RNA–Protein interactions for RNA: YBL062W

YBL062W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YBL062W, Length 381 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YBL062W	YBL062W	ARG1	P22768	420 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YBL062W	YBL062W	GSY2	P27472	705 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YBL062W	YBL062W	PLC1	P32383	869 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YBL062W	YBL062W	CDC5	P32562	705 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YBL062W	YBL062W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YBL062W	YBL062W	YFL015C	P43578	164 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YBL062W	YBL062W	YJR120W	P47157	116 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YBL062W	YBL062W	YNR071C	P53757	342 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YBL062W	YBL062W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YBL062W	YBL062W	AFT2	Q08957	416 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YBL062W	YBL062W	URA3	P03962	267 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YBL062W	YBL062W	MRPL9	P31334	269 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YBL062W	YBL062W	SDS22	P36047	338 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YBL062W	YBL062W	YLF2	P38746	405 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YBL062W	YBL062W	EXO1	P39875	702 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YBL062W	YBL062W	YNL058C	P53947	316 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YBL062W	YBL062W	WAR1	Q03631	944 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YBL062W	YBL062W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YBL062W	YBL062W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YBL062W	YBL062W	PTP1	P25044	335 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YBL062W	YBL062W	LAS21	P40367	830 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YBL062W	YBL062W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YBL062W	YBL062W	GSM1	P42950	618 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YBL062W	YBL062W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YBL062W	YBL062W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YBL062W	YBL062W	NUP1	P20676	1076 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YBL062W	YBL062W	YIL092W	P40497	633 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YBL062W	YBL062W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	PHO3	P24031	467 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	TFC4	P33339	1025 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	TGL1	P34163	548 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	SAW1	P39735	261 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	MAM1	P40065	302 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	NET1	P47035	1189 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	YJL043W	P47053	257 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	COS12	P53053	380 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	ATP23	P53722	227 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	BSP1	Q06604	576 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	ICT1	Q12385	394 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	BEM3	P32873	1128 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	NMD5	P46970	1048 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	GLO1	P50107	326 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	FOL1	P53848	824 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.7	□□□□□ -1.66	not detected
YBL062W	YBL062W	PCL8	Q08966	492 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	TMT1	P32643	299 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	XBP1	P40489	647 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	SNO3	P43544	222 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	BST1	P43571	1029 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	IDS2	P46958	469 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	YNL092W	P53934	400 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	ENT2	Q05785	613 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	CRD1	Q07560	283 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	CIR1	P42940	261 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	SAE2	P46946	345 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	SEC5	P89102	971 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	HRD3	Q05787	833 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	YCR061W	P25639	631 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	VFA1	P40080	203 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	COG2	P53271	262 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	TRS31	Q03337	283 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	BI2	P03873	423 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	RAD33	Q04231	177 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	NUR1	Q12066	484 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	ARP7	Q12406	477 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YBL062W	YBL062W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YBL062W	YBL062W	CTT1	P06115	562 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YBL062W	YBL062W	GDA1	P32621	518 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YBL062W	YBL062W	LNP1	P38878	278 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YBL062W	YBL062W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YBL062W	YBL062W	CYK3	Q07533	885 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YBL062W	YBL062W	AAD4	Q07747	329 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YBL062W	YBL062W	LCB4	Q12246	624 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YBL062W	YBL062W	FRE7	Q12333	620 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YBL062W	YBL062W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YBL062W	YBL062W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YBL062W	YBL062W	SWD1	P39706	426 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YBL062W	YBL062W	POL31	P46957	487 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YBL062W	YBL062W	ASK10	P48361	1146 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YBL062W	YBL062W	VPS64	Q03944	604 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YBL062W	YBL062W	ADH4	P10127	382 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YBL062W	YBL062W	AMD2	P22580	549 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YBL062W	YBL062W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YBL062W	YBL062W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YBL062W	YBL062W	STB5	P38699	743 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YBL062W	YBL062W	STP1	Q00947	519 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YBL062W	YBL062W	YAP7	Q08182	245 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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