLC3P0DOY3 106 aa2.39□□□□□ -2.03
RABGGTB-204ENST00000461653 SEC11AP67812 179 aa2.39□□□□□ -2.03
RABGGTB-204ENST00000461653 LINC00304Q8N9R0 145 aa2.39□□□□□ -2.03
RABGGTB-204ENST00000461653 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa2.39□□□□□ -2.03
RABGGTB-204ENST00000461653 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
RABGGTB-204ENST00000461653 CACFD1Q9UGQ2 172 aa2.39□□□□□ -2.03
RABGGTB-204ENST00000461653 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.39□□□□□ -2.03
RABGGTB-204ENST00000461653 ASIPP42127 132 aa2.39□□□□□ -2.03
RABGGTB-204ENST00000461653 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa2.39□□□□□ -2.03
RABGGTB-204ENST00000461653 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.39□□□□□ -2.03
RABGGTB-204ENST00000461653 C22orf24Q9Y442 160 aa2.39□□□□□ -2.03
RABGGTB-204ENST00000461653 SPCS1Q9Y6A9 102 aa2.39□□□□□ -2.03
RABGGTB-204ENST00000461653 FRAS1Q86XX4 4008 aa2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-204ENST00000461653 PLCE1Q9P212 2302 aa2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-204ENST00000461653 A0A087WWC5 75 aa2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-204ENST00000461653 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-204ENST00000461653 PPYP01298 95 aa2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-204ENST00000461653 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-204ENST00000461653 SPATA45Q537H7 98 aa2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-204ENST00000461653 DEFB108BQ8NET1 73 aa2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM213BQ8TBF2 198 aa2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 152.4 ms