Protein–RNA interactions for Protein: P47802

Mtx1, Metaxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtx1P47802 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43.68■■■■■ 4.58
Mtx1P47802 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Mtx1P47802 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Mtx1P47802 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Mtx1P47802 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Mtx1P47802 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
Mtx1P47802 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
Mtx1P47802 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
Mtx1P47802 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
Mtx1P47802 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Mtx1P47802 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Mtx1P47802 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Mtx1P47802 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
Mtx1P47802 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
Mtx1P47802 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
Mtx1P47802 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Mtx1P47802 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Mtx1P47802 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Mtx1P47802 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Mtx1P47802 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Mtx1P47802 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Mtx1P47802 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Mtx1P47802 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Mtx1P47802 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Mtx1P47802 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Mtx1P47802 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Mtx1P47802 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Mtx1P47802 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Mtx1P47802 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Mtx1P47802 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Mtx1P47802 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Mtx1P47802 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Mtx1P47802 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
Mtx1P47802 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Mtx1P47802 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Mtx1P47802 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Mtx1P47802 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Mtx1P47802 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Mtx1P47802 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Mtx1P47802 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Mtx1P47802 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Mtx1P47802 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Mtx1P47802 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Mtx1P47802 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Mtx1P47802 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Mtx1P47802 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
Mtx1P47802 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Mtx1P47802 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Mtx1P47802 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Mtx1P47802 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Mtx1P47802 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Mtx1P47802 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Mtx1P47802 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Mtx1P47802 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Mtx1P47802 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Mtx1P47802 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Mtx1P47802 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Mtx1P47802 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Mtx1P47802 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Mtx1P47802 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
Mtx1P47802 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Mtx1P47802 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Mtx1P47802 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Mtx1P47802 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Mtx1P47802 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Mtx1P47802 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Mtx1P47802 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Mtx1P47802 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Mtx1P47802 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Mtx1P47802 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Mtx1P47802 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Mtx1P47802 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Mtx1P47802 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Mtx1P47802 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Mtx1P47802 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Mtx1P47802 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Mtx1P47802 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Mtx1P47802 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Mtx1P47802 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Mtx1P47802 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Mtx1P47802 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Mtx1P47802 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Mtx1P47802 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Mtx1P47802 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Mtx1P47802 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Mtx1P47802 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Mtx1P47802 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Mtx1P47802 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Mtx1P47802 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Mtx1P47802 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Mtx1P47802 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Mtx1P47802 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Mtx1P47802 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Mtx1P47802 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Mtx1P47802 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Mtx1P47802 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Mtx1P47802 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Mtx1P47802 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Mtx1P47802 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Mtx1P47802 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms