RNA–Protein interactions for RNA: YMR278W

PRM15, Transcript of Phosphoribomutase, yeast

Gene PRM15, Length 1,869 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRM15	YMR278W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	CIR2	Q08822	631 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	YDL176W	Q12027	708 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	NMD4	Q12129	218 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	ATG11	Q12527	1178 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		3.9	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	COQ4	O13525	335 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	URA3	P03962	267 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	FBP1	P09201	348 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	CWH43	P25618	953 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	GPI10	P30777	616 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	PUP2	P32379	260 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	YIR007W	P40566	764 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	LYS5	P50113	272 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	SGF73	P53165	657 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	PEX25	Q02969	394 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	TLG1	Q03322	224 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	TPP1	Q03796	238 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	CTI6	Q08923	506 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	REX3	Q12090	404 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	HUA2	Q12134	243 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	COX17	Q12287	69 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	GRX6	Q12438	231 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	STF1	P01098	86 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	CMP2	P14747	604 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	MRP20	P32387	263 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	MTC7	P32633	139 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	MAC1	P35192	417 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	LRG1	P35688	1017 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	APN2	P38207	520 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	GID8	P40208	455 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	PUS2	P53167	370 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	CUZ1	P53899	274 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.88	□□□□□ -1.79	not detected
PRM15	YMR278W	NBP2	Q12163	236 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	NFI1	Q12216	726 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	GPR1	Q12361	961 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	NUP170	P38181	1502 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	TPK1	P06244	397 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	REC107	P21651	314 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	GPT2	P36148	743 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	FLC2	P39719	783 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	CIT3	P43635	486 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	MDE1	P47095	244 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	DSD1	P53095	428 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	TGL5	Q12043	749 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	HOS1	Q12214	470 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	CAT8	P39113	1433 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	PCK1	P10963	549 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	APE1	P14904	514 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	ARG1	P22768	420 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	YCK1	P23291	538 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	OCA4	P25366	362 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	YPT7	P32939	208 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	GCS1	P35197	352 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	CAB2	P40506	365 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	LCB2	P40970	561 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	SSY5	P47002	699 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	TAF4	P50105	388 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	TEL2	P53038	688 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	YNR061C	P53747	219 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	SEC5	P89102	971 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	OAZ1	Q02803	292 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	NGL3	Q03210	505 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	RCO1	Q04779	684 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	ARP9	Q05123	467 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	ENT4	Q07872	247 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	SVS1	Q12254	260 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	SKS1	Q12505	502 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	YOR111W	Q99210	232 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	IQG1	Q12280	1495 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	SAM35	P14693	329 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PRM15	YMR278W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.86	□□□□□ -1.79	not detected

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