RNA–Protein interactions for RNA: tT(AGU)C

tT(AGU)C, Transcript of Threonine tRNA (tRNA-Thr), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tT(AGU)C, Length 73 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tT(AGU)CtT(AGU)C DIG1Q03063 452 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C GCN5Q03330 439 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C CWC21Q03375 135 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C RPN4Q03465 531 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C NSE5Q03718 556 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C ENT5Q03769 411 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YDR132CQ03900 495 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SND1Q04007 877 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SEG1Q04279 960 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C VMS1Q04311 632 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YMR018WQ04364 514 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YML082WQ04533 649 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C TDA9Q04545 1251 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C PRM6Q04705 352 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SOV1Q04748 898 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SVF1Q05515 481 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C HEL2Q05580 639 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YLR287CQ05881 355 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C VPS38Q05919 439 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YLR257WQ06146 321 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YPR078CQ06813 372 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C TSR1Q07381 788 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C TPO1Q07824 586 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C TLG2Q08144 397 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C MDM38Q08179 573 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C IMA2Q08295 589 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SLD7Q08457 257 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C DDC1Q08949 612 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C APL5Q08951 932 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C APL4Q12028 832 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C TAF10Q12030 206 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C FAP7Q12055 197 aaPredicted RBP0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C ATG9Q12142 997 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YDR018CQ12185 396 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YLR046CQ12253 270 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SVS1Q12254 260 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C EMP46Q12396 444 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C ARP7Q12406 477 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C OCA6Q12454 224 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C PEX11Q12462 236 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C RMP1Q12530 201 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YBL111CQ3E7Y5 667 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YLR149CQ99296 730 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C IZH4Q99393 312 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C RIF1P29539 1916 aa0.73□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C TOR2P32600 2474 aaKnown RBP0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C MOT1P32333 1867 aa0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C ECM29P38737 1868 aa0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C CET1O13297 549 aaPredicted RBP0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C COX5AP00424 153 aa0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C HIS1P00498 297 aaKnown RBP0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C CAN1P04817 590 aa0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C GCR1P07261 785 aa0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C RIP1P08067 215 aa0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SWI5P08153 709 aa0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C MSF1P08425 469 aa0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C PET111P08468 800 aa0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C ERR1P0CX10 437 aa0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C ERR2P0CX11 437 aa0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C PYC1P11154 1178 aaKnown RBP0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C GLN4P13188 809 aaKnown RBP0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SEC63P14906 663 aa0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C CLC1P17891 233 aa0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C ARF2P19146 181 aaKnown RBP0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C CLN1P20437 546 aa0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SLY1P22213 666 aa0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C PDE1P22434 369 aa0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C CHL1P22516 861 aaPredicted RBP0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C MIH1P23748 554 aa0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C MNE1P24720 663 aa0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SIS1P25294 352 aaKnown RBP0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C MSH3P25336 1018 aa0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C PUF4P25339 888 aaKnown RBP RIP-Chip data0.72□□□□□ -2.29not detected
tT(AGU)CtT(AGU)C LRE1P25579 583 aaKnown RBP0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C CDC20P26309 610 aa0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C RFA2P26754 273 aaKnown RBP0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C CIN8P27895 1000 aa0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C BRF1P29056 596 aa0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C MEI4P29467 408 aa0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C PAP1P29468 568 aaKnown RBP0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SEC1P30619 724 aaKnown RBP0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C GUT2P32191 649 aa0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C DBF4P32325 704 aa0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C HXT3P32466 567 aaKnown RBP0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C AEP1P32493 518 aa0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C CBF2P32504 956 aa0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C YEL043WP32618 956 aa0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C UTR2P32623 467 aa0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C TFB1P32776 642 aa0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C RRN6P32786 894 aa0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SLX5P32828 619 aaKnown RBP0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C RAD5P32849 1169 aaPredicted RBP0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C LIP5P32875 414 aa0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SMC1P32908 1225 aa0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SGE1P33335 543 aa0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C STE13P33894 931 aa0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C TFC3P34111 1160 aa0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C COY1P34237 679 aa0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SEG2P34250 1132 aa0.72□□□□□ -2.29
tT(AGU)CtT(AGU)C SCD5P34758 872 aa0.72□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 36.5 ms