RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krt40Q6IFX3 439 aa14.68□□□□□ -0.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 HelbQ6NVF4 1074 aa14.68□□□□□ -0.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CerkQ8K4Q7 531 aa14.68□□□□□ -0.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atp8b3Q6UQ17 1335 aa14.68□□□□□ -0.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ltn1Q6A009 1767 aa14.67□□□□□ -0.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Frmd7A2AD83 703 aa14.67□□□□□ -0.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klhl34A2AI76 644 aa14.67□□□□□ -0.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdk4P30285 303 aa14.67□□□□□ -0.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TfrcQ62351 763 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbxo41Q6NS60 873 aa14.67□□□□□ -0.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DymQ8CHY3 669 aa14.67□□□□□ -0.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Alg3Q8K2A8 438 aa14.67□□□□□ -0.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zbtb21E9Q444 1094 aa14.67□□□□□ -0.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Csrnp1P59054 583 aa14.67□□□□□ -0.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wdhd1P59328 1117 aa14.67□□□□□ -0.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem59lQ7TNI2 337 aa14.67□□□□□ -0.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ttc12Q8BW49 704 aa14.67□□□□□ -0.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Col4a5Q63ZW6 1691 aa14.67□□□□□ -0.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mtx1P47802 317 aa14.66□□□□□ -0.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fhdc1Q3ULZ2 1149 aa14.66□□□□□ -0.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spata5Q3UMC0 893 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CtifQ6PEE2 600 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atp1a3Q6PIC6 1013 aa14.66□□□□□ -0.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Col23a1Q8K4G2 532 aa14.66□□□□□ -0.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc39Q9D5Y1 937 aa14.66□□□□□ -0.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hmgn5Q9JL35 406 aa14.66□□□□□ -0.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Myh13B1AR69 1938 aa14.66□□□□□ -0.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kif23E9Q5G3 953 aa14.66□□□□□ -0.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kifc2O08672 792 aa14.66□□□□□ -0.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ncaph2Q8BSP2 607 aa14.66□□□□□ -0.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cfap58B2RW38 873 aa14.65□□□□□ -0.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Aox4Q3TYQ9 1336 aa14.65□□□□□ -0.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dennd3A2RT67 1274 aa14.65□□□□□ -0.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp3a59D3Z2W7 503 aa14.65□□□□□ -0.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prom2Q3UUY6 835 aa14.65□□□□□ -0.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hook1Q8BIL5 728 aa14.65□□□□□ -0.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rufy2Q8R4C2 606 aa14.65□□□□□ -0.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hnrnpul1Q8VDM6 859 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Odf2lQ9D478 642 aa14.65□□□□□ -0.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 1700018B08RikQ9DA83 213 aa14.65□□□□□ -0.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrpl12Q9DB15 201 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf326O88291 580 aa14.65□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Terf1P70371 421 aa14.65□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 BrapQ99MP8 591 aa14.65□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adamtsl1Q8BLI0 1745 aa14.64□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Heg1E9Q7X6 1337 aa14.64□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbxl16A2RT62 479 aa14.64□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hap1O35668 628 aa14.64□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zhx1P70121 873 aa14.64□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mum1l1Q4VA55 681 aa14.64□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 9230110C19RikQ8CC70 267 aa14.64□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrrc2Q8VDB8 371 aa14.64□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cxcl11Q9JHH5 100 aa14.64□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prdm11A2AGX3 565 aa14.64□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Frat1P70339 274 aa14.64□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adgra3Q7TT36 1310 aa14.63□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arfgef1G3X9K3 1846 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pde6aP27664 859 aa14.63□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atp6v1aP50516 617 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ube2oQ6ZPJ3 1288 aa14.63□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Myo3bQ1EG27 1305 aa14.63□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zscan29E9Q5B4 869 aa14.63□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pde11aP0C1Q2 933 aa14.63□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ezh2Q61188 746 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrrc8aQ80WG5 810 aa14.63□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dnaaf2Q8BPI1 814 aa14.63□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Myl6bQ8CI43 207 aa14.63□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krt84Q99M73 603 aa14.63□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dusp10Q9ESS0 483 aa14.63□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Suclg2Q9Z2I8 433 aa14.63□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm3893E9Q1I1 302 aa14.62□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp26a1O55127 497 aa14.62□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc174Q3U155 467 aa14.62□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Limch1Q3UH68 1057 aa14.62□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 R3hcc1Q8BSI6 488 aa14.62□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcdhb22Q91XZ8 794 aa14.62□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rgs17Q9QZB0 210 aa14.62□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atp2b1G5E829 1220 aa14.62□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Me1P06801 572 aa14.62□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CebpaP53566 359 aa14.62□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Skor1Q8BX46 964 aa14.62□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rbbp6P97868 1790 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 FAM186AQ9D9R9 1790 aa14.62□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dync1i1O88485 628 aa14.61□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spg7Q3ULF4 781 aa14.61□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cep135Q6P5D4 1140 aa14.61□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Golph3lQ8R088 285 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kcnk13Q8R1P5 405 aa14.61□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MlphQ91V27 590 aa14.61□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gtf2iQ9ESZ8 998 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stag1Q9D3E6 1258 aa14.61□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rgs9O54828 675 aa14.6□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Myl3P09542 204 aa14.6□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcsk7Q61139 770 aa14.6□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp397Q7TNK4 527 aa14.6□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Snw1Q9CSN1 536 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Jag1Q9QXX0 1218 aa14.6□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sned1Q70E20 1403 aa14.6□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nmt2O70311 529 aa14.6□□□□□ -0.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gnat2P50149 354 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 278.4 ms