RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 PI4KBQ9UBF8 816 aa5.21□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 POLLQ9UGP5 575 aa5.21□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 PALD1Q9ULE6 856 aa5.21□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 NOP56O00567 594 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 SEMA3EO15041 775 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 REC8O95072 547 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 GTF2A2P52657 109 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 FCGRTP55899 365 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 ICA1Q05084 483 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 TRAF1Q13077 416 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 PDIA6Q15084 440 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC174Q6PII3 467 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 FCHSD1Q86WN1 690 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 MICALL1Q8N3F8 863 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 PSMD1Q99460 953 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM39BQ9GZU3 492 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 MX1P20591 662 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 USP14P54578 494 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 HMGCS2P54868 508 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 MAP3K11Q16584 847 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 BEND3Q5T5X7 828 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 EEPD1Q7L9B9 569 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 CERS3Q8IU89 383 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 TTC16Q8NEE8 873 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 GOPCQ9HD26 462 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 PLCH1Q4KWH8 1693 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 USP17L12C9JPN9 530 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 USP17L21D6R901 530 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 LIG1P18858 919 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 PRDX5P30044 214 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 SP3Q02447 781 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 CATIPQ7Z7H3 387 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 TRPM4Q8TD43 1214 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 USP44Q9H0E7 712 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 ZHX3Q9H4I2 956 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 EHMT1Q9H9B1 1298 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 USP17L5A8MUK1 530 aa5.2□□□□□ -1.58
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PTPRC-201ENST00000348564 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 ESR2Q92731 530 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 SERPINB13Q9UIV8 391 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF541Q9H0D2 1346 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 H7C1W4 665 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 BACH1O14867 736 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 LPXNO60711 386 aa5.2□□□□□ -1.58
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PTPRC-201ENST00000348564 POTEJP0CG39 1038 aa5.2□□□□□ -1.58
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PTPRC-201ENST00000348564 INHBEP58166 350 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 TNNI3KQ59H18 835 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 CHURC1Q8WUH1 139 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 GCC1Q96CN9 775 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 WDR70Q9NW82 654 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 PKD2L1Q9P0L9 805 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 GH2P01242 217 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 CALML3P27482 149 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 CEP85Q6P2H3 762 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 ERO1BQ86YB8 467 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM47Q96LD4 638 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 HTATIP2Q9BUP3 242 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 FZD1Q9UP38 647 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 VEGFBP49765 207 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 Q3C1V9 767 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD44Q8N8A2 993 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 OPTNQ96CV9 577 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 BCL2L12Q9HB09 334 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 USP17L10C9JJH3 530 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 POTEB2H3BUK9 544 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 KRT18P05783 430 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 PPP4R3AQ6IN85 833 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC34Q96HJ3 373 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 KCNQ5Q9NR82 932 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 UBN2Q6ZU65 1347 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-201ENST00000348564 KBTBD13C9JR72 458 aa5.19□□□□□ -1.58
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