RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628545.1

GLIS1-202, Transcript of GLIS family zinc finger 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene GLIS1, Length 2,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1-202ENST00000628545 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
GLIS1-202ENST00000628545 XCL2Q9UBD3 114 aa12.82□□□□□ -0.36
GLIS1-202ENST00000628545 KLK9Q9UKQ9 250 aa12.82□□□□□ -0.36
GLIS1-202ENST00000628545 C14orf132Q9NPU4 83 aa12.82□□□□□ -0.36
GLIS1-202ENST00000628545 SVEP1Q4LDE5 3571 aa12.82□□□□□ -0.36
GLIS1-202ENST00000628545 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
GLIS1-202ENST00000628545 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
GLIS1-202ENST00000628545 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
GLIS1-202ENST00000628545 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
GLIS1-202ENST00000628545 RBMY1CP0DJD4 496 aa12.81□□□□□ -0.36
GLIS1-202ENST00000628545 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
GLIS1-202ENST00000628545 HILS1P60008 231 aa12.81□□□□□ -0.36
GLIS1-202ENST00000628545 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
GLIS1-202ENST00000628545 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa12.81□□□□□ -0.36
GLIS1-202ENST00000628545 H7BZZ5 65 aa12.81□□□□□ -0.36
GLIS1-202ENST00000628545 MINOS1Q5TGZ0 78 aa12.81□□□□□ -0.36
GLIS1-202ENST00000628545 BRK1Q8WUW1 75 aa12.81□□□□□ -0.36
GLIS1-202ENST00000628545 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa12.8□□□□□ -0.36
GLIS1-202ENST00000628545 ITPR1Q14643 2758 aa12.8□□□□□ -0.36
GLIS1-202ENST00000628545 RPL28P46779 137 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
GLIS1-202ENST00000628545 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa12.8□□□□□ -0.36
GLIS1-202ENST00000628545 Q9H8V8 135 aa12.79□□□□□ -0.36
GLIS1-202ENST00000628545 TRBV12-3P01733 135 aa12.79□□□□□ -0.36
GLIS1-202ENST00000628545 LYPD5Q6UWN5 251 aa12.78□□□□□ -0.36
GLIS1-202ENST00000628545 LY6HO94772 140 aa12.77□□□□□ -0.36
GLIS1-202ENST00000628545 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa12.77□□□□□ -0.37
GLIS1-202ENST00000628545 KNCNA6PVL3 124 aa12.77□□□□□ -0.37
GLIS1-202ENST00000628545 DCHS2Q6V1P9 2916 aa12.76□□□□□ -0.37
GLIS1-202ENST00000628545 ATRXP46100 2492 aa12.76□□□□□ -0.37
GLIS1-202ENST00000628545 Q8NA96 180 aa12.75□□□□□ -0.37
GLIS1-202ENST00000628545 SPTA1P02549 2419 aa12.75□□□□□ -0.37
GLIS1-202ENST00000628545 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa12.75□□□□□ -0.37
GLIS1-202ENST00000628545 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
GLIS1-202ENST00000628545 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
GLIS1-202ENST00000628545 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
GLIS1-202ENST00000628545 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa12.74□□□□□ -0.37
GLIS1-202ENST00000628545 LINC00482Q8N8I6 264 aa12.74□□□□□ -0.37
GLIS1-202ENST00000628545 COPS9Q8WXC6 57 aa12.74□□□□□ -0.37
GLIS1-202ENST00000628545 LINC00474Q9P2X8 69 aa12.74□□□□□ -0.37
GLIS1-202ENST00000628545 RELNP78509 3460 aa12.74□□□□□ -0.37
GLIS1-202ENST00000628545 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa12.73□□□□□ -0.37
GLIS1-202ENST00000628545 WFDC9Q8NEX5 89 aa12.73□□□□□ -0.37
GLIS1-202ENST00000628545 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa12.72□□□□□ -0.37
GLIS1-202ENST00000628545 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa12.72□□□□□ -0.37
GLIS1-202ENST00000628545 PKD1L2Q7Z442 2459 aa12.72□□□□□ -0.37
GLIS1-202ENST00000628545 LRBAP50851 2863 aa12.72□□□□□ -0.37
GLIS1-202ENST00000628545 NDUFA4O00483 81 aa12.71□□□□□ -0.37
GLIS1-202ENST00000628545 IGKV3-20P01619 116 aa12.71□□□□□ -0.37
GLIS1-202ENST00000628545 PROK1P58294 105 aa12.71□□□□□ -0.37
GLIS1-202ENST00000628545 CHCHD7Q9BUK0 85 aa12.71□□□□□ -0.37
GLIS1-202ENST00000628545 A0A087WYN8 130 aa12.7□□□□□ -0.38
GLIS1-202ENST00000628545 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa12.7□□□□□ -0.38
GLIS1-202ENST00000628545 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa12.7□□□□□ -0.38
GLIS1-202ENST00000628545 COX6A2Q02221 97 aa12.7□□□□□ -0.38
GLIS1-202ENST00000628545 ACACBO00763 2458 aa12.69□□□□□ -0.38
GLIS1-202ENST00000628545 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa12.69□□□□□ -0.38
GLIS1-202ENST00000628545 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa12.69□□□□□ -0.38
GLIS1-202ENST00000628545 IL17DQ8TAD2 202 aa12.69□□□□□ -0.38
GLIS1-202ENST00000628545 LINC00467Q9BRT7 94 aa12.69□□□□□ -0.38
GLIS1-202ENST00000628545 Q9UF83 564 aa12.68□□□□□ -0.38
GLIS1-202ENST00000628545 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa12.68□□□□□ -0.38
GLIS1-202ENST00000628545 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
GLIS1-202ENST00000628545 NCR3O14931 201 aa12.68□□□□□ -0.38
GLIS1-202ENST00000628545 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa12.67□□□□□ -0.38
GLIS1-202ENST00000628545 IGHV3-11P01762 117 aa12.66□□□□□ -0.38
GLIS1-202ENST00000628545 CCKP06307 115 aa12.66□□□□□ -0.38
GLIS1-202ENST00000628545 OVOL2Q9BRP0 275 aa12.66□□□□□ -0.38
GLIS1-202ENST00000628545 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa12.66□□□□□ -0.38
GLIS1-202ENST00000628545 CRPP02741 224 aa12.66□□□□□ -0.38
GLIS1-202ENST00000628545 KLKP1Q107X0 134 aa12.66□□□□□ -0.38
GLIS1-202ENST00000628545 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa12.65□□□□□ -0.38
GLIS1-202ENST00000628545 SS18Q15532 418 aa12.65□□□□□ -0.38
GLIS1-202ENST00000628545 ENHOQ6UWT2 76 aa12.65□□□□□ -0.38
GLIS1-202ENST00000628545 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
GLIS1-202ENST00000628545 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa12.64□□□□□ -0.39
GLIS1-202ENST00000628545 LINC00337Q8N6G1 96 aa12.64□□□□□ -0.39
GLIS1-202ENST00000628545 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa12.63□□□□□ -0.39
GLIS1-202ENST00000628545 SPINK13Q1W4C9 94 aa12.63□□□□□ -0.39
GLIS1-202ENST00000628545 C5orf56Q8N8D9 126 aa12.63□□□□□ -0.39
GLIS1-202ENST00000628545 TRAV7A0A075B6U4 112 aa12.62□□□□□ -0.39
GLIS1-202ENST00000628545 SMIM1B2RUZ4 78 aa12.62□□□□□ -0.39
GLIS1-202ENST00000628545 PF4P02776 101 aa12.62□□□□□ -0.39
GLIS1-202ENST00000628545 RBM3P98179 157 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
GLIS1-202ENST00000628545 F8WEM9 126 aa12.61□□□□□ -0.39
GLIS1-202ENST00000628545 CCL21O00585 134 aa12.61□□□□□ -0.39
GLIS1-202ENST00000628545 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
GLIS1-202ENST00000628545 S100A7L2Q5SY68 101 aa12.61□□□□□ -0.39
GLIS1-202ENST00000628545 SNURFQ9Y675 71 aa12.61□□□□□ -0.39
GLIS1-202ENST00000628545 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
GLIS1-202ENST00000628545 NBASA2RRP1 2371 aa12.61□□□□□ -0.39
GLIS1-202ENST00000628545 LECT2O14960 151 aa12.61□□□□□ -0.39
GLIS1-202ENST00000628545 SAA4P35542 130 aa12.61□□□□□ -0.39
GLIS1-202ENST00000628545 LINC00242Q5T6M2 205 aa12.61□□□□□ -0.39
GLIS1-202ENST00000628545 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa12.61□□□□□ -0.39
GLIS1-202ENST00000628545 SMIM11BQ8TCY0 68 aa12.61□□□□□ -0.39
GLIS1-202ENST00000628545 RMI2Q96E14 147 aa12.61□□□□□ -0.39
GLIS1-202ENST00000628545 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa12.61□□□□□ -0.39
GLIS1-202ENST00000628545 USP24Q9UPU5 2620 aa12.6□□□□□ -0.39
GLIS1-202ENST00000628545 SIRPDQ9H106 197 aa12.6□□□□□ -0.39
GLIS1-202ENST00000628545 HTN1P15515 57 aa12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms