RNA–Protein interactions for RNA: YKR078W

YKR078W, Transcript of Cytoplasmic protein of unknown function, yeastyeast

Gene YKR078W, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR078WYKR078W SRP68P38687 599 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
YKR078WYKR078W YEL076CP39971 216 aa3.28□□□□□ -1.88
YKR078WYKR078W DUG1P43616 481 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
YKR078WYKR078W HRD3Q05787 833 aa3.28□□□□□ -1.88
YKR078WYKR078W YPR027CQ12079 277 aa3.28□□□□□ -1.88
YKR078WYKR078W SPP41P38904 1435 aa3.28□□□□□ -1.88
YKR078WYKR078W URE2P23202 354 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W SCS3P53012 380 aa3.28□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W IDP3P53982 420 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W SPN1Q06505 410 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W YOR378WQ08902 515 aa3.28□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W BET2P20133 325 aa3.27□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W CWH43P25618 953 aa3.27□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W YUR1P26725 428 aa3.27□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W CDC5P32562 705 aa3.27□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W YNL092WP53934 400 aa3.27□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W RMP1Q12530 201 aa3.27□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W STH1P32597 1359 aa3.26□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W SEC12P11655 471 aa3.26□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W TSR4P25040 408 aa3.26□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W EUG1P32474 517 aa3.26□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W PEA2P40091 420 aa3.26□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W AHA1Q12449 350 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W VPS5Q92331 675 aa3.26□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W DNA2P38859 1522 aa3.26□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W CRC1Q12289 327 aa3.25□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W XRN1P22147 1528 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W YMR085WP0CF18 432 aa3.25□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W MNT3P40549 630 aa3.25□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W NIT2P47016 307 aa3.25□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W IRC8P47046 822 aa3.25□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W MNT2P53059 558 aa3.25□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W MDR1P53258 950 aa3.25□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W RAD33Q04231 177 aa3.25□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W TDA9Q04545 1251 aa3.25□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W TPO3Q06451 622 aa3.25□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W CWC2Q12046 339 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W ARG1P22768 420 aa3.24□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W EAF5P39995 279 aa3.24□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W JHD1P40034 492 aa3.24□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W YIL092WP40497 633 aa3.24□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W TCB2P48231 1178 aa3.24□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W MTD1Q02046 320 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W CYK3Q07533 885 aa3.24□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W CRT10Q08226 957 aa3.24□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W SPT7P35177 1332 aa3.23□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W YAP1P19880 650 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W SDH8P38345 138 aa3.23□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W UBP12P39538 1254 aa3.23□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W PCI8P40512 444 aa3.23□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W COS12P53053 380 aa3.23□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W RTK1Q12100 620 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W URA3P03962 267 aa3.23□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W CBP3P21560 335 aa3.23□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W GDA1P32621 518 aa3.23□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W ASK1P35734 292 aa3.23□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W SPC105P53148 917 aa3.23□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W SCW4P53334 386 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W YPL071CQ02864 156 aa3.23□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W DIN7Q12086 430 aa3.23□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W BI2P03873 423 aa3.22□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W CLC1P17891 233 aa3.22□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W COX11P19516 300 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W SPC97P38863 823 aa3.22□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W MAD2P40958 196 aa3.22□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W IRC7P43623 340 aa3.22□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W STB2P46679 850 aa3.22□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W PNO1Q99216 274 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W Q0010Q9ZZX9 128 aa3.22□□□□□ -1.89
YKR078WYKR078W TRM732Q03496 1420 aa3.21□□□□□ -1.9
YKR078WYKR078W YPR089WO13585 888 aa3.21□□□□□ -1.9
YKR078WYKR078W YER190C-BP0CX94 160 aa3.21□□□□□ -1.9
YKR078WYKR078W YEL077W-AP0CX95 160 aa3.21□□□□□ -1.9
YKR078WYKR078W YGR296C-BP0CX96 160 aa3.21□□□□□ -1.9
YKR078WYKR078W YPL283W-BP0CX97 160 aa3.21□□□□□ -1.9
YKR078WYKR078W YPR204C-AP0CX98 160 aa3.21□□□□□ -1.9
YKR078WYKR078W MAK32P23060 363 aa3.21□□□□□ -1.9
YKR078WYKR078W HEM12P32347 362 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
YKR078WYKR078W IMD2P38697 523 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
YKR078WYKR078W STB5P38699 743 aa3.21□□□□□ -1.9
YKR078WYKR078W YIL024CP40543 189 aa3.21□□□□□ -1.9
YKR078WYKR078W MEP2P41948 499 aa3.21□□□□□ -1.9
YKR078WYKR078W IMD3P50095 523 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
YKR078WYKR078W SLD3P53135 668 aa3.21□□□□□ -1.9
YKR078WYKR078W ECM5Q03214 1411 aa3.21□□□□□ -1.9
YKR078WYKR078W AMD2P22580 549 aa3.2□□□□□ -1.9
YKR078WYKR078W PRS1P32895 427 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
YKR078WYKR078W COP1P53622 1201 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
YKR078WYKR078W YNR071CP53757 342 aa3.2□□□□□ -1.9
YKR078WYKR078W YML119WQ03208 357 aa3.2□□□□□ -1.9
YKR078WYKR078W ECM38Q05902 660 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
YKR078WYKR078W HOS1Q12214 470 aa3.2□□□□□ -1.9
YKR078WYKR078W CET1O13297 549 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
YKR078WYKR078W QCR6P00127 147 aa3.2□□□□□ -1.9
YKR078WYKR078W CHO2P05374 869 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
YKR078WYKR078W RRP43P25359 394 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
YKR078WYKR078W PET309P32522 965 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
YKR078WYKR078W PXL1P36166 706 aa3.2□□□□□ -1.9
YKR078WYKR078W MTG2P38860 518 aa3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 26.6 ms