RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411348.1

RNU6-57P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 57, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-57P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-57P-201ENST00000411348 TRANK1O15050 2925 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 MYH7P12883 1935 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 REV3LO60673 3130 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 hADV29S1A0JD25 119 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 H3BNG1 76 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 DLEU1O43261 78 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 S100A1P23297 94 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 NMSQ5H8A3 153 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 ALKAL2Q6UX46 152 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 SLIT1O75093 1534 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 MYOM2P54296 1465 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 HTTP42858 3142 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 MUC17Q685J3 4493 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 DNAH9Q9NYC9 4486 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 LAMA1P25391 3075 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 PTPN23Q9H3S7 1636 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 FOCADQ5VW36 1801 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 A0A1B0GV90 55 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 C9orf92A6NGG3 77 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 MPC2O95563 127 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 ASIPP42127 132 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 TRGV9Q99603 122 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 GNG8Q9UK08 70 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 AP4S1Q9Y587 144 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 ARHGAP5Q13017 1502 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 PHLPP1O60346 1717 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 QRICH2Q9H0J4 1663 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 ADAMTS12P58397 1594 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 VPS13DQ5THJ4 4388 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 DMXL1Q9Y485 3027 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 GNGT2O14610 69 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 UQCRHP07919 91 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 HMGN3Q15651 99 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 COX6B2Q6YFQ2 88 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 TMEM203Q969S6 136 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 ACACAQ13085 2346 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 SHROOM2Q13796 1616 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 FAT3Q8TDW7 4589 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 TCHHQ07283 1943 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 MAPKBP1O60336 1514 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 AKAP9Q99996 3911 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 TMEM218A2RU14 115 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 H7BZZ5 65 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 IGLC2P0DOY2 106 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 IGLC3P0DOY3 106 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 MTORP42345 2549 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 ABCC5O15440 1437 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 LRRC37AA6NMS7 1700 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 MGAM2Q2M2H8 2515 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 LYSTQ99698 3801 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 DNAH3Q8TD57 4116 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 D6R8Y8 96 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 MUSTN1Q8IVN3 82 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 C2orf88Q9BSF0 95 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 ZZEF1O43149 2961 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 COL4A6Q14031 1691 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 PZPP20742 1482 aa-0.6□□□□□ -2.5
RNU6-57P-201ENST00000411348 C20orf202A1L168 122 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-57P-201ENST00000411348 NDUFA3O95167 84 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-57P-201ENST00000411348 LEPROTL1O95214 131 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-57P-201ENST00000411348 ZNF720Q7Z2F6 126 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-57P-201ENST00000411348 SERP2Q8N6R1 65 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-57P-201ENST00000411348 SCN7AQ01118 1682 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-57P-201ENST00000411348 BIRC6Q9NR09 4857 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-57P-201ENST00000411348 NBEAQ8NFP9 2946 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-57P-201ENST00000411348 TOP2BQ02880 1626 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-57P-201ENST00000411348 MLH3Q9UHC1 1453 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-57P-201ENST00000411348 UNC13AQ9UPW8 1703 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-57P-201ENST00000411348 SAMD9Q5K651 1589 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-57P-201ENST00000411348 CUBNO60494 3623 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-57P-201ENST00000411348 ATOX1O00244 68 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-57P-201ENST00000411348 COX7BP24311 80 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-57P-201ENST00000411348 RPL38P63173 70 aaKnown RBP-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-57P-201ENST00000411348 ETDBQ3ZM63 59 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-57P-201ENST00000411348 PMCHL2Q9BQD1 86 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-57P-201ENST00000411348 ABCC2Q92887 1545 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-57P-201ENST00000411348 NUP188Q5SRE5 1749 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-57P-201ENST00000411348 KNDC1Q76NI1 1749 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-57P-201ENST00000411348 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-57P-201ENST00000411348 NRKQ7Z2Y5 1582 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-57P-201ENST00000411348 LRRK2Q5S007 2527 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-57P-201ENST00000411348 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-57P-201ENST00000411348 LINC00587B1AMM8 73 aa-0.62□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms