RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 LMO7DNF2Z398 122 aa2.37□□□□□ -2.03
PTPRC-202ENST00000367364 H3BTX0 84 aa2.37□□□□□ -2.03
PTPRC-202ENST00000367364 K7EIM0 57 aa2.37□□□□□ -2.03
PTPRC-202ENST00000367364 ERC2-IT1O76042 136 aa2.37□□□□□ -2.03
PTPRC-202ENST00000367364 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
PTPRC-202ENST00000367364 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
PTPRC-202ENST00000367364 C10orf55Q5SWW7 151 aa2.37□□□□□ -2.03
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF826PQ6ZT77 177 aa2.37□□□□□ -2.03
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM243Q9BU79 118 aa2.37□□□□□ -2.03
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PTPRC-202ENST00000367364 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-202ENST00000367364 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-202ENST00000367364 BAALC-AS2P0C853 105 aa2.36□□□□□ -2.03
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PTPRC-202ENST00000367364 VMO1Q7Z5L0 202 aa2.36□□□□□ -2.03
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PTPRC-202ENST00000367364 CTSGP08311 255 aa2.35□□□□□ -2.03
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PTPRC-202ENST00000367364 DLX1P56177 255 aa2.35□□□□□ -2.03
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PTPRC-202ENST00000367364 S100A7L2Q5SY68 101 aa2.35□□□□□ -2.03
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PTPRC-202ENST00000367364 H7C2G1 150 aa2.34□□□□□ -2.03
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PTPRC-202ENST00000367364 Q1T7F1 81 aa2.34□□□□□ -2.03
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PTPRC-202ENST00000367364 C20orf197Q8N268 126 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRC-202ENST00000367364 Q8TAT8 98 aa2.34□□□□□ -2.03
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PTPRC-202ENST00000367364 WNK2Q9Y3S1 2297 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa2.33□□□□□ -2.04
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PTPRC-202ENST00000367364 IGHV3-9P01782 118 aa2.33□□□□□ -2.04
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PTPRC-202ENST00000367364 C20orf203Q8NBC4 194 aa2.33□□□□□ -2.04
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PTPRC-202ENST00000367364 LEAP2Q969E1 77 aa2.33□□□□□ -2.04
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PTPRC-202ENST00000367364 SPRR3Q9UBC9 169 aa2.33□□□□□ -2.04
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PTPRC-202ENST00000367364 PINLYPA6NC86 204 aa2.32□□□□□ -2.04
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PTPRC-202ENST00000367364 F8WEM9 126 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 BLCAPP62952 87 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 ESRGQ1W209 222 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 FAM229BQ4G0N7 80 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 PRR9Q5T870 116 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 STHQ8IWL8 128 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 C6orf223Q8N319 242 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 ZNRF1Q8ND25 227 aa2.32□□□□□ -2.04
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