RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580081.1

CLTC-212, Transcript of clathrin heavy chain, humanhuman

TSL 4

Gene CLTC, Length 575 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTC-212ENST00000580081 TM2D2Q9BX73 214 aa5.86□□□□□ -1.47
CLTC-212ENST00000580081 NDUFA1O15239 70 aa5.85□□□□□ -1.47
CLTC-212ENST00000580081 PRSS2P07478 247 aa5.85□□□□□ -1.47
CLTC-212ENST00000580081 DDTP30046 118 aa5.85□□□□□ -1.47
CLTC-212ENST00000580081 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CLTC-212ENST00000580081 Q8IZM0 81 aa5.85□□□□□ -1.47
CLTC-212ENST00000580081 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa5.85□□□□□ -1.47
CLTC-212ENST00000580081 ORAOV1Q8WV07 137 aa5.85□□□□□ -1.47
CLTC-212ENST00000580081 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa5.85□□□□□ -1.47
CLTC-212ENST00000580081 TTTY13Q9BZ97 58 aa5.85□□□□□ -1.47
CLTC-212ENST00000580081 NDUFA12Q9UI09 145 aa5.85□□□□□ -1.47
CLTC-212ENST00000580081 H3BS24 57 aa5.84□□□□□ -1.47
CLTC-212ENST00000580081 CXCL5P42830 114 aa5.84□□□□□ -1.47
CLTC-212ENST00000580081 HERV-K104P63124 156 aa5.84□□□□□ -1.47
CLTC-212ENST00000580081 CFAP161Q6P656 301 aa5.84□□□□□ -1.47
CLTC-212ENST00000580081 LINC00476Q8WZB0 136 aa5.84□□□□□ -1.47
CLTC-212ENST00000580081 TOMM7Q9P0U1 55 aa5.84□□□□□ -1.47
CLTC-212ENST00000580081 HIGD1BQ9P298 99 aa5.84□□□□□ -1.47
CLTC-212ENST00000580081 PCP4L1A6NKN8 68 aa5.83□□□□□ -1.48
CLTC-212ENST00000580081 SPAG11BQ08648 103 aa5.83□□□□□ -1.48
CLTC-212ENST00000580081 C6orf226Q5I0X4 101 aa5.83□□□□□ -1.48
CLTC-212ENST00000580081 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.83□□□□□ -1.48
CLTC-212ENST00000580081 SCGB1D4Q6XE38 83 aa5.83□□□□□ -1.48
CLTC-212ENST00000580081 C2orf91Q6ZV80 131 aa5.83□□□□□ -1.48
CLTC-212ENST00000580081 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
CLTC-212ENST00000580081 TP73-AS1Q9UF72 201 aa5.83□□□□□ -1.48
CLTC-212ENST00000580081 STARD9Q9P2P6 4700 aa5.82□□□□□ -1.48
CLTC-212ENST00000580081 LY6G6CO95867 125 aa5.82□□□□□ -1.48
CLTC-212ENST00000580081 CKS1BP61024 79 aa5.82□□□□□ -1.48
CLTC-212ENST00000580081 KIAA0087Q14695 138 aa5.82□□□□□ -1.48
CLTC-212ENST00000580081 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
CLTC-212ENST00000580081 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.82□□□□□ -1.48
CLTC-212ENST00000580081 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
CLTC-212ENST00000580081 A0A0J9YXY3 114 aa5.81□□□□□ -1.48
CLTC-212ENST00000580081 F8WDY8 70 aa5.81□□□□□ -1.48
CLTC-212ENST00000580081 TIMM17BO60830 172 aa5.81□□□□□ -1.48
CLTC-212ENST00000580081 Q6ZR54 194 aa5.81□□□□□ -1.48
CLTC-212ENST00000580081 C15orf56Q8N910 161 aa5.81□□□□□ -1.48
CLTC-212ENST00000580081 LINC00587B1AMM8 73 aa5.8□□□□□ -1.48
CLTC-212ENST00000580081 TMEM238C9JI98 176 aa5.8□□□□□ -1.48
CLTC-212ENST00000580081 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa5.8□□□□□ -1.48
CLTC-212ENST00000580081 PSCAO43653 123 aa5.8□□□□□ -1.48
CLTC-212ENST00000580081 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
CLTC-212ENST00000580081 C2orf48Q96LS8 159 aa5.8□□□□□ -1.48
CLTC-212ENST00000580081 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
CLTC-212ENST00000580081 VPS13DQ5THJ4 4388 aa5.79□□□□□ -1.48
CLTC-212ENST00000580081 USP17L23D6RBM5 183 aa5.79□□□□□ -1.48
CLTC-212ENST00000580081 CTAG1AP78358 180 aa5.79□□□□□ -1.48
CLTC-212ENST00000580081 HSD52Q0P140 79 aa5.79□□□□□ -1.48
CLTC-212ENST00000580081 TAL2Q16559 108 aa5.79□□□□□ -1.48
CLTC-212ENST00000580081 HIGD2BQ4VC39 106 aa5.79□□□□□ -1.48
CLTC-212ENST00000580081 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
CLTC-212ENST00000580081 M0R143 59 aa5.78□□□□□ -1.48
CLTC-212ENST00000580081 M0R2N4 97 aa5.78□□□□□ -1.48
CLTC-212ENST00000580081 C14orf177Q52M58 125 aa5.78□□□□□ -1.48
CLTC-212ENST00000580081 MEIG1Q5JSS6 88 aa5.78□□□□□ -1.48
CLTC-212ENST00000580081 C2orf82Q6UX34 121 aa5.78□□□□□ -1.48
CLTC-212ENST00000580081 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
CLTC-212ENST00000580081 Q6ZVH6 145 aa5.78□□□□□ -1.48
CLTC-212ENST00000580081 C6orf223Q8N319 242 aa5.78□□□□□ -1.48
CLTC-212ENST00000580081 CAMK2N2Q96S95 79 aa5.78□□□□□ -1.48
CLTC-212ENST00000580081 HIST1H4GQ99525 98 aa5.78□□□□□ -1.48
CLTC-212ENST00000580081 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.78□□□□□ -1.48
CLTC-212ENST00000580081 ERG28Q9UKR5 140 aa5.78□□□□□ -1.48
CLTC-212ENST00000580081 DNAH1Q9P2D7 4330 aa5.78□□□□□ -1.48
CLTC-212ENST00000580081 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa5.77□□□□□ -1.49
CLTC-212ENST00000580081 GCSHP23434 173 aa5.77□□□□□ -1.49
CLTC-212ENST00000580081 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.77□□□□□ -1.49
CLTC-212ENST00000580081 COX17Q14061 63 aa5.77□□□□□ -1.49
CLTC-212ENST00000580081 LITAFQ99732 161 aa5.77□□□□□ -1.49
CLTC-212ENST00000580081 SPANXDQ9BXN6 97 aa5.77□□□□□ -1.49
CLTC-212ENST00000580081 SPANXCQ9NY87 97 aa5.77□□□□□ -1.49
CLTC-212ENST00000580081 ALMS1Q8TCU4 4167 aa5.77□□□□□ -1.49
CLTC-212ENST00000580081 SMIM13P0DJ93 91 aa5.76□□□□□ -1.49
CLTC-212ENST00000580081 SYCNQ0VAF6 134 aa5.76□□□□□ -1.49
CLTC-212ENST00000580081 C1orf134Q5TEV5 83 aa5.76□□□□□ -1.49
CLTC-212ENST00000580081 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa5.76□□□□□ -1.49
CLTC-212ENST00000580081 COPS9Q8WXC6 57 aa5.76□□□□□ -1.49
CLTC-212ENST00000580081 LINC00526Q96FQ7 95 aa5.76□□□□□ -1.49
CLTC-212ENST00000580081 LECT2O14960 151 aa5.75□□□□□ -1.49
CLTC-212ENST00000580081 IFITM1P13164 125 aa5.75□□□□□ -1.49
CLTC-212ENST00000580081 LINC00158P58513 81 aa5.75□□□□□ -1.49
CLTC-212ENST00000580081 RNF151Q2KHN1 245 aa5.75□□□□□ -1.49
CLTC-212ENST00000580081 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa5.75□□□□□ -1.49
CLTC-212ENST00000580081 C10orf25Q5T742 122 aa5.75□□□□□ -1.49
CLTC-212ENST00000580081 CEND1Q8N111 149 aa5.75□□□□□ -1.49
CLTC-212ENST00000580081 CARD19Q96LW7 228 aa5.75□□□□□ -1.49
CLTC-212ENST00000580081 LYSTQ99698 3801 aa5.75□□□□□ -1.49
CLTC-212ENST00000580081 PPDPFQ9H3Y8 114 aa5.75□□□□□ -1.49
CLTC-212ENST00000580081 LCE6AA0A183 80 aa5.74□□□□□ -1.49
CLTC-212ENST00000580081 LRCOL1A6NCL2 159 aa5.74□□□□□ -1.49
CLTC-212ENST00000580081 PFN2P35080 140 aa5.74□□□□□ -1.49
CLTC-212ENST00000580081 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
CLTC-212ENST00000580081 PTTG1IPP53801 180 aa5.74□□□□□ -1.49
CLTC-212ENST00000580081 WFDC2Q14508 124 aa5.74□□□□□ -1.49
CLTC-212ENST00000580081 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa5.74□□□□□ -1.49
CLTC-212ENST00000580081 Q6ZRU5 148 aa5.74□□□□□ -1.49
CLTC-212ENST00000580081 C6orf48Q9UBA6 75 aa5.74□□□□□ -1.49
CLTC-212ENST00000580081 A0A0U1RRA0 63 aa5.73□□□□□ -1.49
CLTC-212ENST00000580081 CNBPP62633 177 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms