RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262305.8

RAB11FIP3-201, Transcript of RAB11 family interacting protein 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB11FIP3, Length 4,831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3-201ENST00000262305 BRK1Q8WUW1 75 aa14.96□□□□□ -0.01
RAB11FIP3-201ENST00000262305 CDIP1Q9H305 208 aa14.96□□□□□ -0.01
RAB11FIP3-201ENST00000262305 PRO0461Q9UI25 63 aa14.96□□□□□ -0.02
RAB11FIP3-201ENST00000262305 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa14.95□□□□□ -0.02
RAB11FIP3-201ENST00000262305 MDFIQ99750 246 aa14.95□□□□□ -0.02
RAB11FIP3-201ENST00000262305 Q8N9L7 120 aa14.95□□□□□ -0.02
RAB11FIP3-201ENST00000262305 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa14.95□□□□□ -0.02
RAB11FIP3-201ENST00000262305 PRR4Q16378 134 aa14.95□□□□□ -0.02
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SMCR5Q8TEV8 140 aa14.93□□□□□ -0.02
RAB11FIP3-201ENST00000262305 LINC00167Q96N53 147 aa14.93□□□□□ -0.02
RAB11FIP3-201ENST00000262305 FAM218AQ96MZ4 157 aa14.92□□□□□ -0.02
RAB11FIP3-201ENST00000262305 USP24Q9UPU5 2620 aa14.91□□□□□ -0.02
RAB11FIP3-201ENST00000262305 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
RAB11FIP3-201ENST00000262305 V9GYY9 64 aa14.9□□□□□ -0.02
RAB11FIP3-201ENST00000262305 LITAFQ99732 161 aa14.9□□□□□ -0.02
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa14.89□□□□□ -0.03
RAB11FIP3-201ENST00000262305 LINC00208Q96KT6 92 aa14.89□□□□□ -0.03
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa14.89□□□□□ -0.03
RAB11FIP3-201ENST00000262305 KIAA0087Q14695 138 aa14.88□□□□□ -0.03
RAB11FIP3-201ENST00000262305 MGAM2Q2M2H8 2515 aa14.87□□□□□ -0.03
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SPATA3Q8NHX4 192 aa14.86□□□□□ -0.03
RAB11FIP3-201ENST00000262305 LINC00588Q9Y4M8 146 aa14.86□□□□□ -0.03
RAB11FIP3-201ENST00000262305 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP3-201ENST00000262305 CXCL6P80162 114 aa14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP3-201ENST00000262305 C19orf73Q9NVV2 129 aa14.85□□□□□ -0.03
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TRANK1O15050 2925 aa14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP3-201ENST00000262305 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
RAB11FIP3-201ENST00000262305 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
RAB11FIP3-201ENST00000262305 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
RAB11FIP3-201ENST00000262305 DEFB116Q30KQ4 102 aa14.81□□□□□ -0.04
RAB11FIP3-201ENST00000262305 DNAH10OSP0CZ25 163 aa14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SPTSSBQ8NFR3 76 aa14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP3-201ENST00000262305 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa14.78□□□□□ -0.04
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SMIM26A0A096LP01 95 aa14.77□□□□□ -0.04
RAB11FIP3-201ENST00000262305 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa14.76□□□□□ -0.05
RAB11FIP3-201ENST00000262305 HCG22E2RYF7 251 aa14.76□□□□□ -0.05
RAB11FIP3-201ENST00000262305 Q6ZRX8 168 aa14.76□□□□□ -0.05
RAB11FIP3-201ENST00000262305 CENPEQ02224 2701 aa14.76□□□□□ -0.05
RAB11FIP3-201ENST00000262305 PRR15LQ9BU68 103 aa14.76□□□□□ -0.05
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ITPR3Q14573 2671 aa14.75□□□□□ -0.05
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TMEM254Q8TBM7 123 aa14.75□□□□□ -0.05
RAB11FIP3-201ENST00000262305 BPTFQ12830 3046 aa14.75□□□□□ -0.05
RAB11FIP3-201ENST00000262305 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SERP1Q9Y6X1 66 aa14.74□□□□□ -0.05
RAB11FIP3-201ENST00000262305 A0A1B0GW54 56 aa14.74□□□□□ -0.05
RAB11FIP3-201ENST00000262305 KRTAP10-3P60369 221 aa14.74□□□□□ -0.05
RAB11FIP3-201ENST00000262305 LINC00612Q8N6U2 182 aa14.73□□□□□ -0.05
RAB11FIP3-201ENST00000262305 C16orf90A8MZG2 172 aa14.72□□□□□ -0.05
RAB11FIP3-201ENST00000262305 VPREB1P12018 145 aa14.7□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-201ENST00000262305 Q6ZRP5 223 aa14.7□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-201ENST00000262305 Q6ZQT0 140 aa14.7□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-201ENST00000262305 LAMA3Q16787 3333 aa14.7□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-201ENST00000262305 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa14.69□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ATRQ13535 2644 aa14.69□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-201ENST00000262305 H0Y9P7 68 aa14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-201ENST00000262305 PRR34Q9NV39 138 aa14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-201ENST00000262305 KRTAP10-11P60412 298 aa14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ZNF292O60281 2723 aa14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-201ENST00000262305 IGLV6-57P01721 117 aa14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-201ENST00000262305 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-201ENST00000262305 KRTAP1-1Q07627 177 aa14.67□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-201ENST00000262305 Q8NBF4 154 aa14.67□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-201ENST00000262305 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-201ENST00000262305 CFAP46Q8IYW2 2715 aa14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-201ENST00000262305 LIMD2Q9BT23 127 aa14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-201ENST00000262305 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RAB11FIP3-201ENST00000262305 A6NED7 52 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-201ENST00000262305 K7EIL1 84 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-201ENST00000262305 PCOTHQ58A44 107 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-201ENST00000262305 BCE1O60756 84 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-201ENST00000262305 LINC00476Q8WZB0 136 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-201ENST00000262305 K7ERS5 55 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-201ENST00000262305 RTL8CO15255 209 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-201ENST00000262305 MOBPQ13875 183 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-201ENST00000262305 EPM2AB3EWF7 344 aa14.61□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-201ENST00000262305 MAST4O15021 2626 aa14.6□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SMIM29Q86T20 159 aa14.6□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa14.6□□□□□ -0.07
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SVIPQ8NHG7 77 aa14.58□□□□□ -0.08
RAB11FIP3-201ENST00000262305 hDV103S1A0JD37 113 aa14.58□□□□□ -0.08
RAB11FIP3-201ENST00000262305 A0A0U1RQV1 116 aa14.57□□□□□ -0.08
RAB11FIP3-201ENST00000262305 CHTF8P0CG12 524 aa14.57□□□□□ -0.08
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa14.54□□□□□ -0.08
RAB11FIP3-201ENST00000262305 RETNLBQ9BQ08 111 aa14.54□□□□□ -0.08
RAB11FIP3-201ENST00000262305 MGAQ8IWI9 3026 aa14.53□□□□□ -0.08
RAB11FIP3-201ENST00000262305 CRYGAP11844 174 aa14.53□□□□□ -0.08
RAB11FIP3-201ENST00000262305 KCNQ1DNQ9H478 68 aa14.53□□□□□ -0.08
RAB11FIP3-201ENST00000262305 C1orf64Q8NEQ6 169 aa14.53□□□□□ -0.08
RAB11FIP3-201ENST00000262305 C15orf56Q8N910 161 aa14.52□□□□□ -0.08
RAB11FIP3-201ENST00000262305 FAM168BA1KXE4 195 aa14.52□□□□□ -0.08
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ZNF575Q86XF7 245 aa14.52□□□□□ -0.08
RAB11FIP3-201ENST00000262305 LINC00528Q8N1L1 170 aa14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP3-201ENST00000262305 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa14.5□□□□□ -0.09
RAB11FIP3-201ENST00000262305 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa14.49□□□□□ -0.09
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa14.48□□□□□ -0.09
RAB11FIP3-201ENST00000262305 BRCA2P51587 3418 aa14.47□□□□□ -0.09
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa14.46□□□□□ -0.09
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TM2D3Q9BRN9 247 aa14.45□□□□□ -0.1
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SPACA4Q8TDM5 124 aa14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61 ms