RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C MDG1P53885 366 aa2.73□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C SNP1Q00916 300 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C BUD7Q08754 746 aa2.73□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C RVB2Q12464 471 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C YPR089WO13585 888 aa2.72□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C YPT7P32939 208 aa2.72□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C APN2P38207 520 aa2.72□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C SDS24P38314 527 aa2.72□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C YIL077CP40508 320 aa2.72□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C BUD27P43573 796 aaKnown RBP RIP-Chip data2.72□□□□□ -1.97not detected
GCN4YEL009C SET2P46995 733 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C DAK1P54838 584 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C YFT2Q06676 274 aa2.72□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C IZH3Q07959 543 aa2.72□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C YOL057WQ08225 711 aa2.72□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C SSP2Q08646 371 aa2.72□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C NYV1Q12255 253 aa2.72□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C POM34Q12445 299 aa2.72□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C MEF1P25039 761 aa2.71□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C MGM1P32266 881 aa2.71□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C SER1P33330 395 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C DUN1P39009 513 aa2.71□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C YFR016CP43597 1233 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C YRB30P53107 440 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C YGL082WP53155 381 aa2.71□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C BRE5P53741 515 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C ZDS2P54786 942 aa2.71□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C VPS64Q03944 604 aa2.71□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C NHX1Q04121 633 aa2.71□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C YTH1Q06102 208 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C MDM12Q92328 271 aa2.71□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C SWI1P09547 1314 aa2.7□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C MRP7P12687 371 aa2.7□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C MNN4P36044 1178 aa2.7□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C COS111P38308 924 aa2.7□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C DSS1P39112 969 aa2.7□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C FUN12P39730 1002 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C YIL092WP40497 633 aa2.7□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C IDP3P53982 420 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C DNM1P54861 757 aa2.7□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C RSC9Q03124 581 aa2.7□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C RIX7Q07844 837 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C CTI6Q08923 506 aa2.7□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C PRS5Q12265 496 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C RPL7AP05737 244 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C PHO2P07269 559 aa2.69□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C LPD1P09624 499 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C DAL5P15365 543 aa2.69□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C STI1P15705 589 aaKnown RBP RIP-Chip data2.69□□□□□ -1.98not detected
GCN4YEL009C HOG1P32485 435 aa2.69□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C RAD24P32641 659 aa2.69□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C TIM23P32897 222 aa2.69□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C NUP133P36161 1157 aa2.69□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C YJR008WP47085 338 aa2.69□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C CSI1Q04368 295 aa2.69□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C SRL1Q08673 210 aa2.69□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C RPL7BQ12213 244 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C SSK22P25390 1331 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C SRD1P09007 221 aa2.68□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C HEM1P09950 548 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C URE2P23202 354 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C SWC3P31376 625 aa2.68□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C RPC34P32910 317 aa2.68□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C ELF1P36053 145 aa2.68□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C EAF6P47128 113 aa2.68□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C AIM14P53109 570 aa2.68□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C FCP1Q03254 732 aa2.68□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C DIB1Q06819 143 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C ZPS1Q12512 249 aa2.68□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C UTP10P42945 1769 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C YMR084WA2P2R3 262 aa2.67□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C RPS19AP07280 144 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C RPS19BP07281 144 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C KIN82P25341 720 aa2.67□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C PFF1P38244 976 aa2.67□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C SSZ1P38788 538 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C YNG2P38806 282 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C YHR202WP38887 602 aa2.67□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C THI6P41835 540 aa2.67□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C BST1P43571 1029 aa2.67□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C BIT61P47041 543 aa2.67□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C GRS2Q06817 618 aa2.67□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C CPA2P03965 1118 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C CTT1P06115 562 aa2.66□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C CIT2P08679 460 aa2.66□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C AQY1P0CD91 305 aa2.66□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C SMY1P32364 656 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C RIM4P38741 713 aa2.66□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C PIH1P38768 344 aa2.66□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C UBP12P39538 1254 aa2.66□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C SPO1P53541 631 aa2.66□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C UBP16Q02863 499 aa2.66□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C CRC1Q12289 327 aa2.66□□□□□ -1.98
GCN4YEL009C SUP35P05453 685 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C HMG1P12683 1054 aa2.65□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C SEC15P22224 910 aa2.65□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C GSY1P23337 708 aa2.65□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C GSY2P27472 705 aa2.65□□□□□ -1.99
GCN4YEL009C GCD7P32502 381 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
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