RNA–Protein interactions for RNA: YOR057W

SGT1, Transcript of Cochaperone protein, yeast

Gene SGT1, Length 1,188 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SGT1	YOR057W	MRPL7	P36519	292 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	YHR033W	P38690	423 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	PRM2	P40534	656 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	TAX4	P47030	604 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	YGR237C	P50089	785 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	CPR8	P53728	308 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	RIM13	Q03792	727 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	SEG1	Q04279	960 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	HLR1	Q04429	423 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	CAT8	P39113	1433 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	CDC26	P14724	124 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.2	□□□□□ -1.74	not detected
SGT1	YOR057W	RIM4	P38741	713 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	PIH1	P38768	344 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	YIP4	P53093	235 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	MFM1	Q02783	413 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	AAD3	P25612	363 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	MTC7	P32633	139 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	DOT5	P40553	215 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	EAF6	P47128	113 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	ZPS1	Q12512	249 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	RSF2	P46974	1380 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	NUP1	P20676	1076 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	CNE1	P27825	502 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	DGR2	P32330	852 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	EHT1	P38295	451 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	YEL025C	P39991	1188 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	YCG1	Q06680	1035 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	AIM41	Q12032	185 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	ARR3	Q06598	404 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	SRB8	P25648	1427 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	HMG2	P12684	1045 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	DAL3	P32459	195 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	HOT13	P36078	116 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	YDL183C	P48569	320 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	BUD17	P53727	317 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	YNL018C	P53976	612 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	YDL073W	Q07454	984 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SGT1	YOR057W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.16	□□□□□ -1.74	not detected
SGT1	YOR057W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	PMA2	P19657	947 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	ATP12	P22135	325 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	APN1	P22936	367 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	PTP1	P25044	335 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	HXT4	P32467	576 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	LRO1	P40345	661 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	XBP1	P40489	647 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	PIP2	P52960	996 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	ICT1	Q12385	394 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	TEL1	P38110	2787 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	WHI2	P12611	486 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	HOP1	P20050	605 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	GLO1	P50107	326 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	COQ6	P53318	479 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	MBR1	P23493	339 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	LTP1	P40347	161 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	ATG36	P46983	293 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	NET1	P47035	1189 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	YAP7	Q08182	245 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	TGS1	Q12052	315 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	TAO3	P40468	2376 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	RRP5	Q05022	1729 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	TMT1	P32643	299 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	YJL193W	P39542	402 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	SKY1	Q03656	742 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	YPR027C	Q12079	277 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	RMP1	Q12530	201 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	VPS33	P20795	691 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	LOT5	P34234	306 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	CCL1	P37366	393 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SGT1	YOR057W	YPT10	P38146	199 aa		4.11	□□□□□ -1.75

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