RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535535.5

LMO3-212, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-212ENST00000535535 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 C11orf72Q8NBR9 251 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 DIRC1Q969H9 104 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 C11orf1Q9H5F2 150 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 V9GYV3 84 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 ALMS1Q8TCU4 4167 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 PEX7O00628 323 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 TRBV12-3P01733 135 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 IGHV1-8P0DP01 117 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 IGKV1-13P0DP09 117 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 UBE2D1P51668 147 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 MFAP2P55001 183 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 LINC00313P59037 77 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 KRTAP10-5P60370 271 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 LINC00337Q8N6G1 96 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 C11orf52Q96A22 123 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 RNF185Q96GF1 192 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 ZNF714Q96N38 554 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 IGKV1-5P01602 117 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 KLKP1Q107X0 134 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 MINOS1Q5TGZ0 78 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 HERC2O95714 4834 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 H7BZZ5 65 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 CD24P25063 80 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 Q1T7F1 81 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 C6orf99Q4VX62 202 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 C9orf66Q5T8R8 295 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 DYNLRB2Q8TF09 96 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 ZNF414Q96IQ9 312 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 NPCDR1Q9BY65 106 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa5.53□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 XCL1P47992 114 aa5.53□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 RHOHQ15669 191 aa5.53□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 DAND5Q8N907 189 aa5.53□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 XCL2Q9UBD3 114 aa5.53□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 PCLOQ9Y6V0 5065 aa5.53□□□□□ -1.52
LMO3-212ENST00000535535 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa5.52□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 LINC01549A6NIU2 74 aa5.52□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa5.52□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 COX7A2P2O60397 106 aa5.52□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 GNB1P62873 340 aa5.52□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa5.51□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 A0A0J9YXV3 536 aa5.51□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa5.51□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 LTAP01374 205 aa5.51□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa5.51□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 INAFM2P0DMQ5 153 aa5.51□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 ESRGQ1W209 222 aa5.51□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 DEFB136Q30KP8 78 aa5.51□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 LINC01554Q52M75 96 aa5.51□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 Q6JHZ5 121 aa5.51□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 C2orf82Q6UX34 121 aa5.51□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 TNCP24821 2201 aa5.51□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa5.51□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 C12orf77C9JDV5 145 aa5.51□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 EDDM3BP56851 147 aa5.51□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa5.51□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 GPHB5Q86YW7 130 aa5.51□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa5.51□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 DPM3Q9P2X0 92 aa5.51□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 IGLV1-47P01700 117 aa5.5□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 LINC01590Q5TEZ4 76 aa5.5□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 ZNF497Q6ZNH5 498 aa5.5□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 LINC00173Q6ZV60 143 aa5.5□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 PRNTQ86SH4 94 aa5.5□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 LINC00474Q9P2X8 69 aa5.5□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 RYR1P21817 5038 aa5.49□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 IGLV2-11P01706 119 aa5.49□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 PRM2P04554 102 aa5.49□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 NPPCP23582 126 aa5.49□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 LYPD5Q6UWN5 251 aa5.49□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 C5orf56Q8N8D9 126 aa5.49□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 TIMM21Q9BVV7 248 aa5.49□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa5.49□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 PLGLAQ15195 96 aa5.48□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 KISS1Q15726 138 aa5.48□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 KMT2AQ03164 3969 aa5.48□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 TRAV7A0A075B6U4 112 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 IGLV3-1P01715 115 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 FCER1GP30273 86 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 FAM223AQ8IWN6 122 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 C4orf3Q8WVX3 66 aa5.47□□□□□ -1.53
LMO3-212ENST00000535535 PRO1854Q9UHT4 67 aa5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66 ms