RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410554.1

RNU6-77P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 77, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-77P, Length 91 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-77P-201ENST00000410554 RGPD2P0DJD1 1756 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-77P-201ENST00000410554 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-77P-201ENST00000410554 I3L3M4 83 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-77P-201ENST00000410554 SAMD9Q5K651 1589 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-77P-201ENST00000410554 UBR3Q6ZT12 1888 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-77P-201ENST00000410554 HIGD1BQ9P298 99 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-77P-201ENST00000410554 ATP10BO94823 1461 aa-0.1□□□□□ -2.42
RNU6-77P-201ENST00000410554 GYPAP02724 150 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-77P-201ENST00000410554 MYO3AQ8NEV4 1616 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-77P-201ENST00000410554 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-77P-201ENST00000410554 BCORQ6W2J9 1755 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-77P-201ENST00000410554 TNXBP22105 4242 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-77P-201ENST00000410554 BSNQ9UPA5 3926 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-77P-201ENST00000410554 FAT2Q9NYQ8 4349 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-77P-201ENST00000410554 FLNCQ14315 2725 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-77P-201ENST00000410554 QSER1Q2KHR3 1735 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-77P-201ENST00000410554 C20orf78Q9BR46 151 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-77P-201ENST00000410554 IQSEC2Q5JU85 1478 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-77P-201ENST00000410554 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-77P-201ENST00000410554 IGLC2P0DOY2 106 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-77P-201ENST00000410554 IGLC3P0DOY3 106 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-77P-201ENST00000410554 Q9H521 79 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-77P-201ENST00000410554 ATRQ13535 2644 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-77P-201ENST00000410554 ALKQ9UM73 1620 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-77P-201ENST00000410554 SPTA1P02549 2419 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-77P-201ENST00000410554 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-77P-201ENST00000410554 SMIM11AP58511 58 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-77P-201ENST00000410554 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-77P-201ENST00000410554 TTC37Q6PGP7 1564 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-77P-201ENST00000410554 PEA15Q15121 130 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-77P-201ENST00000410554 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-77P-201ENST00000410554 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-77P-201ENST00000410554 WNK1Q9H4A3 2382 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-77P-201ENST00000410554 LPAP08519 4548 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-77P-201ENST00000410554 DEFB112Q30KQ8 113 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-77P-201ENST00000410554 DCHS2Q6V1P9 2916 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-77P-201ENST00000410554 HSPG2P98160 4391 aa-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-77P-201ENST00000410554 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP-0.18□□□□□ -2.44
RNU6-77P-201ENST00000410554 PPLO60437 1756 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-77P-201ENST00000410554 CEP162Q5TB80 1403 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-77P-201ENST00000410554 M0R2T5 61 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-77P-201ENST00000410554 RGPD1P0DJD0 1748 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-77P-201ENST00000410554 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-77P-201ENST00000410554 V9GYS6 101 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-77P-201ENST00000410554 CCL22O00626 93 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-77P-201ENST00000410554 NMSQ5H8A3 153 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-77P-201ENST00000410554 PYY3Q5JQD4 70 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-77P-201ENST00000410554 CLIP1P30622 1438 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-77P-201ENST00000410554 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-77P-201ENST00000410554 APC2O95996 2303 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-77P-201ENST00000410554 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-77P-201ENST00000410554 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-77P-201ENST00000410554 ALMS1Q8TCU4 4167 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-77P-201ENST00000410554 PLGLAQ15195 96 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-77P-201ENST00000410554 HEPN1Q6WQI6 88 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-77P-201ENST00000410554 ABCC3O15438 1527 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-77P-201ENST00000410554 CHD8Q9HCK8 2581 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-77P-201ENST00000410554 LTN1O94822 1766 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-77P-201ENST00000410554 ZANQ9Y493 2812 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-77P-201ENST00000410554 A0A1B0GUT8 65 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-77P-201ENST00000410554 SPRR2BP35325 72 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-77P-201ENST00000410554 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-77P-201ENST00000410554 MAGI2Q86UL8 1455 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-77P-201ENST00000410554 LRRC7Q96NW7 1537 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-77P-201ENST00000410554 TIAM2Q8IVF5 1701 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-77P-201ENST00000410554 PREX1Q8TCU6 1659 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-77P-201ENST00000410554 ATP7BP35670 1465 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-77P-201ENST00000410554 IQCF6A8MYZ5 107 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-77P-201ENST00000410554 K7EP34 96 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-77P-201ENST00000410554 COX7BP24311 80 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-77P-201ENST00000410554 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-77P-201ENST00000410554 SSPOA2VEC9 5147 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-77P-201ENST00000410554 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-77P-201ENST00000410554 PLIN4Q96Q06 1357 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-77P-201ENST00000410554 LELP1Q5T871 98 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-77P-201ENST00000410554 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-77P-201ENST00000410554 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-77P-201ENST00000410554 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-77P-201ENST00000410554 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-77P-201ENST00000410554 RGPD5Q99666 1765 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-77P-201ENST00000410554 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-77P-201ENST00000410554 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-77P-201ENST00000410554 CYB5AP00167 134 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-77P-201ENST00000410554 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-77P-201ENST00000410554 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-77P-201ENST00000410554 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-77P-201ENST00000410554 GAFA1Q96PS6 74 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-77P-201ENST00000410554 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-77P-201ENST00000410554 LRP2P98164 4655 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-77P-201ENST00000410554 KIF14Q15058 1648 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-77P-201ENST00000410554 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-77P-201ENST00000410554 DEFB135Q30KP9 77 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-77P-201ENST00000410554 WFDC13Q8IUB5 93 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-77P-201ENST00000410554 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-77P-201ENST00000410554 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-77P-201ENST00000410554 RPL38P63173 70 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-77P-201ENST00000410554 C9orf62Q8N4C0 152 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-77P-201ENST00000410554 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-77P-201ENST00000410554 C4AP0C0L4 1744 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-77P-201ENST00000410554 C4BP0C0L5 1744 aa-0.34□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 104.8 ms