RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295522.3

CLDN1-201, Transcript of claudin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN1, Length 3,481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN1-201ENST00000295522 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.2□□□□□ -1.26
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CLDN1-201ENST00000295522 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa7.2□□□□□ -1.26
CLDN1-201ENST00000295522 K7EQD1 137 aa7.2□□□□□ -1.26
CLDN1-201ENST00000295522 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
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CLDN1-201ENST00000295522 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CLDN1-201ENST00000295522 TRAV7A0A075B6U4 112 aa7.2□□□□□ -1.26
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CLDN1-201ENST00000295522 LRRK2Q5S007 2527 aa7.19□□□□□ -1.26
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CLDN1-201ENST00000295522 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.07□□□□□ -1.28
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CLDN1-201ENST00000295522 CELA1Q9UNI1 258 aa7.06□□□□□ -1.28
CLDN1-201ENST00000295522 CR1P17927 2039 aa7.06□□□□□ -1.28
CLDN1-201ENST00000295522 PSPHP1O15172 72 aa7.06□□□□□ -1.28
CLDN1-201ENST00000295522 NDUFC1O43677 76 aa7.06□□□□□ -1.28
CLDN1-201ENST00000295522 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
CLDN1-201ENST00000295522 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP7.05□□□□□ -1.28
CLDN1-201ENST00000295522 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CLDN1-201ENST00000295522 ESM1Q9NQ30 184 aa7.05□□□□□ -1.28
CLDN1-201ENST00000295522 B4DSR2 109 aa7.04□□□□□ -1.28
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