RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327307.11

RRN3-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3, Length 2,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-202ENST00000327307 Q6ZR03 302 aa4.63□□□□□ -1.67
RRN3-202ENST00000327307 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
RRN3-202ENST00000327307 C14orf132Q9NPU4 83 aa4.63□□□□□ -1.67
RRN3-202ENST00000327307 ICOSQ9Y6W8 199 aa4.63□□□□□ -1.67
RRN3-202ENST00000327307 NOTCH2Q04721 2471 aa4.63□□□□□ -1.67
RRN3-202ENST00000327307 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa4.63□□□□□ -1.67
RRN3-202ENST00000327307 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa4.63□□□□□ -1.67
RRN3-202ENST00000327307 C17orf98A8MV24 154 aa4.63□□□□□ -1.67
RRN3-202ENST00000327307 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RRN3-202ENST00000327307 IGKV3-11P04433 115 aa4.63□□□□□ -1.67
RRN3-202ENST00000327307 CFC1P0CG37 223 aa4.63□□□□□ -1.67
RRN3-202ENST00000327307 PROK1P58294 105 aa4.63□□□□□ -1.67
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RRN3-202ENST00000327307 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa4.62□□□□□ -1.67
RRN3-202ENST00000327307 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa4.62□□□□□ -1.67
RRN3-202ENST00000327307 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa4.62□□□□□ -1.67
RRN3-202ENST00000327307 D6R8Y8 96 aa4.62□□□□□ -1.67
RRN3-202ENST00000327307 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa4.62□□□□□ -1.67
RRN3-202ENST00000327307 MUSTN1Q8IVN3 82 aa4.62□□□□□ -1.67
RRN3-202ENST00000327307 UNC79Q9P2D8 2635 aa4.62□□□□□ -1.67
RRN3-202ENST00000327307 NBASA2RRP1 2371 aa4.62□□□□□ -1.67
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RRN3-202ENST00000327307 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
RRN3-202ENST00000327307 MYO9AB2RTY4 2548 aa4.62□□□□□ -1.67
RRN3-202ENST00000327307 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
RRN3-202ENST00000327307 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa4.62□□□□□ -1.67
RRN3-202ENST00000327307 H7C2G1 150 aa4.62□□□□□ -1.67
RRN3-202ENST00000327307 FSHBP01225 129 aa4.62□□□□□ -1.67
RRN3-202ENST00000327307 BAALC-AS2P0C853 105 aa4.62□□□□□ -1.67
RRN3-202ENST00000327307 DNAH10OSP0CZ25 163 aa4.62□□□□□ -1.67
RRN3-202ENST00000327307 HMGA2P52926 109 aa4.62□□□□□ -1.67
RRN3-202ENST00000327307 C15orf56Q8N910 161 aa4.62□□□□□ -1.67
RRN3-202ENST00000327307 ZNF525Q8N782 197 aa4.61□□□□□ -1.67
RRN3-202ENST00000327307 IMMP1LQ96LU5 166 aa4.61□□□□□ -1.67
RRN3-202ENST00000327307 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa4.61□□□□□ -1.67
RRN3-202ENST00000327307 UNC13CQ8NB66 2214 aa4.61□□□□□ -1.67
RRN3-202ENST00000327307 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa4.6□□□□□ -1.67
RRN3-202ENST00000327307 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa4.6□□□□□ -1.67
RRN3-202ENST00000327307 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa4.6□□□□□ -1.67
RRN3-202ENST00000327307 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa4.6□□□□□ -1.67
RRN3-202ENST00000327307 INSP01308 110 aa4.6□□□□□ -1.67
RRN3-202ENST00000327307 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
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RRN3-202ENST00000327307 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa4.6□□□□□ -1.67
RRN3-202ENST00000327307 LINC01560Q8TB33 94 aa4.6□□□□□ -1.67
RRN3-202ENST00000327307 A0A087WSZ3 146 aa4.59□□□□□ -1.67
RRN3-202ENST00000327307 IGLV2-14P01704 120 aa4.59□□□□□ -1.67
RRN3-202ENST00000327307 PATE1Q8WXA2 126 aa4.59□□□□□ -1.67
RRN3-202ENST00000327307 C22orf24Q9Y442 160 aa4.59□□□□□ -1.67
RRN3-202ENST00000327307 FAM215AQ9Y5M1 114 aa4.59□□□□□ -1.67
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RRN3-202ENST00000327307 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
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RRN3-202ENST00000327307 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa4.58□□□□□ -1.68
RRN3-202ENST00000327307 C11orf86A6NJI1 115 aa4.58□□□□□ -1.68
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RRN3-202ENST00000327307 TMEM254Q8TBM7 123 aa4.58□□□□□ -1.68
RRN3-202ENST00000327307 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa4.58□□□□□ -1.68
RRN3-202ENST00000327307 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
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RRN3-202ENST00000327307 ITPR2Q14571 2701 aa4.58□□□□□ -1.68
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RRN3-202ENST00000327307 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa4.58□□□□□ -1.68
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RRN3-202ENST00000327307 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa4.55□□□□□ -1.68
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RRN3-202ENST00000327307 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa4.55□□□□□ -1.68
RRN3-202ENST00000327307 Q8TAT8 98 aa4.55□□□□□ -1.68
RRN3-202ENST00000327307 ABCA12Q86UK0 2595 aa4.55□□□□□ -1.68
RRN3-202ENST00000327307 J3QRE1 110 aa4.54□□□□□ -1.68
RRN3-202ENST00000327307 SPINK4O60575 86 aa4.54□□□□□ -1.68
RRN3-202ENST00000327307 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RRN3-202ENST00000327307 CSAG1Q6PB30 78 aa4.54□□□□□ -1.68
RRN3-202ENST00000327307 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RRN3-202ENST00000327307 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RRN3-202ENST00000327307 TRAV10A0A0B4J240 114 aa4.53□□□□□ -1.68
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