RNA–Protein interactions for RNA: YLR407W

YLR407W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YLR407W, Length 687 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR407W	YLR407W	VID27	P40157	782 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	EPL1	P43572	832 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	TIM54	P47045	478 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	YJR142W	P47173	342 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	FHN1	P53279	174 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	ATP25	Q03153	612 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	SEG1	Q04279	960 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	RIT1	P23796	513 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	TIM23	P32897	222 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
YLR407W	YLR407W	LYS9	P38999	446 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	NUP60	P39705	539 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	MRK1	P50873	501 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	YGR125W	P53273	1036 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	ATG4	P53867	494 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	PRE8	P23639	250 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	PHO11	P35842	467 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	PHO12	P38693	467 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	PES4	P39684	611 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	VPS8	P39702	1274 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	CSM2	P40465	213 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	HXT16	P47185	567 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	SKG3	Q06315	1026 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	OSW1	Q08692	278 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	DCS2	Q12123	353 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	YOR111W	Q99210	232 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YLR407W	YLR407W	PHO8	P11491	566 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	SWE1	P32944	819 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	APT2	P36973	181 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	RKM3	P38222	552 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	RXT2	P38255	430 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	YHR112C	P38716	378 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	MUP3	P38734	546 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	PCI8	P40512	444 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	RSC1	P53236	928 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	YGR117C	P53270	476 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	CEX1	Q12453	761 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.82	□□□□□ -1.64	not detected
YLR407W	YLR407W	DID4	P36108	232 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	NPR3	P38742	1146 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	YGL138C	P53122	345 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	FOL1	P53848	824 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	DSE3	Q08729	430 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	YLR125W	Q12138	136 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	TUS1	Q06412	1307 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	NUC1	P08466	329 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	GPA1	P08539	472 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	PER1	P25625	357 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	CHS3	P29465	1165 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	STV1	P37296	890 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	YBL028C	P38202	106 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	CST26	P38226	397 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	GAT1	P43574	510 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	ALY2	P47029	1046 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	YPT11	P48559	417 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	VPS4	P52917	437 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	MDM1	Q01846	1127 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	TIM50	Q02776	476 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	MCM21	Q06675	368 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	BET3	P36149	193 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	YER130C	P39959	443 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	ORC4	P54791	529 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	YDR338C	Q05497	695 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	FLC1	Q08967	793 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	MLH3	Q12083	715 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	USV1	Q12132	391 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	TIP41	Q12199	356 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YLR407W	YLR407W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		4.8	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 98.4 ms