RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa5.06□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 ABCA1O95477 2261 aa5.06□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 DCHS2Q6V1P9 2916 aa5.06□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa5.06□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 SMIM1B2RUZ4 78 aa5.06□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 K7EMT4 169 aa5.06□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 NDUFS5O43920 106 aa5.06□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 CDK2AP2O75956 126 aa5.06□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 IGF1P05019 195 aa5.06□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 SS18Q15532 418 aa5.06□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 ODF3L2Q3SX64 289 aa5.06□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 SMIM11BQ8TCY0 68 aa5.06□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 Q9HAA7 133 aa5.06□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 CSMD2Q7Z408 3487 aa5.06□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 CENPEQ02224 2701 aa5.06□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 APCP25054 2843 aa5.05□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 ITPR2Q14571 2701 aa5.05□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa5.05□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 A0A087WZ39 114 aa5.05□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa5.05□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 ATP6V0E1O15342 81 aa5.05□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa5.05□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 HILS1P60008 231 aa5.05□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 DEFB114Q30KQ6 69 aa5.05□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 MUC7Q8TAX7 377 aa5.05□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 TMEM254Q8TBM7 123 aa5.05□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa5.05□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 NOTCH2Q04721 2471 aa5.05□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 CELSR2Q9HCU4 2923 aa5.05□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 CCDC168Q8NDH2 2452 aa5.04□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 A0A087WYN8 130 aa5.04□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 LECT2O14960 151 aa5.04□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 NDPQ00604 133 aa5.04□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 DEFB113Q30KQ7 82 aa5.04□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 LINC00242Q5T6M2 205 aa5.04□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 LINC00337Q8N6G1 96 aa5.04□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 USMG5Q96IX5 58 aa5.04□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 TM2D3Q9BRN9 247 aa5.04□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 LINC00467Q9BRT7 94 aa5.04□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 LINC00474Q9P2X8 69 aa5.04□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 VPS13CQ709C8 3753 aa5.04□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 MYO9AB2RTY4 2548 aa5.03□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 CR1P17927 2039 aa5.03□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa5.03□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 A0A1B0GW54 56 aa5.03□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa5.03□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 NCR3O14931 201 aa5.03□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 PAX4O43316 350 aa5.03□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 IGKV2D-28P01615 120 aa5.03□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP5.03□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 Q6ZQT0 140 aa5.03□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 Q6ZTC4 211 aa5.03□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 Q6ZVQ6 151 aa5.03□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 C6orf223Q8N319 242 aa5.03□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 Q8N814 137 aa5.03□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 Q8N9W7 124 aa5.03□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 RMI2Q96E14 147 aa5.03□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 MED13LQ71F56 2210 aa5.03□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 PDZD2O15018 2839 aa5.02□□□□□ -1.61
PKP4-211ENST00000481115 AKAP9Q99996 3911 aa5.02□□□□□ -1.61
PKP4-211ENST00000481115 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa5.02□□□□□ -1.61
PKP4-211ENST00000481115 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa5.02□□□□□ -1.61
PKP4-211ENST00000481115 LY6HO94772 140 aa5.02□□□□□ -1.61
PKP4-211ENST00000481115 IGHV3-53P01767 116 aa5.02□□□□□ -1.61
PKP4-211ENST00000481115 DAD1P61803 113 aa5.02□□□□□ -1.61
PKP4-211ENST00000481115 UBE2BP63146 152 aa5.02□□□□□ -1.61
PKP4-211ENST00000481115 NREPQ16612 68 aa5.02□□□□□ -1.61
PKP4-211ENST00000481115 FAM74A4Q5TZK3 123 aa5.02□□□□□ -1.61
PKP4-211ENST00000481115 CLEC19AQ6UXS0 136 aa5.02□□□□□ -1.61
PKP4-211ENST00000481115 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.02□□□□□ -1.61
PKP4-211ENST00000481115 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.02□□□□□ -1.61
PKP4-211ENST00000481115 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.02□□□□□ -1.61
PKP4-211ENST00000481115 ESM1Q9NQ30 184 aa5.02□□□□□ -1.61
PKP4-211ENST00000481115 S4R3C0 116 aa5.02□□□□□ -1.61
PKP4-211ENST00000481115 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP5.01□□□□□ -1.611e-7■■■□□ 18.2
PKP4-211ENST00000481115 LRBAP50851 2863 aa5.01□□□□□ -1.61
PKP4-211ENST00000481115 CREBBPQ92793 2442 aa5.01□□□□□ -1.61
PKP4-211ENST00000481115 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa5.01□□□□□ -1.61
PKP4-211ENST00000481115 hDV103S1A0JD37 113 aa5.01□□□□□ -1.61
PKP4-211ENST00000481115 CYSRT1A8MQ03 144 aa5.01□□□□□ -1.61
PKP4-211ENST00000481115 K7EQD1 137 aa5.01□□□□□ -1.61
PKP4-211ENST00000481115 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
PKP4-211ENST00000481115 COX7A1P24310 79 aa5.01□□□□□ -1.61
PKP4-211ENST00000481115 PROK1P58294 105 aa5.01□□□□□ -1.61
PKP4-211ENST00000481115 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
PKP4-211ENST00000481115 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.01□□□□□ -1.61
PKP4-211ENST00000481115 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.01□□□□□ -1.61
PKP4-211ENST00000481115 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa5.01□□□□□ -1.61
PKP4-211ENST00000481115 ABCA2Q9BZC7 2435 aa5.01□□□□□ -1.61
PKP4-211ENST00000481115 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa5□□□□□ -1.61
PKP4-211ENST00000481115 A0A096LNT2 108 aa5□□□□□ -1.61
PKP4-211ENST00000481115 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa5□□□□□ -1.61
PKP4-211ENST00000481115 LCE6AA0A183 80 aa5□□□□□ -1.61
PKP4-211ENST00000481115 LYNX1G3V0Z9 82 aa5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 97.9 ms